作品舞台是一个挂着“注意牛只穿越”的看板，公车不等上5个小时不会来的乡下。主角一条萤因父亲工作调职的关系从东京迁居此地，进入“旭丘分校”就读，故事即描写萤与越谷姐妹及宫内姐妹度过的日常生活。

由于体弱多病且父母双亡而遭受欺负的少女实，与希望看到实的笑容的方和杏子之间的感人故事。

一直被贴著受欺负孩子标签的实。 希望能看到她的笑容的方和杏子，在某个下雨之日的午后，尽情地与她说了话。

然而仍然看不到她真正的笑容，而她的身体状况也变得恶化，连学校也不来了。

之后过了两个月……方和杏子收到了一封不可思议的邮件。 没有发件人的名字，甚至无从回信的这封邮件，传达了邻镇夏日祭典的通知—题目中出现的クリオネ(Clione)是一种于深海生存的软体动物，海天使的名字可能是因为它在海水里展翅游泳时，类似翅膀的器官看起来像天使的翅膀，而且透明的身体中央有着像红心一样的红色消化器官。