日本的御宅族文化在神秘组织“SSC”出现后遭到镇压，此时一位热爱御宅族文化的男子“御宅英雄”与仰慕他的三名魔法少女一起率领御宅族们挺身反抗SSC，双方展开一场壮烈的战斗。
2008年——因一股神秘的力量出现，
日本的动画、游戏、漫画、音乐、铁道、cos等御宅文化被消灭。
就这样，在维持秩序的「SSC」维护下，御宅文化几乎消失殆尽。
为了夺回御宅文化，比任何人还深爱秋叶原以及御宅文化的「御宅英雄」，
以及崇拜他的3名魔法少女「安那其」、「Blue」、「Pink」举起反旗。
舞台为2011年的日本，秋叶原革命军与SSC首领「SHOBON」展开激战。
故事背景为一场史无前例的大灾害彻底摧毁了现代文明并且已经过去了十五年。故事使用双线描述，其中一支为一群孩子被圈养在某个封闭设施中，他们被告知外面世界充满各种怪物，一天时男收到一条消息询问他是否想到设施外面，而和他亲密的弥美姬则预言到外面会有两个人到来救她出去，而且其中一个人和时男样貌相同;另一支则是在外面荒废的世界，贵留子受委托作为保镖，带着小丸前去一个名为“天国”的地方。
每集列表
| 话数 | 日文标题 | 中文标题 | 剧本 | 分镜 | 演出 | 战斗分镜 | 作画监督 | 首播日期 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 天国と地獄 | 天国与地狱 | 深见真 | 森大贵 | 竹内哲也 | 吉田优子、古川良太、渡边爱 | 2023年 4月1日 |
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| 2 | 二人の告白 | 两人的告白 | 土上树 | 柴田海 | - | 岩泽亨、吉田优子、土上树 奥野治男、具志坚真由、柴田海 |
4月8日 | |
| 3 | 桐子と春希 | 桐子与春希 | 洼山阿佐子 | 野村和也 | 榎本柊斗、伊藤香奈 | 4月15日 | ||
| 4 | クク | 玖玖 | 深见真 | 大冢隆史 | 铃木明日香 | 铃木明日香、植田实 | 4月22日 | |
| 5 | お迎えの日 | 命定之日 | 野村イクミ | 新井阳次郎 | 小村方宏治 | - | 具志坚真由、 藤卷廉、 渡边爱 | 4月29日 |
| 6 | 100%安全水 | 100%安全的水 | 洼山阿佐子 | 古川良太、增田惇人、奥野治男 | 增田惇人、斋藤秀二、滨田将太 | 古川良太、福岛沙映、奥野治男 高乘阳子、小林冴子、小松真梨子 河村明夫、村松尚雄、长谷川早纪 |
5月6日 | |
| 7 | 不滅教団 | 不灭教团 | 野村一九三 | 奥野治男 | 阿部将光 | 片桐贵悠、奥野治男、具志坚真由 | 5月13日 | |
| 8 | それぞれの選択 | 他们的选择 | 洼山阿佐子 | 藤田春香 | 仲野良 | 富坂真帆、奥谷花奈 泽田英彦、小林冴子、广江启辅 永野裕大、ゼロ、柴田海 |
5月20日 | |
| 9 | 学園の子供たち | 学园的孩子们 | 深见真 | 野村和也 | 具志坚真由、平冈惠实 福岛沙映、会津五月 |
5月27日 | ||
| 10 | 壁の町 | 围墙小镇 | 洼山阿佐子 | 五十岚海 | 竹内哲也 | 6月3日 | ||
| 11 | テストを始めます | 测试开始 | 野村一九三 | 森山悠二郎 | 铃木绘万、森山悠二郎 夕一美、奥野治男 黄濑和哉、新野量太、具志坚真由 河村明夫、洼田康高、小松真梨子 |
6月10日 | ||
| 12 | 外の外 | 外面的外面 | 深见真 | 石井俊匡 | 篠原准 | ゼロ、天崎学、榎本柊斗 ひらおかえみ、吉田优子、TOMATO 小谷杏子、伊藤香奈、柴田海 |
6月17日 | |
在一个海洋占了七成的星球，自从塞壬的出现，失去了九成的海权。为了合力抵抗塞壬，白鹰、皇家、铁血与重樱这四个阵营组成碧蓝航线阵营来阻止海洋威胁。而铁血与重樱受到塞壬的影响之下退出并且背叛碧蓝航线阵营，另组赤色中轴引发战争，人类的命运陷入了泥沼之中…。
除上述四个主要阵营外，游戏中开始实装北方联合、东煌、自由鸢尾、维希教廷、撒丁帝国的少数船只。
曾经，来自海洋的神秘敌人“塞壬”向人类发起了猛烈的进攻，“碧蓝航线”的少女们凭借着她们钢铁般的意志与敌人奋勇作战，最终击败了对手，守护了人类。然而，随着时间的流逝，碧蓝航线内部因为理念的差异逐渐产生分化，衍生出了名为“赤色中轴”大的对立阵营。
被称为“灰色的幽灵”的最强英雄企业(石川由依 配音)、每天都迷迷糊糊但关键时刻意外的顶用的拉菲(长绳麻理亚 配音)、虽然年纪不大但成熟体贴的大黄蜂(山本希望 配音)，个性好强但心地善良的哈曼(伊藤明日香 配音)，面对动荡的时局，当这些少女们再一次被推上战场，会发生怎样的故事呢?