闪电十一人
第一季—明日之星足球大赛篇
故事一开始，主角圆堂守就读于雷门中学，一开始雷门是一个很弱的足球学校，非常热爱足球的圆堂创立足球社。但是由于社员人数严重不足加上帝国学园也向雷门提出友谊赛的 情况。圆堂辛苦的招募球员终于找齐十一个人，开始和帝国学园比赛。于是由于雷门中学的兴起，雷门中学决定进军“明日之星足球大赛”。经过一番的特训与决斗，雷门终于打败拥 有神之水的世宇子国中得到全国冠军。
第二季—威胁的侵略者篇
雷门足球队获得全国冠军后，一颗黑色的足球摧毁雷门中学。这是自称外星学园的人们的战帖。然而，雷门开始和外星学园战斗，一开始是先和由雷杰带领的“双子星风暴”战斗 ，经过了多次挑战，终于打败双子星风暴，但是，接下来等著圆堂等人的是第一层级的极限零度、最终层级的太阳火焰和钻石冰晶，还有最后的创世纪。圆堂等人为了阻止外星学园到 日本各地寻找高手组成最强的足球队跟外星学园展开交战。
第三季—迈向世界的挑战篇
打败外星学园的雷门中学在某日突然号召全日本最强足球选手，圆堂、风丸、鬼道、豪炎寺、吹雪、浩人(外星学园最终层级队伍-创世纪的前任队长- 古兰)、染冈、栗松、土方、绿川(外星学园队伍-双子星风暴前任队长-雷杰)、目金、纲海、立向居、木暮、壁山、武方胜等皆有受邀参予国家代表选手选拔比赛，还有新的队员 有受邀，飞鹰征矢、宇都宫虎丸、不动明王(真·帝国学园前任队长)。比赛规则是：二十二人分为两组，一组由十一个人比赛，而且不可使用团体必杀技(两人以上所组成的招式) 。入选的有：圆堂守、风丸一郎太、鬼道有人、豪炎寺修也、基山浩人、栗松铁平(后来因为脚伤回日本修养，吹雪回归闪电日本)、土方雷电、绿川龙次(后来由佐久间代替上场) 、吹雪士郎(后来因为脚伤在日本修养，由染冈代替)、纲海条介、立向居勇气、木暮夕弥、壁山塀吾郎、飞鹰征矢、宇都宫虎丸、不动明王，共计十六个人创立“闪电日本队”(I nazuma Japan)。之后“闪电日本队”以日本代国家表队跟世界各国的代表队进行竞赛，经过不少的挫折与挑战后终于获得世界冠军。
闪电十一人GO
第一季—第五院篇
前作主角圆堂守所率领的日本代表队“闪电日本队”在FFI(Football Frontier International)世界大赛获得优胜的10年后，一位最喜 欢足球的少年松风天马因为憧憬圆堂等人的闪电十一人，于是进入雷门中学加入雷门足球队。不过那时受到社会高度评价而且人材辈出的足球队却已经消失，而让足球完全腐败。不知 为何全国足球被叫作“第五院”的组织所控制，如果不依照他们的指示踢球就不能比赛。而“第五院”的种子选手剑城京介只以一人之力就将整个雷门足球队打得遍体鳞伤。于是他们 为了找回十年前的足球精神，新雷门十一人们将要和成为雷门足球队教练的圆堂一起共同奋战……
第二季—时空之石篇
在神圣之路(HOLY ROAD)的决赛完结之后，天马某日回到雷门中学却发现虽然是同样的学校但足球社不存在，足球部的队员都说他们从未踢过足球。此时信助劝天马加 入别的部社，面对像平行世界般的现象，天马觉得非常困惑。在这个时候一个神秘的少年阿尔法(アルファ)出现在天马面前，并要从天马夺去足球。在与阿尔法(アルファ)争夺足 球的期间，天马误入一个奇怪的空间之中，在那里，天马看到的是没有足球的世界，并且中学时代的圆堂与剑城优一一同来到未来，面对著未知且强大的敌人，天马等人要将如何应付 ……
第三季—银河篇
时空之石事件之后，在神圣之路大赛足球场即将举办全新日本闪电十一人选拔，在获选的选手中，除了天马、剑城以及神童外，全是其他学校从没碰过足球的新手!?他们要如何 整顿球队迎接世界的挑战呢?
闪电十一人 阿瑞斯的天秤
第一季—阿瑞斯的天秤篇
时间线坐落在第一部作品后的平行世界。雷门中学足球队在Football Frontier大赛中取得优胜，外星学园并未出现及袭击雷门中学，FFI世界赛未登场，雷 门于亲善纪念赛对上西班牙少年联盟冠军队伍，以0比13惨败，雷门众人感受到不同次元的强大，为了未来的世界赛，与逼出寄宿著神秘力量的存在和强化全国少年足球总体实力， 雷门Football Frontier大赛的夺冠成员全员以强化委员之名义，被分散到各地的国中，此平行世界的中学足球队必须有赞助商才能营运足球队。之后，在伊那国岛 有一群热爱足球的中学生，因为伊那国中学的校长觉得伊那国岛无法继续追随足球的热潮加上毫无经费请赞助商，从而废止足球部。突然有个神秘赞助商表示，要是他们转入雷门并且 赢过一场的话，就提供伊那国赞助。主人公们认为这是他们最后的机会。为了证明他们对足球的热忱，决定前往东京入读雷门中学参加比赛。作品剧情将从三位主要角色稻森明日人、 灰崎凌兵、野坂悠马的视角个别展开，故事将围绕著阿瑞斯天秤的力量而出发。
第二季—猎户座的刻印篇
飞向世界!最强的十一人开始!最后“迈向世界的大门”开启了!足球日本代表“闪电日本”终于宣布了! 其中包括稻森明日人，灰崎凌兵，野坂悠马。 来自不同学校的菁英选手聚集在一起。 此外还增加了一个与海外日本籍选手一起比赛的新手“一星充”，现在国家足球队日本代通往世界的船将驶向大海了。然而等待著是远远超过他们预期的试炼。 神秘的组织“猎户座的使徒”，策略，背叛，冲突---。 大家期待的世界足球大赛FFI(国际级水平明日之星足球大赛)现在开始。闪电日本!飞向世界!
闪电十一人 英雄们的伟大之路
原预计在 2018 年发售的《闪电十一人》系列最新作《闪电十一人 阿瑞斯的天秤》，经过多次延期后原预计在 2019 年内发售，如今宣布再度延期至 2023 年发售，并同时将本作更名为《闪电十一人 英雄们的伟大之路(イナズマイレブン 英雄たちのグレートロード)》。
Level-5 表示，因游戏在开发过程中遇上数个问题，导致本作在还没发售动画就已经先播完的情况，对此感到非常抱歉。同时表示，原先除了本社之外还委托了外部公司 一同协助开发本作，但今后为了追求更好的游戏品质，决定改由社内自行开发。
也因此，本作将由原先标题《闪电十一人 阿瑞斯的天秤》改名为《闪电十一人 英雄们的伟大之路》，除了原本以《闪电十一人 阿瑞斯的天秤》为基础设计的内容之外，还会另外新增篇章，让过去角色在本作中登场。
序
某天，地底墓地的底部，伴随着一次地震坍方，一位枯瘦如柴的老人从深处步出。这位长者自称是千年前灭亡的古老帝国—黄金之国国王;那曾经繁华的国家，遭到疯狂的魔法师封锁于地底，至今仍不见天日。
“谁能击败那位魔法师，我会将一切赠与给他”，说完这句话的老人随即化作尘埃、随风而逝。一场由冒险者们谱出的迷宫冒险于焉展开。
本篇
主角莱欧斯所领导的队伍(公会)在遭遇炎龙的战斗中原先有把握可以打倒那头巨兽;不过由于先前探索的种种失误下消耗为数相当的粮食，空腹迎击的勇者们遭遇了灭团危机。妹妹法琳为了拯救哥哥而被炎龙吞食，被咽下前使用了传送魔法将自己以外的公会成员送到迷宫外。由于行李、钱财都遗留在迷宫中，又有成员因被其他公会挖角而辞职脱团，使得身无分文的他们整装重返迷宫、拯救未被消化完毕的妹妹这项任务难上加难。因此莱欧斯想到了既经济且有效率的方法：靠着吃迷宫中的魔物自给自足。
故事发生在建立于日都岛(日都ヶ島)的小镇之上，男主角网代慎平由于青梅竹马小舟潮的逝世而重回故地，却卷入了牵涉到日都岛一个古老传说的重大事变中，并开始尝试和同伴们一道阻止即将到来的灾祸。
故事发生地的原型为友岛(友ヶ岛)，位于纪淡海峡，与淡路岛隔海相望，现实中是无人岛群，直到二战结束前都是军事要地，禁止一般人进入，颇具神秘色彩。
故事设定
“影子”为本作的虚构生物，能够复制其他人类、生物，甚至死物的讯息，并借此构成自己的外观。影子的设定随着剧情发展而慢慢揭露。在故事开首，提及日都岛的传说相传“见到自己的另一个(影子)不久就会死去”。
影子能够通过对人或物发出闪光照射来获得目标人类或物件的全部信息(包括肉体遗传信息、记忆、人格等)，然后生成类似投影的立体物。影子的本体是平面，受伤害后不能自行恢复，需要重新照射原件来重新获得信息修复;而立体身体受伤害后可自行恢复。立体的人体能潜入影子本体中来快速移动，但身体就会无法呼吸。影子本体讨厌被碰触，而成为慎平等人判断的方法。影子本体被钉固定就能限制其行动。影子本体受到对应人体的致命伤害则可以被消灭。影子的数据会慢慢消失，需要将复制的本体弄死后侵蚀消去才能永远存在，本体被消去的表面会留有黑印;对于物品也是同样，否则复制出来的物品无法使用。影子可以使用自身的一部分复制出其所掌握数据的实物。影子复制其他数据过多会劣化，失去拟态的能力，成为野生影子，退居野林。被影子复制过的本体，在其对应的影子被消灭后，就不能再被复制。影子复制的信息能被带到慎平的每次轮回中。除了影子波稻能多次复制出子代影子外，其他影子只能复制子代一次。
慎平曾在一次轮回中推断认为这是来自地球外的陨石带来物，然后通过复制海底生物为生，直到1732年(享保十七年)复制成鲸鱼而被冲上日都岛岸边，复制了渔民的女儿雁切波稻，再将全岛居民变成影子后度过饥荒，并设立蛭子神来供奉。最终目的似乎是2018年7月24日祭典上将岛上全部人侵蚀，菱形青铜后来交代是为了让影子波稻回到自己的故乡。