在遥远的神话时代，人类私欲膨胀，相互残杀，人世间血雨腥风，哀鸿遍野。人类仇恨的力量创造了妖邪界及其魔王霸主阿罗醐，阿罗醐的出现是人类的命运更加黯淡无光。这时，身穿金色铠甲的勇士迦雄须出现，打败了阿罗醐，还世界以光明。然阿罗醐虽死，其聚集了邪念铠甲却还留存世间。为了抑制住邪恶的力量，迦雄须用“仁、义、礼、智、信、忠、孝、悌、忍”九种人类精神将其封印。

一千年倏忽而去，公元1988年，妖邪帝王之城阿罗醐城出现东京上空，黑暗再次降临。就在人类世界危在旦夕之时，五位身穿铠甲救世主挺身而出……

手冢治虫在1970年代所连载的《怪医黑杰克》堪称医疗漫画的顶尖之作。作中主角间黑男(即后来的黑杰克)是为了什么而开始无照行医、成为收取天价医疗费的密医呢?

1968年代，以医学院所推动的废止实习制运动为开端，社会上发起了大规模的学生运动，在这样的背景之下，黑杰克(间黑男)的医学生时代不为人知的过去即将揭露。