游戏原作的故事围绕着主人翁勇者吉尔为了救回被邪神德鲁亚加(ドルアーガ)抓走的恋人卡依，化身成黄金骑士，登上60层的“德鲁亚加之塔”──亦即“迷宫塔”中冒险;一边与怪物作战，一边层层推进…如此在巨大的塔中展开了无数的冒险故事。

迷宫塔 ～乌鲁克之盾～

以“世界的前途被那个塔捆上了”(「世界の行く末はその塔に束ねられた」)作为宣传口号，动画版本第一季之《迷宫塔 ～乌鲁克之盾～》的故事承接着游戏版本的结局，背景则设置在勇者吉尔之冒险的多年之后：

时光飞逝，勇者吉尔与巫女卡依的故事成为传说被传承到八十年后的世界，这时，吉尔已经击败邪神德鲁亚加并建立了乌鲁克国，成为吉尔伽美什国王。适逢每五年一度，因为天上阿努神(アヌ神)的保佑，塔内的恶魔们都于阿努之夏失去了它们的力量。终于第三次的阿努之夏将至之时，于塔内都市梅斯克亚(メスキア)，由吉尔伽美什国王所创建的乌鲁克国的军队为第三次出征作出准备;然而，听说塔之顶层沉睡着传说中的宝藏蓝水晶之杖(ブルークリスタルロッド，Blue Crystal Rod)，登顶者们都为此雀跃。大家都以讨伐恶魔为理由，向塔之内部进攻。实为传说中的“蓝水晶之杖”之争。从此，剑与魔法之大冒险随即展开!

迷宫塔 ～乌鲁克之剑～

自从第三次的阿努的夏天结束，基鲁与法蒂娜由塔的顶峰送回起点“塔内都市”梅斯克亚，时间不知不觉又过了半年…

当分别以基鲁及尼巴为首的两队登顶者、以及凯尔布率领的乌鲁克军辛苦攻上了迷宫塔之顶层，大家都以为打败邪神便能获得传说之蓝水晶之杖并结束这个旅程，怎料事实却并非所料：秘密、背叛、谎言…一一现在眼前;原来局中有局，这儿才是真正故事的开始!尼巴及卡雅的身影与幻境之塔一同消失;主人翁基鲁及法蒂娜无奈地被送回旅程的起点，而其他同伴则下落不明。但是，基鲁再一次下定决心，誓要再次踏上迷宫塔的顶层，进入幻之塔内，解开所有迷团。

特色

动画版之《迷宫塔 ～乌鲁克之盾～》以古代美索不达米亚神话为背景，风格奇幻，充满着魔法、怪物、侠士剑客。除了奇幻要素，故事亦走幽默、惹笑路线，对白抵死风趣，为一向制作严肃故事之GONZO的一套特别之作。

值得一提的是，第一集分成表、里两故事，于同日播出。表、里两故事的开始与终结是一模一样的，但中间的情节却不相同：表故事是以男主角基鲁的梦为骨干，当中不乏主角自己天马行空的想像情节，以惹笑抵死、甚至乎是“恶搞”的方式介绍了整个系列之背景与主角众奋斗的目的──可视为整个系列之序章;而里故事则以男主角的同伴之遭遇出发，过程当中巧妙地穿插表故事里主角的幻想情节，起承转合，于结尾处再次与表故事重叠。以两个首、尾相同，中间却互相错开又彼此交叠的故事分两集同日播出，这种新颖、复杂的结构为动画片中甚少见的。

这世界上存在一个类似黑洞，能够夺去一切物质的-“无明领域”。

随着无明领域的发生，无数被称为“戒者”(imashime)的异形生物就会蠢蠢欲动，伺机要把人类拉进绝望的深渊。

在这个混沌的世界里，有8名少年少女被召集起来，共同调查无明领域的秘密、抵抗异形生物的入侵。

在危机之中，现在与过去的命运复杂地交错著，他们是否能够带来光明的救赎呢?

全人类只能倚靠这最后一丝希望了……

无明领域(無明領域)

10年前于东京出现、直径数十公里的黑色空间。出现的理由及科学法则皆不明。于无明领域内，不论生物及非生物皆会被“尸钢化”。此外，在无明领域的影响下，人类会出现强烈的幻觉、意识混浊及记忆出现混乱等症状，最终会丧失自我。

发生初期因无明领域的自我扩张速度较慢，避难对应的工作还能展开，因此当时东京的遇难人口比例较少。但因失踪者超过50万，大量市民前往东京都邻近附近的县市避难，导致总受影响人数超过4000万人，使东京作为首都的机能被破坏，而日本的政治以及经济活动亦受到相当大的打击。

日本、世界各国以及各个机关都曾经几度进入无明领域进行调查，但每次皆出现有调查队成员遇难的结果。现时，无明领域外围边缘地区至数公里外的范围为缓冲地带，禁止任何人进入。第零种特殊灾害认定区域。

于本作出现的“久久能树(九々ノ木)”能抑制无明领域。在久久能树范围内戒缚无法入侵，而它的果实久久果在在久久能树范围外，可以暂时抵抗戒缚入侵。

尸钢(屍鋼(シバガネ))

于无明领域内以及其影响下，因未知的力场现象使生物及非生物的构成物质改变，并变成或生成类似金属结晶的物质。

生物被感染后，感染部位及精神的感觉会变得敏锐。

戒者(イマシメ)

普遍被认为是死者留下的负面情感与无明领域反应的产物，但实际上活人的强烈情感亦能产生。

由金属结晶聚合而成，即使受到攻击也可立即修复，必须把特制的钉射入要害才能将其消灭。

骸(躯(むくろ))

被称为“无明领域”的看门人。

有传言指听到“躯”的歌声的人会于九日内死去。

实际上躯是读岛岛民为了报复想要毁了他们一族的人们而将躯复活。

神隐孩子(神隠しの子供たち)

10年前从无明领域中离开并平安生还的奇迹之子。

读岛(読島(ヨミジマ))

篠目、皆志及鸫出生地。保管躯的核心的地方，因被无明石保护而没有于地图显示位置。居于读岛的一族拥有能利用心灵感应来交谈的特殊能力，且信奉著无明石。

10年前，因皆志的姐姐美明向夏入透露了岛民能用心灵感应来交谈的事，并曾带领夏入进岛，夏入亦于岛上建立了IX的研究设施。其后夏入为证明自己的理论，率领大量IX的人强行带走大量岛民。岛民被带至IX的相关设施，被夏入用作人体实验以证明其理论。最后被带走的岛民皆因接受人体实验的关系而全部死亡，只有少部分没有被带走的岛民生存。同时夏入为消灭曾经进行非法人体实验的证据而进行烧村。其后仍生存的岛民为了向毁灭他们的人们复仇而将驱复活，并由篠目、皆志及鸫三人把驱带至东京，进行无明石祭祀后便产生了无明领域。

岛上种植了大量久久能树，在10年前被烧村后全部枯萎。

复兴支援企业体IX(復興支援企業体イクス)

以川田原市九字町为本部所构成的企业体，有众多企业参与。主要目的为复兴因无明领域而遭受沉重打击的日本的产业及经济，主要从事制造业。

Gargouille(ガルグイユ)

无名领域特别调查队的驾驶员培训组织。

Vess(ヴェス(Vess))

通用多臂重型机器，为一个半人形机器人。由IX开发并贩售于市面上。

久久能智学院已使用此机器来进行竞赛等，而在学的学生也用以作为考试用。

Gargouille 使用的调查训练机为应对戒者已经改造过设备。

MA-Vess(マヴェス(MA-Vess))

用于调查无明领域内部的极限环境作业用机体。

搭载有保护搭乘者不受无明领域各种现象影响的机能，是调查队的实战装备。虽然原因不明，但拥有可以变化为3种不同形态的变形机能。

银(アージェント(Argent))

一号机，MA-Vess的原型机。由赤司驾驶，L.I.M 中为青司。

黑貂(セーヴル(Sable))

二号机。原本由兵斗驾驶，在后期则改由真亚梦驾驶，L.I.M 中为艾米露。

赤红(ギュールズ(Gules))

三号机。由皆志驾驶，L.I.M 中为篠目。最后一集被皆志拒绝后不久改由赤司驾驶。

白金(シロガネ(Shirogane))

由青司驾驶的 MA-Vess 前原型机。