鸟井美津子(鳥井 美津子(とりい みつこ)，声：高桥智秋)
保健室医生，兼任高等部1年A班导师。平易近人、个性率直的老师。
极想要研究魔王的灵魂，所以不厌其烦地叮嘱阿九斗死前一定要通知她。
照屋荣子(照屋 栄子(てるや えいこ)，声：佐藤聪美/户松遥)
帝国公共安全委员会的朝廷密探。跟服部绚子一样是斯哈拉教徒的忍者出身，但是是甲贺流忍者。
父亲照屋敬三是斯哈拉神大祭司兼照屋家当主。
江藤不二子(江藤 不二子(えとう ふじこ)，声：牧岛有希(VOL.1)/高垣彩阳(VOL.2-)/伊藤静)
高等部3年级学生，女生宿舍舍长，校园偶像。专长是黑魔术，魔药炼制。校内排行榜第1名。
表面上是个温柔高雅的大小姐，实际上极度腹黑，一开始想把阿九斗变成自己的仆人来使唤;因某次的契机被阿九斗所救，阴谋变成如何让阿九斗成为君临天下的魔王及自己的男人。
不容许阿九斗跟其他女性有任何亲密接触。一直设法让她的“阿九斗大人”的“某处”强硬起来。
白石莉莉(リリィ 白石(リリィ しらいし)，声：神田朱未/广桥凉)
学生会会长。个性为仆娘，平时总戴着一顶尖端巫师帽。对阿九斗的觉醒感到兴趣。
身材娇小但实力超群，能利用魔法改变手部肌肉使手臂伸长，借此快速击出重拳。
若是被说身材矮小就会发狂，曾因此灭掉一支骑士团。
对阿九斗抱有好感。曾跟阿九斗接吻。
在动画中，平时总戴着一顶尖端巫师帽掩饰自己的感情，说话和态度不同而转不同的样子，有时还会发出声音(如笑声和咆哮)。
春日井 甲洋(春日井 甲洋(かすがい こうよう))
配音员：日：入野自由/台：吴文民
年龄：15→26
亲属：监护人(春日井正浩、春日井谅子)
2131年5月7日生，金牛座，身高172cm，体重64kg，血型A型。
15岁的中学生，和翔子一样是被收养的孩子，但待遇相差很大。
偷偷养了一只叫Chocola的狗(白石凉子配音)，父母因他被选上成为驾驶员感到光荣，而本人则向往战斗。思考能力强，特别是数学。此外，喜欢翔子却说不出口。
第一季在翔子过世后，认为其死亡是总士和一骑的责任;小说版中描述他对一骑的仇恨变的更深，联合其他驾驶员排斥唯一独自作战的一骑。
亦因此抛开畏惧以及仇恨面对战斗，但于初战时的救出行动被Festum同化遭封印于岛上设施之中，差点被养父母所杀，因对其的研究从而延长一骑他们的生命，但因为自身是处于半同化的模样，不知何时会完全同化为Festum，最终决定要执行销毁处分。
于盂兰盆祭醒来时，造成全岛骚动，一骑等人为了庇护他甚至将他藏起来，后来接受了翔子已死的事实并与一骑和解，最后成为Slave型的Festum，继续沉睡。
跟随红音(妙尼尔)离开龙宫岛，为了在一骑等人前往北极时，代替他们保护岛。
剧场版化为Mark.Vier核心归来，拯救陷入危机的岛上驾驶员，于最终决战时机体被Mark Nicht击毁，核心在被消灭前转移，之后下落不明。
第二季于Walker大举入侵，岛内众人遭受性命威胁之时，突然像是呼应剑司一般自乌兀德之泉里出现，透过同化海水重新构成肉体和Mark Vier，从Festum手中救出被同化中的铃木彗，并将Walker连同北极星核碎片一起斩杀，战斗结束后回到了岛上，在过往居住的咖啡厅中对成为星核一部分的羽佐间姐妹承诺将会留下来保护大家的归宿，并从卡农留下的帽子里取出一张写有座标的糖果纸。
其能力被织姬称为“毒”，为未来所需的力量之一，其能力对Festum有着致命的伤害。
于第25话被允许得知阿尔维斯所有的情报。
战后存活，在一骑要去追总士时与来主操一起拉住他。
在第三季第一集里依然担任驾驶，且与其他驾驶员夺回被马里斯带走的总士，但最后以失败告终。
被Benon及马里斯称为Element，与一骑及来主操作为调和存在与虚无的存在。
在第五次苍穹作战中，与其他法芙娜驾驶员潜入伪龙宫岛，目标为夺回总士。
皆城 总士(皆城 総士(みなしろ そうし))
配音员：日：喜安浩平/台：于正昌(第一季)、锺少庭(第二季)/ 港：李家杰(剧场版)
年龄：14→19(殁)转生后：3
亲属：父亲(皆城公藏)、母亲(皆城鞘)、妹妹(皆城乙姬)、外甥女(皆城织姬)
2131年12月27日生，魔羯座，血型A型。
15岁的中学生，是皆城公藏与鞘的孩子，由于要植入特殊因子，因此在人工子宫出生。
有一妹名叫乙姬，于故事前段于女神的岩窟中沉睡。
于小时候已知有Alvis等组织及各种被稳藏的事实，亦因此诱发了Festum的因子，并企图同化一骑但被一骑以树枝划伤左眼，从此左眼几乎失去视力，亦因此伤口而未能驾驶Fafner。
最后被司令任命于“齐格飞系统”中指挥各驾驶员，并承受于各人战斗时所受的痛楚(除了受攻击时的痛楚，还有Flashback)。
于第一季最后是被同化而失去存在，但他向一骑承诺会回来。
在前传“Right of Left”中，在测试Mark Eins因左眼痛楚而测试失败。
于剧场版最终决战后归来，实际上是一直受到来主操的保护，与一骑透过交错同步交谈，并指引他。
在第二季中为了继续研究Festum而朝研究者的方向发展，并继续担任“齐格飞系统”的操纵员。
因一骑的生命受Mark Sein侵蚀，而势必要先销毁Mark Nicht，虽然在消灭Mark Nicht一事上用尽各种手段，但每次皆因Mark Nicht的自我修复及同化机器的能力而失败。
称Mark Nicht为“虚无之子”。
其后在阿撒谢尔型“walker”攻击龙宫岛时，被觉醒的织姬委派与一骑一同前往保护在斯利那加的美羽，接受命令并启动被封印的Mark Nicht，前往支援派遣部队。
在到达后消灭大量Festum，其后被三体迪亚波罗型攻击驾驶舱，在反攻时透过机体的同化能力学懂了迪亚波罗型的小型黑洞的变型攻击，并相继消灭三体迪亚波罗型及其他Festum。
最先开始怀疑移民队伍里有叛徒，吸引Festum攻击落单的难民。
在重新与岛会合时被若换成常人早已无法行动程度的严重同化现象所苦，因肉体早已不是人类才能勉强坚持下来。
决心以Mark Nicht为代价来交换真矢与广登的释放，而拜托织姬给予出岛许可。
与沟口等人前往新国联基地进行谈判，因而卷入并见证亚特兰提斯星核向人类军掀起反旗的一幕。
谈判破裂后，跟来袭的Festum缠斗，对于对手星核的冰冻同化感到棘手仍不懈奋战。
被龙宫岛星核称为于存在与虚无之间和谐共存的存在。
很关心其他人的新型同化现象，对于自身的存在已濒临极限已有所自觉，知道自己随时都会消失，故留下录音，诉说一切。
在第四次苍穹作战前意识到自己的生命将会走到尽头，于消灭Vargant后，因为严重的同化作用结晶化身亡，其转世被一骑从Mark Nicht的机舱中抱起并收养，第二季结尾被一骑称为总士。
在第三季第二集里已成长为中学生模样的少年，与假扮为皆城乙姬及日野夫妇的Festum共同生活。
因马里斯世界语的能力而失去在海神岛的记忆，第五次苍穹作战即是为了夺回他而订立。
在假扮为皆城乙姬的芙洛洛因挽留自己而被真壁一骑同化消失后对其产生恨意。
在海神岛上因露维的要求而进入了Mark Nicht的机舱中，使Mark Nicht重新启动并与过去的皆城总士产生共鸣，但因变性意识及仇恨而短暂的轰炸海神岛，被一众驾驶员制服并教训，也感叹皆城总士对Mark Nicht强大的适应性。
第三季第四集住进了远见家，并开始与驾驶员们学习知识以获取力量，并得知真相。
曾短暂的想起在海神岛上的海边与某人牵手散步，询问远见真矢时被她以“你自己去想起来”驳回，而未得到答案。
被Benon及马里斯称为Element，与春日井甲洋、来主操及真壁一骑作为调和存在与虚无的存在。
在第三季第九集中为拯救同化作用过剧即将消失的水镜美三香与御门零央，而以自身能力进化了Mark Nicht，并一度到达了存在与虚无的地平线，再次见到对越过地平线的皆城总士，他对其大吼著“这是我的名字!”
小楯 卫(小楯 衛(こだて まもる))
配音员：日：斋贺光希/台：郭馨雅
年龄：14(KIA)
亲属：父亲(小楯保)、母亲(小楯千沙都)
2131年8月13日生，狮子座，身高165cm，体重61kg，血型A型。
15岁的中学生，小楯保与千沙都的孩子，家中经营公共澡堂。从小喜欢看漫画，他最喜欢的漫画是一套名叫《机动武士高拜》的机器人漫画，而漫画作画者为其父亲(虽然他本人起初不知道这件事)。是防护型的Mark Fünf的驾驶员，在戴上高拜的面具时会变得我行我素，无所畏惧(无论是在驾驶Fafner时或否皆是如此)。
于第一季第22话将面具赠于堂马广登后战死，得年14岁。在《EXODUS》的第20话里，显示他死后似乎成为了龙宫岛星核的一分子。
皆城 织姬(皆城 織姫(みなしろ おりひめ))
配音员：日：仲西环/台：石采薇
年龄：不明(沉睡)
龙宫岛的星核在学会“生与死之循环”后所重生出的核心型Festum。在其母乙姬消失后继承使命，于女神的岩窟沉睡并负责守护龙宫岛。
以前处于胎儿状态，在剧场版中进入成长期时令岛的星核出现不稳定状态，导致部分岛民的健康恶化。
其后在新星核及由其所率领的Festum攻击岛屿，与遭到人类军核武攻击时，得到妙尼尔的保护，成功渡过成长期。
在第二季中急速成长，在与艾梅莉接触后更出现反应。其后在派遣部队出发后觉醒，向一骑等人传达派遣部队会有危险一事，自言若还是维持在幼子状态就没办保护岛。
拥有乙姬的记忆，但对自己被人称为“乙姬”却很反感(被芹叫乙姬酱时，而反驳她说不要随便叫她妈妈的名字)，因而委派芹为自己命名，并采用了由其改的名称“织姫”。
在为总士送行称他为哥哥，但是被总士纠正，她其实是总士的外甥女。
其性格与天真开朗的乙姬完全相反，语气傲慢，其力量是给予必须支付代价来获取强大的能力，只因为驾驶员希望拥有更加强大的力量来守护一切。仅有在单独面对总士时才会稍稍露出属于这个年龄的孩子的表情。
告诉芹说，她与岛全是建立在岛民的牺牲之上，也告知芹她的特殊同化现象只要离开岛上就能完全治好，并要求芹如果可以离开就要毫不犹豫的离开岛。
接纳了逃过来的难民，但是不肯接近纳雷因，亦拒绝他们所持有的星核于岛上扎根。
感觉到一骑选择了成为超脱生与死之轮回的存在，也知道一骑已无法回头。
在牵牛星选择的那瞬间，下令执行Plan Delta，选择回归岛，并与牵牛星一起沉睡，拜托史彦准备迎接下一个新诞生的核，芹为了保护她，差点遭牵牛星同化，最后也一起随岛沉入海中并回归星核。
在第三季中出现了与皆城乙姬、皆城织姬相同基因的两个岛核：皆城辉夜(CV：松田飒水)、皆城朔夜(CV：松田利冴)，并代替织姬等待未来有能力与牵牛星对话的人出现。
真壁 一骑(真壁 一騎(まかべ かずき))
配音员：日：石井真、丰口惠(幼年)/ 台：郑仁君(第一季)、贾文安(第二季)/ 港：邓肇基(剧场版)
年龄：14→26
亲属：父亲(真壁史彦)、母亲(真壁红音)
2131年9月21日生，处女座，血型O型。
个性沉稳，但是不善与人交际，有点天然呆的性质，不爱生气，对一切事物均平等的看待。
15岁的中学生，是真壁史彦与红音的孩子，于人工子宫出生，家经营陶器屋。
由于小时候母亲红音战死，因此负责家中所有家务。
据小说所载，由于人工子宫出生的孩子均植入特殊因子(称天才综合征)，因此运动神经异常发达，棒球比赛如果轮到他上场打击，就必须额外派出一人跑去西尾杂货店买备用棒球。
与总士自小是朋友，于小时候差点被总士同化而弄伤总士的眼睛，因而内疚而疏远总士，直至Festum攻击龙宫岛开始才渐渐回复以往。而真矢对于一骑则是可信赖的存在。
起初对抗Festum时所驾驶的机体为Mark Elf，但在驾驶Mark Elf私自出岛被新联合国捕获而下落不明，以俘虏身份接受新联的调查。
最后于新联合国基地被Festum攻下之前从妙尼尔手上接下Mark Sein后消灭Festum回岛，因Mark Sein是移植Mark Elf的核，所以在与伊敦打斗时，出现了异常现象，其结果被乙姬称为新生。
在第一季完结时被同化至几乎失去视力。
于剧场版时17岁，并在沟口恭介所经营的咖啡店“乐园”内打工，更成为该店的招牌。
之后在Festum第一次进攻时，因驾驶Mark Sein与被敌人剧烈攻击下加重身体的负担，而同化现象症状复发，被警告若是再次驾驶法芙娜就有可能死亡，以致无法再驾驶Mark Sein。
其后在于来主操爆走后再次驾驶Mark Sein，更将操所驾驶的Mark Nicht推至天际后消失在虚无中。
于最终决战时于Mark Nicht结晶内出现，与操缠斗时，质问操明明就可以明确的表达自己的意思，却无法反抗星核，告知自己过去曾伤害总士一事，同化了Mark Nicht，解放了操，自身差点因同化而死，被操硬是拉回来;战后因操为他治好双眼的同化现象故恢复视力。
在第二季中正式担任沟口恭介所经营的咖啡店“乐园”里的厨师，被总士抱怨身为王牌驾驶员的经验可以成为指导教官，却偏偏当厨师。
之后在与前来龙宫岛的人类军口中得知，自己在4年前于人类军基地中被提取Festum因子(现被人类军称为真壁因子)，使大量不够资格的军人能透过注射真壁因子而驾驶法芙娜而被视为英雄。
但本人却担心在注射因子后，机师虽能操纵法芙娜但会缩短其生命，因为这件事而被道谢对此感到迷惘。
在阿撒谢尔型Walker攻击龙宫岛时，被觉醒的织姬委派前往保护在斯利那加的美羽，之后接受命令并启动被封印的Mark Sein，前往支援派遣部队。到达后先后使用机体的同化能力，将被Festum同化的艾西瓦娅及其他人类军机师救出。之后因斯利那加遭到毁灭后而与总士、派遣部队及纳雷因将军的部队一同离开并前往寻找“希望之地”，在路上除了不断遭到来自人类军及Festum的攻击，更因自身身份而被人类军的特工企图暗杀。
最后成功与龙宫岛会合，并终于独力打败Aviator，但自己也因为同化现象失去右手，并在同化Aviator的核心后陷入昏迷。
昏迷期间与龙宫岛星核(透过卡农和翔子的形象)在乌兀德之泉接触，并选择接受岛的“最后的祝褔”以超脱生死遁环的存在苏醒过来。
在第四次苍穹作战时与总士、甲洋及操聨手攻击Raison但不果，脱离战场时，差点被亚特兰提斯的核心抓住，但被岛上的星核守护着，操要他反抗亚特兰提斯的星核而成功挣脱，其后独自与Raison决战，后放弃了攻击并同化了Mark Raison，将强纳森被封印在戈蒂雅斯结晶中的心唤回。
在被强纳森要求杀害自己时却因亚特兰蒂斯的核心的介入而被带至宇宙，最后被甲洋及操救出。
战后于Nicht的驾驶舱发现转生的总士并将其带走，之后肩负起了养育已变成婴儿的总士，同时因龙宫岛执行Plan Delta而移居到海神岛。
自身早已有所觉悟，夺走他人多少，将倾自己能力归还。
被星核拜托，龙宫岛上的星核称他为能在痛苦与存在之间和谐共存的存在，是做为可以抚平世界伤痕的存在。
在第三季第二集里，在龙宫岛的石灯笼处看着找来的皆城总士，笑着说他已经长大了。
于第三季第三集与其他战士一同毁灭玛莱斯贝洛与马里斯共同建立的伪龙宫岛，并在皆城总士面前同化了假扮皆城乙姬的Festum，引发了皆城总士的仇恨。
被Benon及马里斯称为Element，与春日井甲洋及来主操作为调和存在与虚无的存在。
在第三季第七集中以自身力量成功创造了新救世主型法芙娜 Mark alles，并因此重回存在与虚无的地平线，但被春日井甲洋及来主操以尚未完成到达未来的任务而被拉回。
在第三季第九集中因皆城总士进化了Mark Nicht而到达了存在与虚无的地平线，将其拉回的同时在他身后看见了越过地平线的皆城总士与他相望，他苦笑着并对面前的皆城总士说“不要过去，这里还有你要指引的未来。”
日野 道生(日野 道生(ひの みちお))
配音员：日：堀秀行/台：吴文民
年龄：25(KIA)
亲属：父亲(日野洋治)、母亲(日野惠)、妻子(远见弓子)、女儿(日野美羽)
2121年6月23日生，巨蟹座，身高185cm，体重71kg，血型O型。
由于父亲离岛而离开龙宫岛的驾驶员。喜欢弓子。在背叛要以核弹炸毁龙宫岛的新联合国后，于Alvis担任Mark Eins的驾驶员。
在第23话中已经25岁的他作为神剑型法芙娜的驾驶员已经到达极限，但为了保护龙宫岛他注射了会促进同化的药剂。
在与伊敦战斗但不敌，企图使用“芬里尔”将伊敦炸毁，而后弹出驾驶仓逃生，但被伊敦的Mark Nicht抓住并死于“芬里尔”之爆炸中。
第一季结局前与弓子同居，并知道自己有了孩子(日野美羽)。
在《EXODUS》的第20话里，显示他死后似乎成为了龙宫岛星核的一分子。
羽佐间 翔子(羽佐間 翔子(はざま しょうこ))
配音员：日：松来未祐/台：郭馨雅
年龄：14(KIA)
亲属：监护人(羽佐间容子)
2131年9月20日生，处女座，身高160cm，体重46kg，血型A型。
15岁的中学生，被羽佐间容子收养的孩子。是个有肝病、因为身体虚弱经常无法上学的孩子。真矢是其好友，因此经常于课前去探望她。
据小说所载，由于中学开学典礼时一骑帮助倒在路边动弹不得的她到学校，而渐渐对一骑产生爱慕，虽然已对真矢表明喜欢一骑，却一直无法下定决心告诉当事人，以及因为病痛之故，早就学会在身体受到伤害时，把自己的意识不知道丢到哪里去的能力，借此逃避痛楚。
对于自己也能进Alvis担任前线人员感到高兴，于第一季第6话为了岛不被破坏及遵守和一骑的约定，而驾驶Mark Sechs和敌人同归于尽，在启动芬里尔系统后自爆，得年15岁。出击前因对养母口出恶言，一直很后悔对养母说出那些话。在《EXODUS》的第20话里，显示她死后似乎成为了龙宫岛星核的一分子。