建筑系准教授犀川创平、以及同系学生西之园萌绘，为了见传说中的天才程序员真贺田四季，而一同旅行来到真贺田研究所，结果发现了穿着婚纱、两手两脚都被切断的诡异尸体，于是两人开始尝试解开密室杀人的真相。

手冢治虫在1970年代所连载的《怪医黑杰克》堪称医疗漫画的顶尖之作。作中主角间黑男(即后来的黑杰克)是为了什么而开始无照行医、成为收取天价医疗费的密医呢?

1968年代，以医学院所推动的废止实习制运动为开端，社会上发起了大规模的学生运动，在这样的背景之下，黑杰克(间黑男)的医学生时代不为人知的过去即将揭露。