中学生二海堂 昶与一个自称白银的神秘男子相遇后，被卷入shin的纷争中，生活从此彻底改变了。

每集列表

《ZEXAL》的故事发生在近未来都市“心之地市”，而《ZEXALII》里则转往两个更高次元的世界：“星光界”和“巴利安世界”(又译异晶人世界，下同)。在心之地市盛行AR决斗(AR·デュエル)，AR意为扩增实境，在规则和一般站立式决斗无异。决斗者需使用“D视镜(D・ゲイザー)”和“D面板(D・パッド，D Pad)”进行决斗，这些装备只用于提升作中角色视角的视觉效果。《ZEXAL》的主流召唤方式是超量召唤(エクシーズ召喚)，借由将两个以上的怪兽“叠放”而召唤超量怪兽入场，在超量怪兽中有100张“编号怪兽”，是主角欲搜集的目标。

中学生九十九游马与学校头号不良少年神代凌牙决斗，而这场决斗改变游马的命运。于该决斗中，出现在九十九游马梦里的诡异大门突然出现，并由九十九游马利用挂坠打开。大门散发出无数光芒，站著九十九游马身旁的是从异世界来的神秘生命体阿斯特拉尔，为取回阿斯特拉尔失去的记忆，需要拿回99张编号怪兽，因此九十九游马及阿斯特拉尔两人开始一起行动。

阿斯特拉尔出现真正目的是什么?新的怪兽“编号怪兽”的存在到底是何方神圣?面对持续出现在游马面前的强力劲敌，阿斯特拉尔身上的谜团也逐渐明朗。而本作就是讲述这搭挡缔造的新决斗传说。

瘦弱的高校一年级学生—小早川濑那，因时常跑腿而有惊人的速度，因此被“泥门恶魔蝙蝠队”队长蛭魔强迫拉拢入队，充当着神秘的“光速跑者21号”。小早川濑那加入泥门高校的美式足球社后，目标是与泥门恶魔蝙蝠队的队友们一起打入“圣诞节大赛”，之后则是与日本各地明星球员组成日本代表队一起迈向“美式足球青年世界杯大赛”，打倒美式足球的起源国——美利坚合众国。