园原水花(園原水花，声：悠木碧)
追击的击坠王。能力为绝不射偏的子弹追踪与里希特的战斗中使子弹凭空绕开里希特的剑，数字为固执的次数。是个眼镜妹，外形的最大特点是其巨大机械左臂，似乎暗恋里希特，但随后对救了她的杰伊爾也有好感，武器为左轮，微型冲锋枪等一系列武器。最后与武虎结婚并育有一子，名为“花虎”。
莫妮卡(モニカ，声：悠木碧)
代号“冰刃”，“灯火”的前卫组成员。艺术家的女儿，略带蓝色的银发。没有显著的特殊专长，但均衡实力是全队最好的人。缺点是极度自负、团队意识欠佳。加入“灯火”之后不久开始养成了看恋爱小说的习惯，被缇雅发现有了暗恋的对象。
多多音 美美(多々音 めめ(たたね めめ))
CV：悠木碧
14岁的职人。与小鸫同期入学的学生兼室友。
十分健忘的天然呆女生，连自己的名字也会忘记，而且迟钝得连害怕也不知道。绝招是“睡拳”，体能好。每晚都会不明原因地爬到小鸫的床上，有时甚至还会全裸。
健忘是源于魔女谢乌拉的控制，于第10集完全受其控制成为其手下。
克莉亚·库鲁斯(クレア・クルス，声：悠木碧)
来自巴雷特洛斯。15岁。范·维尔班的学生。
小时候因持有能自由操纵风的能力而被周围的人称为“魔女”，更遭到周围的小孩欺凌。
幼年时与母亲、弟弟同住，某日收税官来到家中要求克莉亚的母亲将小孩出售抵债，母亲在一番挣扎后选择的正是克莉亚，造成往后克莉亚害怕“不被人需要”。
克莉亚长时间受人指使乔扮成妮娜·维恩特作为革命象征，据克莉亚所言，她只要坐在那、做别人要求的事就会被人所需要。
在伊斯拉旅行中由于听到了关于卡尔·拉·伊尔的谣言，便怀疑卡路儿·阿巴斯可能就是卡尔·拉·伊尔。
在与“天空一族”的战争之后和卡路儿相遇时，确认了卡路儿的身份。在“天空一族”的再战中听到卡路儿“活下去”，从而使克莉亚恢复呼风能力，避免了舰队毁灭。在伊斯拉和“天空一族”达成停战条件后前往“天空一族”。
妮娜·维恩特(ニナ・ヴィエント)
“风之革命”的旗帜人物，伊斯拉管区长，真实身份即是克莉亚。
能自由自在地操纵风，被称为“呼风少女”、“统治风的处女王”、“圣阿尔迪斯坦的爱女”。在“风之革命”后了解到自己的能力为他人带来不幸而受到打击失去呼唤风的能力。
漆原静乃(漆原 静乃(うるしばら しずの)，声：悠木碧/同左)
1年1组/D级(真正实力是A级)/黑魔
前世被人称为“冥府的魔女”、“王佐的魔女”，是被诸叶(休·沙乌拉)解放的奴隶，其后成为他的伴侣。
家中富裕，兄长是学院理事长，但与兄长关系很差。喜欢诸叶，个性沉着冷静，但是一旦牵扯上诸叶就会动摇，经常为了诸叶而牺牲自己以身犯险，常常捉弄诸叶和早月。
由于家里的因素而在入学前一年就已经开始训练黑魔能力，再加上天赋过人的关系，在入学后就成为实际上的亚钟学园内拥有最强魔力的人，不但远胜于实战部队的副队长甚至也比学园长要强，在暑期集训时也迅速的达到四阶暗术的学习目标。
擅长冰系暗术，同时拥有可以化作冰龙型石像兵并且会自行应对靠近的敌人的固有秘宝“龙杖纳古拉维兹”，整体实力已达A级程度。不过由于个性懒散，不管是上课时还是实战部队训练时都没有展现实力，因此虽然拥有A级的实力但是却仍维持在D级。
可萝奈(ころね，声：茅原实里/悠木碧)
人造人，长著一张宛如洋娃娃般完美的姣好容貌，可总是面无表情。小腰包里有各色各样的秘物道具，拉动兔尾状的尾巴会暂停机能。
被派来监督阿九斗。非常喜欢捉弄阿九斗，其实对阿九斗抱有好感。
自身是由信奉玛库特神的教徒所送来的使者(请见动画第9集)。
鹿目圆（鹿目 まどか（かなめ まどか），Kaname Madoka，配音：悠木碧／黄紫娴（港）／克莉丝汀·玛莉亚·卡曼（英））
就读于中学2年级的平凡少女，但在正片时间轴的故事中，因其良好的魔法少女的资质，被丘比执拗地推销契约。
起初对魔法少女充满华丽的梦想，但在麻美惨死、得知灵魂宝石的真相之后有了不同的认识，对于是否缔结魔法少女的契约显得胆怯而犹豫不决，以“影响当事者的旁观者”的立场干涉其他魔法少女的行动。剧末终于确定自己的愿望，为了终结魔法少女的悲剧而与丘比缔约，成为消灭魔女的概念固定在宇宙中，在魔法少女之间以“圆环之理”（円環の理；Law of Cycles）的名称流传。
在剧场版［新篇］，做为圆环之理的概念，与沙耶香、渚2人进入焰的魔女结界。剧末遭到焰的暗算，再度成为“人类”自圆环之理分离。
魔法少女小圆
在故事中，鹿目圆自认是一个没有任何优点、且对任何人都没有帮助的人，这使得她很早就怀着“有一天能够帮助他人”的梦想。在见到作为魔法少女的巴麻美努力为了城市的居民消灭魔女后，圆就算没有愿望的诱因，也已拥有成为魔法少女的意愿，甚至开始想像自己成为魔法少女后的样子。但是受到麻美惨死的冲击，她很快便失去了交换契约的勇气。尽管她仍是没有魔力的“旁观者”，仍时常会以“当事人”的立场努力尝试帮助魔法少女们，有时也因此将自己置身于危险之中。此外，她也被丘比（QB）一再趁机设计而濒临交换契约的边缘，但多次均被晓美焰所强行阻止。在这一来一往的过程中，圆也逐渐了解到灵魂宝石（Soul gem）与魔法少女系统的真相。
在第10话回忆中的初次轮回，鹿目圆一开始便已成为魔法少女，并因此成为晓美焰跟进的契机。其后，为了拯救圆，焰经历了百余次的时间回溯，但两人之间的悠久因缘并不为他人所知，圆只在梦境中看过前次轮回的片段而已。魔法少女的魔力资质决定于其所牵涉的因果量，焰的轮回使得圆的因果线收束，让圆的魔力资质异常突出。其部分原理在于焰以“拯救圆”为目的而发动时间回溯，使得焰出院后的一个月成为“为了圆而存在的时间”，累积了庞大因果。依据丘比所言，圆因此成为不合理且最强的存在，在交换契约之后无论什么愿望都能够实现，甚至有着与神同等的全能力量。但相对的，圆也将成为最恶的魔女。在第10话演出的第4次轮回中，尽管圆成为魔法少女后能一击打倒魔女之夜，但随即成为“救济”的魔女，(因为人类身体没有办法承受过量的魔力)十天就可以毁灭地球。
在全剧终盘，圆一方面了解焰为了她所作的努力，另一方面也看到历史上许多魔法少女的痛苦经历，得知所有真相而不断苦恼后，圆找到了自己真正的愿望。在“怀抱希望本身绝不会是个错误”的想法之下，圆向丘比许下了“将所有的宇宙、过去和未来、所有的魔女，在诞生前亲手消灭”的愿望，从而改变魔法少女必将变成魔女的绝望，并成为“魔法少女圆”。圆的愿望使得宇宙重组，圆以魔法少女的型态出现在所有时空中，净化魔女化前夕的灵魂宝石，并引导死前的魔法少女，使之安息。鹿目圆成为“消灭魔女的概念”固定在宇宙中，既无所不在也无法被人感觉或记忆。这种魔法少女终将凭空消失的法则，被魔法少女们称为“圆环之理”（円環の理；Law of Cycles）。而在这个新世界中，鹿目圆成为自始即不存在的人，只剩下间接促进、并见证此一过程的晓美焰，还奇迹似保有“鹿目圆此人”的记忆和发带。此外只有圆的母亲询子以及弟弟达也，对圆的名字保有含糊的印象。
［新篇］叛逆的物语
在延续正篇故事的完全新作［新篇］叛逆的物语中，鹿目圆做为“圆环之理”以3种型态登场，分别是：魔法少女、最终型态（圆神）、圆环之理被撕裂后的中学生。其主要以第一种型态活跃于捏造的见泷原（伪街；false town）。
所谓捏造的见泷原，是晓美焰于彻底魔女化之前，在自己的灵魂宝石内侧构筑的魔女结界。结界重现了整个见泷原，并引入一众魔法少女与圆的亲友，窜改他们的记忆，重复著一边讨伐梦魇、一边上学的虚假日常生活。遗忘自己是圆环之理的圆，也是虚假生活的其中一员。
此一状况，其实是丘比为观测圆环之理所设计的策略，但“鹿目圆失忆”则出乎丘比的预料。本来，圆环之理鹿目圆，应该前来引导晓美焰，但被丘比透过一些手段中止了。众人齐聚捏造的见泷原这个舞台，让丘比得以完整观察“魔女”“魔女化”“魔女结界”与“圆环之理”现象的全过程，解析正篇故事结局之后“魔法少女死后消失”的缘由，借此寻找支配圆的方法，企图恢复传说中的“魔法少女魔女化”的旧世界因果律。
尽管丘比深信，鹿目圆的失忆，是因为被结界窜改记忆。但事实上，圆环之理的力量与记忆已分别由美树沙耶香、百江渚2人负责运送，与圆一同进入了捏造的见泷原。由于丘比的不察，让她们得以在暗中活跃，最后协助圆阻止了丘比的阴谋。
其后，取回记忆与力量之后，鹿目圆开始引导晓美焰，但却被焰反手捕捉，且被强行分离成“做为人类的记忆”与“圆环之理”两个存在。自称“恶魔化”的焰接管了圆环之理力量的一部分，重新改写了宇宙法则，力量耗竭的魔法少女依然接受圆环的引导，但“鹿目圆的人类记忆”则被设定为“时隔三年从美国归国的转学生”，重新展开普通人的日常生活。除了立场不同，一切宛如《魔法少女小圆》的正篇故事开头。
魔法少女小圆 `The different story`
在漫画外传《魔法少女小圆 ?The different story?》故事之中，故事背景与原作电视动画相同，鹿目圆对于身为魔法少女的巴麻美有所憧憬。其后好友美树沙耶香也选择成为魔法少女并与麻美一同作战，而鹿目圆则一边思考“找到更加坚定的愿望”一边跟在两人身旁。在沙耶香因为上条恭介与志筑仁美之间的关系心烦意乱时，圆主动向上条透露其左手奇迹治愈的原因，但不居功的沙耶香谢绝了圆的好意，并打算考虑一天再对上条托出实情。然而，沙耶香在随后的战斗中魔力耗竭，灵魂宝石彻底混浊而变成了魔女。
晓美焰为了圆的心情着想，遂对圆编出“美树沙耶香被魔女杀死”的谎话，但此举反而让圆更想要为了别人成为魔法少女。在最后一话，焰向麻美提出共同击败魔女之夜的计划，但是后者在听到杏子与沙耶香双双死亡的消息后陷入迷惘。焰离席后，圆亲口向麻美表示了加入魔法少女行列的意愿，并希望麻美能够“变回普通的女孩子”。就这样，对魔女化的真相一无所知的圆许下了“让沙耶香复活”的愿望，交换契约成为魔法少女。对此，焰认为是“巴麻美的言行诱发了鹿目圆的签约”，并痛责自己的失策。最后由圆、焰与复活的沙耶香一同迎战魔女之夜。
魔法纪录 魔法少女小圆外传
为了寻找失踪的巴麻美，与晓美焰一同造访神滨，并结识环彩羽一行人，结为好友，共享情报。其后，应美树沙耶香之邀再访神滨时，得知麻美成为Magius之翼的一员与魔法少女的真相，受到打击的同时，开始摸索解决方法。回到见泷原后，一度被阿莉娜·格雷关在结界里。受到佐仓杏子协助、逃脱后，结队攻入神滨，最终促使麻美复原，众人汇合。在Hotel Fenthope（ホテル?フェントホープ）崩坏之后，与众人对抗被Magius召唤到神滨市的最强魔女－魔女之夜。
在电视动画版第1季，只在片头曲画面、第10话的麻美回忆片段中现身，第13话提到了名字。
顺带一提，作为圆环之理的她于本作也是存在的，但由于环彩羽引发的各种蝴蝶效应使得她无法随便干涉本作的世界，一旦强行干涉就会对世界产生不好的影响。
魔法少女小织
在漫画外传《魔法少女小织》的故事中，拥有预知能力的魔法少女美国织莉子得知魔法少女系统的真相后，为了阻止拥有强大魔法少女资质的鹿目圆变成最邪恶之魔女，遂与吴希里华合作掀起见泷原的“猎杀魔法少女”风波，以便杀害圆。在这个时间轴，圆只是一名未曾见过丘比（QB）的普通中学生，与美树沙耶香、晓美焰结为好友，但未曾接触巴麻美。
在故事尾声，织莉子对见泷原中学发动攻击，大量师生无端遇害。焰被迫变身应战，并嘱咐圆躲藏于安全处。尽管最后织莉子遭到焰、麻美以及佐仓杏子的致命攻击，但仍在临死前成功击毙了远在墙外的圆，这使得焰带着懊悔与悲痛继续踏上时间的轮回。
露西（ルーシー，Rūshī）
配音：悠木碧（日本）
露西（ルーシー）是由TRIGGER制作的原创动画《赛博朋克 边缘行者》中的登场角色。
本作的女主角。夜之城的边缘行者，画眼影、穿露腰装的义体少女。嗜好吸烟。
性格内向，不喜欢谈论自己的过去。
真实身份是赛博朋克小队成员，性格直率，执行任务干净利落。看起来人畜无害，但会毫不犹豫地杀人。
与大卫是恋人。
认为夜之城是一座监狱，梦想是去月球，为此在家中购买了能够模拟月球上真实场景的超梦。主创Rafał Jaki以其母亲为本角色命名Lucyna，全名为Lucyna Kushinada，有着日本和波兰血统。
向井·铃(向井·鈴(むかい·すず)，配音：悠木碧)
以浏海遮盖眼部的盲眼少女，有着浓厚的个人风格，是武藏的人们的良心回路。有着视觉方面的障碍。
为补正视力障碍的缺陷，有了腰间和耳朵上的对物吊栅型感测器“音鸣小姐”提高了听力，能感知到周围难以察觉细微的声响异变。
最大感知范围为半径三十公里，即使武藏在航行中，感知位置的误差也在二十七公分内。
因为视力方面的障碍，不便目视文字，通常自己写出文章，然后由浅间·智代为朗读。
对小学时期就结识的葵·托利与赫莱森有好感。
