在这个世界中，除了人类和妖怪外，还存在着另一个物种——人类和妖怪结合产生的返祖妖怪。由于其不纯正的血统，返祖妖怪经常会被同类驱逐甚至追杀，因此，一间专门为返祖妖怪提供庇护的“妖馆”应运而生。在妖馆中，每一个返祖妖怪都会配有一位被称为SS的护卫，白鬼院凛凛蝶（日高里菜 配音）和御狐神双炽（中村悠一 配音）的故事就由此开始。

在妖馆中，还居住着另一些有趣的住客。性格优哉游哉但其实有着意外细腻内心的反之冢连胜（细谷佳正 配音）和他的护卫雪小路野蔷薇（日笠阳子 配音）；不良正太渡狸卍里（江口拓也 配音）和他的护卫夏目残夏（宫野真守 配音）；狂放不羁甚至有些变态的青鬼院蜻蛉（杉田智和 配音）和他倒霉的护卫髅髅宫歌留多（花泽香菜 配音）。在和这些同类相处的过程中，凛凛蝶找回了久违的快乐，同时，返祖妖怪们丢失的记忆也逐渐的浮出了水面。

第一章（初章）

白鬼院家的大小姐白鬼院凛凛蝶因为总是不由自主地虚张声势，而使事情变得越来越糟糕。为了改变这种性格，十分懊恼的凛凛蝶决定离开本家，一个人独立生活，之后凛凛蝶搬进了被称作“妖馆”的豪华公寓，遇到了身为其保镖的御狐神双炽，故事因此而展开。

第二章（if）

妖馆的众人不幸地卷入犬神命的百鬼夜行事件中而身故。在23年后，身为返祖妖怪的他们再一次转生、并再次相遇。

“interlude”

插曲。聚焦各登场人物的特色短篇集。全5话。

舞台为第1章。

第三章（在春天觉醒）

第二章的最后，众人通过千年樱将时间胶囊送回过去。第三章（最终章）的时间点回到在第一章挖埋时间胶囊的洞之时，众人挖出由未来（第二章）送来的时间胶囊，因而回避第一章在百鬼夜行中死亡的时间线。在收到另一个自己写的信后，众人也开始有所行动。

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