舞台是人类和妖怪共存的日本。反对派的妖怪引起了各种各样的问题。陆军和妖怪为了解决由妖怪引起的问题而成立妖人部。

妖人部是为了解决不可思议事件而招集半妖石榴、薄萤、雪洞&鬼灯以及陆军军人的总角景、芳野葛利剑、花桐丸龙组成。

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春日野悠和他的双胞胎妹妹穹在父母死于事故之后，来到了位于名叫奥木染町的小村的祖父的故居中，在那里开始新的生活。

与在昔日到访奥木染时认识的天女目瑛和依媛奈绪重遇、认识了新的朋友、以及被妹妹所倚赖，就这样悠的新生活展开了。在看似安稳的日子里，很快悠注意到了对自己来说谁是重要的存在……

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故事发生在一处温馨但偏僻的田园小镇奥木染，双亲过世的少年春日野悠(桥本隆 配音)带着体弱多病的妹妹春日野穹(田口宏子 配音)千里迢迢的来到了这里，准备寄宿在祖父留下的房子中。虽然照顾妹妹的起居很辛苦，但悠还是拥有了一段难得愉快的时光。

在这里，悠遇见了幼年的玩伴天女目瑛(阪田佳代 配音)，成熟温柔的姐姐依媛奈绪(猪口有佳 配音)，认真可爱的大小姐渚一叶(小野凉子 配音)等热情亲切的朋友们，还有同班损友中里亮平(中国卓郎 配音)的插科打诨让他笑口常开。同时，一些模糊的回忆逐渐的浮上了心头，是和谁有过怎样的约定呢?面对着面前似曾相识的风景，悠的记忆开始苏醒。

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自古以来，人类与海洋的渊源就颇为深厚，人类之所以能够进步和发展，也和海洋有着不可否认的关系。然而，在海洋资源被大力开采的同时，严重的污染也随之而来，越来越频繁的海洋灾害让人类吃了不小的苦头。乌贼娘（金元寿子 配音）是海里的忠实居民，看着生存的家园被破坏，忍无可忍的她决定给人类一个小小的教训。

初涉陆地的乌贼娘还有些不太习惯，顶着一副可爱迷糊的萝莉外形，还未教训人类，自己就先失手打破了海之家的墙壁。无奈之下，乌贼娘只得留在海之家做打工妹来偿还墙壁修补的债务。在海之家，乌贼娘认识了个性好强的相泽荣子（藤村歩 配音），温柔可人的相泽千鹤（田中理惠 配音），活泼好动的相泽武（大谷美贵 配音）。对于乌贼娘来说，虽然惩戒人类的大计尚未成功，但是就这样和朋友们快乐的在一起，好像也是一种不错的选择。