平凡的高中生芦屋花绘，妖怪附身后，在保健室里遇见了两坪大的茶室“妖怪庵”之主——安倍晴斋，并且经由驱妖的契机，成为了奉公人的芦屋，开始了协助驱妖并且偿还债务的生活。

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第一代

女王之刃，四年举办一次，决定国家女王拼死相向的比武大会。遵从建国起的传统，由最强的女性来支配这个国家。只要12岁以上的女性，即便是异国的人，或者不是人类而是有知性的生物也能被认可参赛。

没有规则的竞技大会。要赌上自己的性命使用自己擅长的武器或必杀技来比赛。不到一方放弃或无法行动，就无法分出胜负。天使会用魔法在全国各地产生水晶球，战斗的盛况将透过水晶球转播到全国各地。

民众们也能观赏战况。参加女王之刃的女性斗士们，等待着她们的命运是女王的宝座，是败北的屈辱，还是死亡？

第二代—叛乱

四年举办一次，决定国家女王的比武大会女王之刃第三十回的比赛终结了。

前女王逢魔的女王 阿尔多拉败北。坐上王位的新女王是雷云之将 库洛德。

库洛德为王国带来了前所未有的繁荣，但一年后库洛德宣布废止Queen's Blade永久即位，并且四处征讨反对阵营。于是风起云涌的叛乱行动展开了。

在年号“平成”二十几年21世纪的日本，延续著由江户时代开始的德川幕府，第25代将军德川庆康统治的盛世日本。而距离首都百公里的圣峰富士山山麓之上建立的巨大学园“武应学园”。在由德川家组成的学生会，执行对反抗的丰臣派的“丰臣狩猎”，在学园中掀起的巨大风暴。

就读“武应学园”亦身为柳生道场代理教练职务的柳生宗朗，对学生会的“丰臣狩猎”行动抱持疑惑，在道场中独自进行练习时，一名全身赤裸带着大小两把日本刀的少女穿过道场屋顶从天而降， 少女自称柳生十兵卫三严，并且使用华丽的剑术，击退带领风纪委员会来犯的服部半藏。之后一群拥有历史上有名武将之名的少女们也相继出现在宗朗面前……

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