故事开始，一名小女孩和小时的浦岛景太郎(故事男主角，以下称“景太郎”)结下约定：
“ 你知道吗?听说相爱的两个人如果能一起进东大，他们就能获得“幸福”哦……所以，在我们两个长大以后，就两个人一起进入东大去读书吧。 ”
接着小女孩便和景太郎分开，音讯全无。自此之后，景太郎从未获得女孩青睐。这种情况，直到他19岁的时候，才开始有所转变。
此时的景太郎为了要遵守小时候的约定，已经报考东京大学(即东大)两次，却因为全国知名的东京大学要求甚高，考试分数远远不及以致失败而回。但是景太郎还是决心要履行约定，第三次报考东大。家人反对他的行为，因此令景太郎离家出走，来到祖母在东京都开设的旅馆雏田庄。然而景太郎并不知道旅馆已变成“男人止步的女生宿舍”，更对露天温泉是女性专用一事毫不知情，在浸浴期间与一丝不挂的成濑川奈留(故事女主角，以下称“奈留”)相遇。在奈留大呼求救之际，景太郎被迫逃跑;却引来一众女性住客的追逐并把自己迫至走投无路。虽然如此，景太郎还是一心打算留在雏田庄，在经历更多的波折之后，终于以管理员的身份安定下来。
在住进充满女生气息的雏田庄之后，景太郎的人生开始了转变。同一时间，约定之人的真相也慢慢揭开。故事就是围绕着景太郎能否进入东大、完成约定的主题而展开。
浦岛景太郎为了要履行约定而多次报考东京大学，故事便是依着他的经历一路发展下去。在第三次报考失败和第四次考试误以为失败的时候，景太郎均有放弃报考东京大学之念头，然而最后他还是决定要继续追寻东大。虽然在景太郎以为第四次报考也是失败的时候，萌生了对考古的兴趣，有意以发掘古物来代替报考东京大学，但是后来景太郎得知考试成功，发掘古物的志向还是被“在东京大学读书”的想法暂时取代。故事最后，景太郎成为了考古学家，最终达成两个愿望。
另外，故事也围绕“景太郎能否完成约定、得到和约定之人一起的幸福”这个主线发展。在景太郎离家出走、重临小时入住并结下约定的雏田庄的同时，他也为履行约定而努力着。一来景太郎在学业上努力以求考入东大，二来景太郎也希望找回小时候约定的对象。然而成濑川奈留的出现、双方渐渐的相恋以及景太郎对约定之人的不确定都影响了景太郎的想法，希望在一起的对象由约定之人渐渐变为奈留。但是乙姬睦美的出现曾一度使景太郎以为她就是小时候的约定对象，让本来坚持“和奈留一起得到幸福”的景太郎在两个人之间摇摆不定。后来约定之人的谜团渐渐解开，约定之人原来景太郎、奈留和睦美一起，终于坚定了景太郎和奈留一起的决心，确定了故事的结局。
作品风格
浪漫爱情
作者在构思故事之时已经有创造一部爱情喜剧的打算，而事实上，某些场面有被认为是受到著名浪漫爱情电影如“泰坦尼克号”、“乱世佳人”的影响。
有趣的元素
除了作者的构思预示了故事包含有趣的元素之外，故事的情节也印证了这一点。第1话景太郎意外地与奈留全裸相遇、被误会成色狼以致要逃跑一事，就被认为是爱情喜剧“最常用的手法之一”。此外，故事不乏一些引人发笑的对话，或是景太郎被别人击倒等有趣的情节。
大量女性角色
漫画连载初期已有五名女性角色出现，数目在后来还不断增加;相比之下，只有主角浦岛景太郎的出场次数较为频繁，其余男性角色的出场次数甚少。
引起性幻想的情节
故事不乏一些女性走光、半裸甚至是全裸的情节，容易引起男性性幻想。而有一些对白也容易使人联想到性爱方面，例如动画第8集景太郎说“和奈留合体”，足以使人联想到男女之间的相拥、继而是进一步的性幻想。
1998年，本应在90年代初结束的冷战因为种种原因而没有结束，这是一个铁幕依然存在的时代，美苏两个超级大国仍然在明争暗斗，世界依然被铁幕分成东西两大阵营，大国间虽然没有进行大规模的军事行动，但是各个小国间的战争和冲突依然不断发生，而各国的情报人员也进行着残酷的间谍战，而原本应被装甲车和战斗直升机支配的战场因强袭机兵“Arm Slave”的出现而发生很大的变化。
幼年遭遇飞机事故，因而在阿富汗长大的男主角相良宗介中士是神秘的国际组织秘银特殊部队成员，专门在世界各地即将发生战争或武装冲突的地区执行组织下达的秘密任务，对抗恐怖份子，缓救人质，化解各式各样危机。
而宗介最新的任务要尽快前往日本，任务内容为伪装成高中生潜入都立阵代高校，去保护一位16岁的女高中生千鸟要。这位少女似乎和普通的女高中生没有什么两样，但不知什么原因却成为各国间谍秘密争夺的目标。为了保护千鸟，宗介驾驶着80年代末才在战场中出现的新式兵器--强袭机兵“Arm Slave”与其他神秘组织对峙。
故事发生在日本虚构城市“友枝市”。木之本樱某天将父亲的古书籍打开，意外把封印在书中的卡牌释出。它们是由魔法师库洛·里多创造的称之为“库洛牌”的魔法卡牌，每张卡牌都有不同的能力和自我意识，卡牌的随意行动能够对世界造成灾难。为了防止灾难发生，樱受封印书之守护者“可洛贝洛斯”的委托下，将四散的卡牌回收至书中。卡牌在成功回收后，樱也能将卡牌的能力解放给自身使用，以方便回收下一张卡牌。
回收卡牌不久后，来了一位转校生，他是库洛·里多的母亲家族“李家”的后人——李小狼。李小狼在得知库洛牌的封印解除后，便来到日本打算回收卡牌。起初李小狼认为木之本樱无法胜任卡牌回收，故常和木之本樱争夺卡牌回收，但最后认同木之本樱回收卡牌的能力。在所有卡牌回收并写上名字后，封印书之另一守护者“月”便会进行审判，判断持有卡牌之人是否能成为卡牌的新主人。木之本樱在审判中改变原有的封印杖，创造出星封印杖，最终通过了审判者月的审判。
在通过审判后的第二学期，班中转入一位从英国来的留学生——柊泽艾力欧。与此同时，木之本樱所持有的库洛封印书变成为樱封印书，以及木之本樱受到不明的攻击。在应对攻击时，却发现审判过程中转变而成的星封印杖与库洛牌无法使用，而令木之本樱、守护者与大道寺知世遭遇危险，最后木之本樱使用新魔法阵并将库洛牌转变成樱之卡，解决当前危险。