时值2007年的秋天，北原春希(水岛大宙 配音)是一位就读于峰城大学附属学园的平凡高中三年级学生，为了替自己的高中生活划下完美的句号，春希加入了轻音乐同好社团。可是，惨淡的经营让这个本就默默无闻的社团几近崩溃，春希的美好愿望眼看着就要破灭。

一次偶然中，正在独自弹奏吉他的春希突然听到一段美妙的歌声，追寻着这声音，一个名叫小木曽雪菜(米泽円 配音)的女生出现在了春希的面前。雪菜是学校里的偶像人物，之后，雪菜经由春希的邀请加入了轻音部。紧接着加入的是能够弹奏一手好钢琴的女生冬马和纱(生天目仁美 配音)，和纱的叛逆和不羁人尽皆知，可即便如此，春希还是热忱地邀请了和纱“入伙”。

序章

距离学园祭还有一个月的秋日夕阳下。解散了的轻音乐同好会的最后一人——北原春希，为了自己那小小的目标，在放学后的窗边独自拨动着吉他的琴弦。而这，是两年半间一直以优等生身份度过的他，下定决心在毕业前的半年间一定要完成的，小小的冒险。那笨拙的吉他音色，与如流水般钢琴的旋律，和那风铃飘响一般的歌声重叠之时……伴随着从一个人到两个人、再到三个人的相逢之日，新生的轻音乐同好会那如梦一般，却又是在梦中也难寻踪迹的半年，开始了……

终章

2010年，与和纱离别后的第三个冬天来临了。已是峰城大学三年级学生的春希与雪菜日渐疏远，持续着既不能说是恋人也不能说是朋友的暧昧关系。和纱在遥远的欧洲继续在钢琴家之路上前进，而春希却不再弹吉他，雪菜也忘记了该如何歌唱。在春希身旁的女生不是雪菜，而变成了在文学部认识的友人和泉千晶。就在这看似平淡日常中，转折却突然降临。某一天，打工处的上司风冈麻理交给春希一个独立任务，让春希去写关于和纱的专题文章。以此为契机，春希和雪菜慢慢修复着两人的关系。而当春希的后辈杉浦小春知道了两人的事情之后，也在与春希不断发生冲突的同时，半强迫地约定帮助他们。春希和雪菜一边接受着身边多管闲事的人们的支援，一边寻找着修复关系的方法。而这，却使得两人再次陷入了纠葛之中……

最终章

2012年，终章中与雪菜复合两年之后，春希与雪菜都已经是社会人。这年的圣诞夜。春希打算借出差到法国斯特拉斯堡取材的机会，在当地著名的大教堂中向雪菜求婚。然而他在与雪菜会合之前，意外地与前来度假的和纱重逢了。深藏五年的情愫重新被唤醒后，春希没有依计划向雪菜求婚，和纱随后也决定回日本公演而重归故里。春希和她以秘密取材为由再度建立了关系。而这成为了和纱无论面临多少次的诀别，都足以唤醒她心中情愫的宝贵时光。春希就如同五年前一样，在白色相簿的季节下再次被这两份感情所折磨……

四月十日。春假在昨天结束，今天早上就是所谓的开学日。五河士道被可爱的妹妹琴里吵醒后，原本以为今天也会如同往常般度过平凡的一天;直到他遇见一名被称为“精灵”的少女，伴随着一阵突如其来的冲击波，街道就这样消失得无影无踪。在宛如陨石撞击而变成环形山的街道一隅，一名少女正站在坑洞的正中央。“你也是来杀我的吧?”摧毁世界的灾难、充满谜团的怪物、被世界否定的少女。阻止这一切的方法只有两种：歼灭或对话。身穿军服的琴里对士道说：“所以你必须与精灵约会，并且让对方迷恋上你!”新世代“Boy Meet Girls”故事，隆重登场!

精灵(精霊(せいれい))

在与这个世界相异的邻界存在着神秘的生命体。关于其产生的原因与存在的意义至今仍被谜团所包覆，并且在战斗上拥有强大的能力，而当之出现在这边的世界之际，会引起被称为空间震的大爆炸，人类便将这些引发特殊灾害的特定生命体，当成是天敌般的存在并畏惧著。

精灵的外貌性格各不相同，但共同的特点是，都具有强大的战斗能力。其战斗力来自每人独有的被称为“灵装”的力量服装，以及被称为“天使”的独有武器。小说中借用了卡巴拉(生命树)的概念，生命树的十大要素质点与精灵一一对应，精灵名字中的数字为质点编号，天使名为质点守护天使名，灵装名为质点神名。目前得知的精灵除威斯考特外皆为女性，且外表皆为年轻少女，实际年龄不明。

根据二亚所言，所有精灵原本可能皆是人类。而从澪口中证实，除十香外，其他精灵均为吸收灵魂结晶的人类。在三大“罪人”艾略特·伍德曼、艾萨克·威斯考特、艾莲·梅瑟斯的不明目的下，创造出了第一个精灵。变成精灵后，身体将不会再成长，不过被封印的精灵能够正常的成长。

空间震(空間震)

当存在于邻界的精灵现界时，会造成空间的剧烈摇晃及造成损坏的大爆炸，空间震即此一状况之统称。在爆炸中心的建筑物及地面设施都会像火山口一样被消灭殆尽，而周围也会因为爆炸的产生而蒙受损坏。最初一次空间震发生于30年前，造成了近1亿5000万人的死伤人数，被称为“欧亚大空灾”(ユーラシア大空災)，其后世界各地皆频繁发生此一现象。而在那之后的六个月──南关东大空灾之后就像平息似的，不再发生空间震。但是在5年前，在士道他们所居住的天宫地区又开使发生此一灾害。在爆炸“余震”到来以前，会发生名为“空间的地震”此一征兆现象，就如把石头丢入水中会有涟漪，涟漪就是空间震。

一般人并不清楚造成此一现象的原因，知晓此现象的仅有以对付精灵为目的的AST、SSS及DEM公司与以保护精灵为目的的〈拉塔托斯克〉Ratatosk。另外也有精灵现界但却没有发生空间震的情况，造成此一现象的依然成谜。

再者，也存在着依据精灵自身的意识所引发的空间震，当引发的空间震的规模与另一空间震相同时则可以被相抵销。

现界、消失(現界、消失(ロスト))

当平常在另一个相邻的世界休眠的精灵出现在人类世界的情况被称之为“现界”，而当精灵从人类世界返回相邻的世界实则谓之“消失”〈LOST〉。在邻界休眠的精灵由于不知名的原因被人类世界“拉扯过来”伴随着“现界”的现象引发而产生空间震，经过一定的时间后再“消失”返回邻界。发生这样的现象不仅无关精灵本身的意志，而且精灵也不知道产生的原因。而“现界”的情况又依据空间震的产生有无而划分定义为2种，其前者(有产生空间震)的情况被称之为“通常现界”，而后者则称为“静穆现界”，但同样无法得知产生现界差异的原因。

通常现界后的精灵，必定会遭遇AST的袭击。也不知是否有与此有关，在与AST有交战的状况下，与本人意志无关的“消失”现象会发生在较短的时间内，当“消失”现象产生，AST的该次精灵讨伐作战行动旋即告终。但是，也有不被AST观测到的静穆现界的精灵，一如作品中所述，能长时间内停留在人类世界。十香第一次的静穆现界发生时遭到AST的攻击，再加上被激怒之故(其深信士道已遭杀害)，而将AST逼至全员歼灭绝境，该事件最终并没有“消失”的现象。

被士道封印力量的精灵无法从人类世界“消失”返回。