大海中一只小金鱼偷偷离开她的家，乘着水母来到外界的世界，却不慎卡在海洋垃圾里的玻璃罐内，这时救了她的是一个小男孩“宗介”。
宗介将金鱼救出后把她取名为“波妞”，并决心要保护她。喜欢上宗介的波妞，开始想要变成人类。
海神的女儿波妞从深海出逃玩耍，却被困在玻璃瓶里冲到岸上，碰巧被住在岸边悬崖的宗介救出，两人因此相识。但是波妞的父亲——魔法师藤本，认为人类世界肮脏丑陋，强行把波妞带回海里。面对父亲的阻挠、席卷小镇的海啸，以及永远失去魔法的威胁，波妞仍然大胆而坚决地决定——要变成人类跟宗介在一起。而承诺要永远保护波妞的宗介，也即将面临新的挑战...
故事
长篇
本篇由《渴望死亡的小丑》到《迈向神境的作家 下》共8册构成（2006年5月-2009年8月）。
虽然是各集数所表现的“情绪”独特主题，但是后面的故事多少会从前面取材，以下先列出第一次出现的情感主题，另外第五集《绝望恸哭的信徒》算是大杂绘。
《渴望死亡的小丑》：表里不一的性格、多虑的哀愁、隐藏内心的面具
《渴求真爱的幽灵》：激烈而直接的情绪表现、家族内斗、占有欲
《沉陷过往的愚者》：三角恋情、对过往的遗憾、补偿、同伴、释怀
《背负污名的天使》：追求梦想不成的怨恨、自责、表为美意实为错误的保护、一体两面
《绝望恸哭的信徒》：一厢情愿、欺骗、背叛
《怀抱花月的水妖》：家族权势、家族压力、压力下追求的真情
《迈向神境的作家》：事分表里、小说与现实上的差异、与对创作执著的差异
短篇《爱恋插话集》系列
短篇《爱恋插话集》共分4册，补完长篇、外传出场人物在“第一人称”视点外的故事，也延伸了主要人物的后续发展。
外传《见习生》系列
外传《见习生》系列是新一代的文学少女日坂菜乃与文艺社社长井上心叶的故事，以日坂菜乃第一人称进行。主要出场人物皆无异动，时序位于长篇一年之后，共有《文学少女 见习生的初恋》、《文学少女 见习生的伤心》、《文学少女 见习生的毕业》3册。
外传《青涩作家和文学少女编辑》
外传《青涩作家和文学少女编辑》叙述长篇结束8年后，成为出版社编辑的天野远子和作家井上心叶（准）夫妻的生活，以天野专责的青涩作家雀宫快斗第一人称进行。本书全1册完结，是文少系列的正式结局。
剧中虚构作品
小说
《悖德之门》（作者：樱井叶子）
《宛如晴空》（作者：井上美羽）
《文学少女》（作者：井上美羽）
《放学后，油菜花与我》（作者：井上美羽）
《天使堕落之声》（作者：井上美羽）
《唯的日常生活》（作者：樱井叶子）
《奔向明日与你相会》（作者：井上美羽）
《硬派高中生业平》（作者：雀宫快斗）
绯红系列（作者：早川绯砂）
《某个少年的挽歌》（作者：雀宫快斗）
《Golden Licence》（作者：早川绯砂）
图画
《天使》（作画：姬仓麻贵）
剧中时间点
| 学年／年份 | 月份／时间 | 标题 | 主要视点 | 独白 （粗字部分） |
|---|---|---|---|---|
| 远子 — 高一 | 四月 | 文学少女与门内的公主 | 姬仓麻贵 | — |
| 远子 — 高二 心叶 — 高一 |
春季 | 文学少女和恋爱的牛魔王 | 牛园琢己 | |
| 接着恋爱的牛魔王 | 文学少女和革命的劳动者 | 井上心叶 | ||
| 夏季 | “在峡谷里” | |||
| 七月，梅雨季后 | “麦子和国王” | |||
| 暑假 | 文学少女和烈火熊熊的牛魔王 | |||
| 晚秋 | 文学少女与幸福的孩子 | |||
| 文化祭 | 文学少女与忧郁的贵公子 | |||
| 第三学期 | 文学少女与麻烦的情侣 | |||
| 画室的密谈 | 麻贵 | |||
| 夕歌 — 高一 | 十一月—圣诞节前 | 伤痛的绅士和无垢的歌姬 | 水户夕歌 | |
| 果步 — 高二 | 二月 | 文学少女与多病的少女 | 今井果步 | |
| 远子 — 高二 | 情人节 | “万叶集” | 井上心叶 | |
| 七濑 — 高二 | 四月 | 七濑的恋爱日记 其一 | 琴吹七濑 | |
| 远子 — 高三 心叶 — 高二 |
五月，黄金周后 | “更级日记” | 井上心叶 | |
| 五月 | 渴望死亡的小丑 | 竹田千爱 | ||
| 七濑 — 高二 | 五月 | 七濑的恋爱日记 其二 | 琴吹七濑 | — |
| 远子 — 高三 心叶 — 高二 |
六月 | “好色五人女” | 井上心叶 | |
| 六月，期末考前后 | 渴求真爱的幽灵 | 雨宫萤／姬仓麻贵 | ||
| 暑假（八月） | 怀抱花月的水妖 | 井上心叶 | ||
| 文学少女和初陷情网的女仆 | 纱代 | — | ||
| 秋季 | “洛丽塔” | 井上心叶 | ||
| 七濑 — 高二 | 文化祭前 | 七濑的恋爱日记 其三 | 琴吹七濑 | |
| 远子 — 高三 心叶 — 高二 |
十一月、文化祭前后 | 沉陷过往的愚者 | 井上心叶 | 芥川一诗 |
| 文学少女与出轨的预言家 | 樱井流人 | — | ||
| 冬季 | “飞翔的教室” | 井上心叶 | ||
| 亮太、森 — 高二 | 十一月后半 | 文学少女和呼喊爱情的诗人 | 反町亮太 | |
| 远子 — 高三 心叶 — 高二 |
十二月初 | “银汤匙” | 井上心叶 | |
| 十二月 | 背负污名的天使 | 水户夕歌／天使 | ||
| 亮太、森 — 高二 | 十二月 | 文学少女和急待亲吻的诗人 | 反町亮太 | — |
| 远子 — 高三 心叶 — 高二 |
一月 | 绝望恸哭的信徒 | 井上心叶 | 朝仓美羽 |
| 七濑 — 高二 | 一月 | 七濑的恋爱日记 特别篇 | 琴吹七濑 | — |
| 亮太、森 — 高二 | 二月 | 文学少女和玷污名声的诗人 | 反町亮太 | |
| 远子 — 高三 心叶 — 高二 |
二月至三月 | 迈向神境的作家 | 井上心叶 | 天野结衣(天野远子) |
| 亮太、森 — 高二 | 三月 | 文学少女和献上祝福的诗人 | 反町亮太 | — |
| 远子 — 大一 | 四月；黄金周 | 特别篇“雪鹅” | 设乐 | |
| 菜乃 — 高一 心叶 — 高三 |
四月 | 见习生的初恋 | 日坂菜乃 | |
| 五月 | 见习生的殉情 | 三上 | ||
| 七月 | 见习生的伤心 | — | ||
| 一诗 — 高三 | 七月 | 沉默的王子与不良于行的人鱼 | 朝仓美羽 | |
| 远子 — 大一 | 十月 | 远子阿姑的秘密 | 樱井流人 | — |
| 菜乃 — 高一 心叶 — 高三 |
十一月 文化祭前后 |
见习生的怪物 | 日坂菜乃 | 臣志朗 |
| 美羽〜在迷惘中逐步向前 | 朝仓美羽 | — | ||
| 十二月 | 见习生的寂寞 | 日坂菜乃 | 柏木櫂 | |
| 二月至三月 | 见习生的毕业 | — | ||
| 舞花 — 国二 | 梅雨季 | 生气的女孩与柠檬男孩 | 井上舞花 | |
| 正传六年后 | 夏季 | 七濑〜打给天使的电话 | 琴吹七濑 | |
| 正传七年后 | 初夏 | 迷途的小鹿和说谎的人偶 | 仔鹿里佳 | |
| 正传七年后 | 七月 迷鹿的一个月后 |
奋斗的小鹿和胆怯的旅人 | ||
| 正传十七年后 | 初夏 | 萤〜暴风平息后的阳光〜 | 姬仓萤 | |
| 不明 | 十二月 | 未孵化的歌姬和徬徨的天使 | 新田晴音 |
那是与我们的地球相似，存在着魔力的世界。二十世纪初，突然出现的敌人“涅洛伊(异形军)”，以压倒性的武力与瘴气的污染大举入侵。人类将唯一的希望寄托在能够驱动魔力机械装置“飞行脚”和“翱翔内裤”、具有魔力的“魔女”们身上;而从世界各国齐集的她们，被称为“强袭魔女”。
小说版“索穆斯没人要中队系列”
1939年，欧洲大陆面临异形军侵略的危机，远离欧陆战场的扶桑皇国决定派遣陆海军的魔女援助欧洲。在皇国近海异形军袭击事件“扶桑海事变”中声名大噪、一跃成为国民英雄的魔女穴拭智子，十分期待自己能被派遣至卡尔斯兰。然而，就任的目的地是欧洲最北境的索穆斯，同伴尽是表现不佳、被各自祖国如同资源回收般送到这里、实力与干劲都低人一等的魔女。集结各国问题儿童、被戏称“没人要中队”的“索穆斯义勇独立飞行中队”，究竟要如何抵挡异形军的威胁?
动画版
1944年，欧洲大陆已殆半沦陷，世界各国纷纷为此筹备反攻作战计划。集结各国素质优异的年轻魔女，联合军第501统合战斗航空团“STRIKE WITCHES”就此成立。在这之中，扶桑皇国出身的宫藤芳佳，因为稀有的强大魔力潜能而被501航空团教官坂本美绪相中。尽管最初因父亲之死而相当排斥参与战争，芳佳在领悟自己的能力可以用来拯救受战火波及的人们以后，带着父亲遗留的飞行脚，加入为人类战斗的行列……