龙己是一个独居的高中生，某日，意外的搭救了一个倒在河边的美少年，原来这位名叫若狭的年轻男子，竟是只“人鱼”。在阴错阳差之下，若狭就这样住进了龙己的浴室，两人之间非比寻常的生活就此展开序幕。

长久以来，龙己（岛崎信长 配音）都过着独自一人的生活，表面看来，龙己性格冷淡不近人情，但实际上，他十分擅长料理家务，并且拥有一颗柔软的心灵。从某一日开始，龙己再也不是一个人了，而多出来的那一个“陪伴者”，竟然是寄宿在他家浴缸里的人鱼若狭（梅原裕一郎 配音）。

悲观又近视的贝壳真木（津田健次郎 配音）、不请自来的水母三国（花江夏树 配音）、心灵手巧的章鱼鹰巢（铃木达央 配音）、表里不一的鲨鱼安贺里，自从龙己出现后，这些稀奇古怪的海洋生物亦开始接二连三的出现在龙己的生活中。而在此过程中，龙己和若狭的关系似乎变得越来越亲近起来。

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故事设定在第二次世界大战后，日本的国家主权受制于美国。90年代中期。日本首都制药公司在大脑机能领域开发出了新药。新进和平塾得知后开始推行雅典娜计划。共聚集了26个小于5岁的孩子，人工培养出类学者症候群。但药物严重的副作用导致孩子相继死亡，最终计划以失败告终。在这些孩子中NINE和TWELVE一起逃出了试验基地，而未曾逃走但幸存下来的FIVE则秘密被美国政府收留。

长大后NINE和TWELVE于某日在青森县的核废料处理设施中合同抢走了秘密开发的雏形原子弹，之后他们二人以斯芬克斯的代号针对参与了雅典娜计划的政府官员进行复仇。于是他们成功地炸毁了东京都厅的部分建筑，以此向社会引起警示。

半年后，暑假即将开始前的夏日里，先前不明身份的两人化名为九重新(其中九代表9)的9与久见冬二(日语中“冬”与10读音相同，二则指2)的12以转校生的名义来到一所高中，但不久又离开，期间他们在一栋大楼制造了恐怖袭击事件，并以此为某一计划的开始。之后两人开始以斯宾克斯(スピンクス)为名，在城市制造炸弹袭击事件(并未伤及人员)向他们所憎恨的已终止进行的“雅典娜计划”的策划者及执行者复仇，为此展开了与日本警视厅(特别是柴崎健次郎)的对战。

雅典娜计划(アテネ计画)

在90年代中期，专门从事脑机能研究的日本首都制药公司偶然开发出一种新药，成为一切的开端。新进平和塾看中他们的研究成果，于是就策划出“雅典娜计划”，毫无保留地投放大量研究费用和最优秀的人才。该计划成立的最终目标就是要用人工的方法，培育出一群有近似学者症候群的小朋友，换句话说就是他们想制造出一群人工天才。

不过那种新药不是对所有人都有效，只是对在成长期，即是五岁以下的小朋友才有效。因此主导这个计划的团体-新进平和塾，便为全国五岁以下的孤儿进行智能测试，将通过测试的小朋友召集回来。最后一共集合了26个小孩进行计划，他们全都是白老鼠。他们把那个地方称为“租界”，在那里进行实验。那里的小孩全都没有名字，因为是用实验号码来称呼他们。

不仅如此，新药的药效不是普通人的肉体和精神能够轻易承受。很多实验体的身体支持不了，又或是精神上出现严重问题，结果大部分都受不住而死掉。到最后，雅典娜计划以失败告终。

美国政府发现了这计划后随之介入，于是计划被迫于7年前被迫终止。实验结束之后，只Five存活下来，被美国机构接收，NINE和TWELVE则8年前(计划终止前一年)于“租界”放火，破坏保安系统，并且翻墙逃出。

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故事主要讲述了主人公四之宫京夜与他所属的活动内容不明的GJ部的部员们——有着好强性格的部长天使真央、游戏天才皇紫音、性格我行我素的天使惠、身材丰满的绮罗罗·伯恩斯坦以及之后的新入部员神无月环交织而成的“日常痛苦喜剧”。

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