七濑武是个有着灰暗过去的平凡高中生，因为某些缘故与青梅竹马五十岛胡桃假扮情侣，并过着平凡无奇的生活。
某日武在社团练习前于校舍内发现了昏倒的少女相羽六，并将她带到保健室，并在意外的情况下被六变成了魔法使，从此武和身边人们的命运开始有了改变…
用语
魔法使
魔法使有两个种类，分别是天生的和并非天生的。
本作中所有人类都拥有微量魔力。不过，魔力会随着人的成长而逐渐衰退。衰退分界线大约为25岁。到了成为成人之后，释放魔力的气孔将会关闭，就无法成为魔法使。
但如果在年幼时接受了其他人的魔法，身体中的细胞将会被活性化，气孔也会打开，于是就能够将魔力向外部释放。这就算是成为魔法使了。
联盟
由魔法师组成的组织势力。
在所有联盟中，现有七个势力最庞大的联盟，合称“七大联盟（Communities Seven，C7）”。
C7
巫师气息（ウイザードブレス，Wizard Breath）相羽六、相羽十所属的联盟，历史是最古老的魔法组织，也是运营昴魔法学院的最大组织，以人类与魔法使和平共存为宗旨。在C7中是对亡灵引路人抱持最大敌意的联盟。
但其光鲜亮丽的背后，却隐藏着在漫长历史中对于异己者予以迫害的事实。在第二次魔法大战期间，六位评议员中有五人遭到凤凰财团的地下成员联合亡灵引路人诛杀；战后，其不为人知的黑历史被亡灵引路人残党和凤凰财团等中立的联盟所揭发，使包含相羽六、四条桃花等人在内的许多魔法师退出该联盟。
月蚀（エクリプス，Eclipse）
第二次魔法大战爆发以后，与巫师气息为联合阵线，昴魔法学院遇袭期间对抗亡灵引路人。
奥兹会（クラブ?ァ『，Club Oz）
在C7的会议中常被批评是投机主义者。
古代赤龙（エンシェント?ペンドラゴン，Ancient Pendragon）只允许魔法贵族加入的联盟。
在C7之中是属于比较温和中立的联盟，常被批评是投机主义者。
第二次魔法战争爆发后背叛C7，并和亡灵引路人结盟。
斯普利坎（スプリガン，Spriggan）
创立者兼领袖是巴斯提·巴托。
在C7的会议中常被评论是个更胜凤凰财团的怪人巢穴，过去时成员只有25人，全是高级魔法师，也是巴斯提的朋友。
卡美洛大祭司（ビショップ?ァ≈?ザ?キャメロット，Bishop of the Camelot）只允许女性加入的联盟，成员皆被称为“魔女”。
第二次魔法大战爆发以后，与巫师气息为联合阵线，昴魔法学院遇袭期间对抗亡灵引路人。
此外，它坐落在现存世界所拥有的一间医疗机构曾收容受重伤的武。
但曾接受千木阳子（七濑阳子）的委托，企图利用意外将武和月光两人一并抹杀，暗示该组织背后亦隐藏着不为人知的黑历史。
凤凰财团（フェニックス財団）
由具备“魔锻造”技艺、在魔法世界负责锻造魔法师化身的卜瑞卜一族掌控。也因为该项不外传的技艺，让凤凰财团即便属于被视为投机者的中立联盟，却依然在C7中拥有极高的权势。
现实中是贩卖无人机以及导弹的军火企业。
其中，部分的核心成员联合了部分来自其他联盟的魔法师，意图瓦解巫师气息中陈旧腐败的体制。
其他联盟
亡灵引路人（ゴーストトレイラー，Ghost Trailer）与C7抱持敌对立场的联盟。在抓到魔法使之后，会篡改他们的记忆，让他们成为自己的同伴，目的是要让魔法使支配人类。
原来是龙泉寺和马为了拯救相同遭遇的魔法使同时向巫师气息复仇而成立的，但后来势力变得强大以后引发了第一次魔法大战。虽然随着首领龙泉寺和马的沈睡而宣告败北，但旗下的成员在之后的16年间依然持续发动零星的武力冲突。
随着龙泉寺和马的苏醒，第二次魔法大战正式爆发，并与C7之一的古代赤龙结盟。
战后宣告解散，旗下成员多转入其他联盟。
高贵血族
小联盟，与古代赤龙同样是只允许魔法贵族加入的联盟。
表面上完全不参与C7和引路人之间的战争，保持中立；然而，他们是魔法贵族，重视魔法师血统纯正与否的组织。
魔法
魔法具有各种各样的性质，不同性质的魔法就被称为系统魔法。
基本魔法
飘浮（フロート）
控制地心引力，借此进行空中移动的魔法。
防护（プロテクション）
以大量自身的魔法粒子来保护自身的魔法。
轻弹（フリック）
以魔法粒子来弹飞物体的魔法。
雷克（レック）
以魔法粒子来摧毁物体的魔法。
冲击（ショット）
射击魔法。
干劲（ドライブ）
基本魔法，令自身的防御、强化和集中的三种类别合并为一的魔法。
系统魔法
魔法使所使用的六种魔法。因人而定。此外，还有不属于六种魔法的特异魔法。
回避魔法（回避魔法（かいひまほう））
用来回避、防御攻击的魔法，为较难控制的魔法。同时也是六大系统魔法中，唯一不须倚赖特定化身也能使用的魔法。
魔法阵型态：三角形，中间有一个圆形
幻术魔法（幻術魔法（げんじゅつまほう））
让人产生幻觉的魔法。
魔法阵型态：三角形，中间也有一个三角形，三角各有一个圆形破坏魔法（破壊魔法（はかいまほう））
强力的攻击魔法，在魔法中最难控制。
魔法阵型态：一个大圆形，中间有一个六边形
黑暗魔法（闇黒魔法（あんこくまほう））
直接干涉空间的魔法。
魔法阵型态：一个大圆形，中间有两个太极阴阳图神速魔法（神速魔法（しんそくまほう））
身体的一部分或武器附带辅助魔法、攻击魔法。
魔法阵型态：一个大圆形和三个小圆形
生物魔法（生物魔法（せいぶつまほう））
变身的魔法。使用者最多的魔法，也是最容易控制的一种。
魔法阵型态：正方形，四角各有一个圆形
特异魔法（特異魔法（とくいまほう））
不属于任何系统的特殊魔法。
化身
所谓化身（Aspect）是魔法使在使用魔法时作为媒介的道具。基本上用来作为化身的物品没有硬性限制，从刀剑、枪械等武器到日常用品等，几乎只要能随身携带的东西都能成为化身。
有的化身是魔法师本人最重视的物品变成的，也有的人是自主挑选化身。而化身本身作为物品的性质，或多或少也会影响魔法师对魔法的运用。
每集列表
| 话数 | 日文标题 | 中文标题 | 剧本 | 分镜 | 演出 | 作画监督 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 真夏の魔法少女 | 盛夏的魔法少女 | 笔安一幸 | 佐藤雄三 | 真野玲 | 江畑谅真 |
| 2 | もうひとつの世界 | 另一个世界 | 田所修 | 箕口克己 | Lee Jaemin Kim Jeongwoo Huh Gidong |
|
| 3 | 魔法學院と恋占い | 魔法学院与恋爱占卜 | 村上桃子 | 工藤利春 | 八谷贤一 | 星野真澄、服部宪知 永山惠 |
| 4 | 崩壊世界の六と十 | 崩坏世界的六与十 | ハラダサヤカ | 川口敬一郎 | 泽井幸次 | 山口仁七、王国年 |
| 5 | 魔法試験と冬休み | 魔法考试与寒假 | 笔安一幸 | 伊藤达文 | 政木伸一 | 青山正宣 铃木奈都子 |
| 6 | 激闘と奪還 | 激斗与夺还 | 村山桃子 | 小岛正士 | 真野玲 | 东岛久志、绪方步惟 高田晴仁、王国年 河口泉、前田义宏 冈郁美 |
| 7 | 魔剣の秘密 | 魔剑的秘密 | ハラダサヤカ | 田所修 | 村山靖 | 山崎爱 |
| 8 | ウィザードブレスの闇 | 巫师气息的黑暗 | 石野敦夫 | 伊藤尚往 | 垪和等 | |
| 9 | 崩壊への序曲 | 迈向崩坏的序曲 | 坂本一也 | 八田洋介 | 王国年、前田义宏 高田晴仁、东岛久志 冈郁美 |
|
| 10 | 消えた境界 | 消失的境界 | ハラダサヤカ | 小岛正志 | 佐藤雄三 | PARK NAM NAM HYUN SIK KIM HYEON OK YU HYUN JIN KIM BONG DEOK |
| 11 | ペンドラゴンの決戦 | 赤龙的决战 | 村上桃子 | 田所修 | 间岛祟宽 | 谷口宏美 |
| 12 | 世界からの消失 | 从世界消失 | 佐藤雄三 | 真野玲 | 王国年、垪和等 东岛久志、高田晴仁 冈郁美、前田义宏 江畑谅真 |
|
本作品是创作团体Ark Performance最初的原创漫画，在YOUNG KING OURs的编辑野野口强烈建议之下开始构想，于2009年提出企画并立即通过。发想阶段考量到自身擅长的科幻、兵器领域与少女做结合，然空战方面已有《强袭魔女》，顾虑战车可能也有别处企画在进行中，而选择了复杂且是贰号（石川）兴趣所在的船舰。作品特色之一的“少女站在军舰上”本来是最早的点子，但曾一度舍弃，在讨论众多提案之后才回头以此尝试出发。
21世纪初，人类受温室效应的影响而失去了大半的陆地。此时，在世界各地突然出现了搭载着神秘超兵器、真面目不明而被人类称为“海雾舰队”的战列舰群，以压倒性战斗力把人类驱逐出海洋，切断各大陆与岛屿之间的联系，令人类的文明和繁荣大幅衰退。对“海雾舰队”毫无招架之力的人类虽然失去了制海权，但并未放弃重新成为海洋的主人、在海洋上自由航行的打算，一直谋划着对“海雾舰队”反击的“大反攻”之日。故事始于被称为“大海战”的人类和“海雾舰队”首次交战并惨败的17年后，原士官候补生千早群像与其同伴们搭上父亲“千早翔像”制造“海雾舰队”的潜水舰“伊401”，并与“伊401”的心智模型“伊欧娜”一起接受突破“海雾舰队”的海洋封锁、运送人类反击的希望的委托。人类与海雾舰队间的战火再次展开……。
每集列表
| 话数 | 标题 | 剧本 | 分镜 | 演出 | CG监督 | 片尾插画 | |||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 日文 | 中文 | 首播 | 重播 | 第二次重播 | |||||
| #01 | 航路を持つ者 | 拥有航路之人 | 上江洲诚 | 柿本广大 | 今义和 | ★しばふ | 大见武士 | 秋荞麦 | |
| #02 | 嵐の中へ | 前往暴风雨中心 | 森田繁 | 平井义通 | 植高正典 | ふじのきともこ | 北崎拓 | あかざ | |
| #03 | 要塞港、横須賀 | 要塞港，横须贺 | 桥本裕之 | 铃木大介 名仓吾作 |
★コニシ | 春野友矢 | 上乃龙也 | ||
| #04 | 横須賀急襲 | 横须贺急袭 | 中村浩二郎 | 柿本广大 | 山田雅明 | 今义和 | 夏元雅人 | 有马启太郎 | BLADE |
| #05 | 人ならざる者 | 非人者 | 日暮茶坊 | kapu | 平井义通 | 植高正典 | ★コニシ | 上山道郎 | 希望つばめ |
| #06 | ともだち | 朋友 | 中村浩二郎 | 吉田丈司 | 濑藤健嗣 | 铃木大介 | 石黑正数 | 今井哲也 | むにゅう |
| #07 | 硫黄島 | 硫磺岛 | 上江洲诚 | 高桥正典 | 柿本广大 | 石田龙介 松浦宏树 |
★みことあけみ | 野上武志 | 远藤海成 |
| #08 | 人形の家 | 人偶之家 | 森田繁 | 政木伸一 | 今义和 | ことぶきつかさ | 石田敦子 | 小梅京人 | |
| #09 | 決死の脱出行 | 决死的逃脱行动 | 日暮茶坊 | 中野英明 | 江岛泰男 | 铃木大介 | ★パセリ | 六道神士 | ひよひよ |
| #10 | その身を捧ぐ | 献身 | 中村浩二郎 | 平井义通 | 植高正典 | 水上悟志 | 宫原琉璃 | 武若丸 | |
| #11 | 姉妹 | 姐妹 | 森田繁 | 吉冈忍 | 博史池畠 | 今义和 | ★藤川 | 山村响 | 兔冢英志 |
| #12 | 航路を拓く力 | 开拓航路之力 | 上江洲诚 | 柿本广大 | 植高正典 | Ark Performance | 井上纯弌 | ||
热门社交游戏“魔法少女育成计划”，为数万人之中仅一人能成为魔法少女的奇迹般游戏。幸运地获得魔法，过着充实生活的众少女。然而，就在某一天，她们收到法布传来“因人数过多，为了确保魔力供给足够，要裁掉一半的魔法少女”的片面通知，需在16人中削减8人，于是由16位魔法少女所带来的残酷激烈、惨无人道的殊死竞存比赛，由此拉开序幕。
然后在经过一场大规模的战斗后，魔法少女存活人数达到7人，但法布突然宣布“因为途中有给出魔法道具的关系，魔力供给依旧不足，将存活人数下修到4人。”于是残存的魔法少女在生存威迫下再度展开一场殊死厮杀。