剧情是设定
在故事开始前的一百年，巨大的类人生物“巨人”突然出现，毫无理由地消灭大半人类。残余的人类建造了三道同心圆高墙，最外围的是玛丽亚之墙、中间是罗赛之墙、最内侧是希娜之墙，人类怀抱着摇摇欲坠的和平居住在墙内百年之久，许多人在墙内出生长大、不曾见过巨人。这一切在某一天起了变化，一个六十米的超大型巨人突袭并破坏了西干希娜区（玛丽亚之墙外）的城门，而另一个全身覆有似铠甲构造的铠之巨人则打碎了玛丽亚之墙的城门，让一大群巨人得以进入该区。人类被迫放弃了玛丽亚之墙和罗赛之墙间的土地，撤离到内部区域，导致人口变得密集，产生动乱和饥荒。
巨人是巨大的人型生物，身高通常在3至15米之间，他们的外观看似成年人类，不过都没有生殖器。他们似乎不需要食物，但会本能地捕吃人类，却不会袭击人类以外的生物。巨人没有消化系统，他们吞掉人类后，体内的黏液会将之包裹为黏糊糊的球吐出。巨人的皮肤坚硬，能迅速再生，除了后颈这个唯一的弱点以外都难以造成永久伤害。
人类为了对抗巨人而招募了三支兵团：故事的核心放在调查兵团，他们会策马出击，对充满巨人的墙外世界进行调查，试图夺回土地。由于调查兵团的伤亡率极高，但却又鲜能勘查到实质有用的情报，所以经常受到民众的无情嘲讽；第二支是人数最多的驻扎兵团，他们守卫墙内人民的和平；第三支部队是宪兵团，他们负责守卫王室，由于工作相对轻松及安全性较高，导致了腐败和许多政治弊病。士兵使用立体机动装置作为武器，这是一个绑在腰间的多功能装置，能发射钩绳以便在树木、屋顶和墙壁间移动，两侧有鞘放置双刀，主要用于割下巨人后颈致命部位。
墙内的政治实权在王政府身上，国王是没有实权的傀儡，亦存在类似国会的立法机关；而总统则是三个兵团的统帅，代表军方。但是王政府官员和议员都存在腐败问题，同时在议会上亦有部分派别议员反对继续提供资源给调查兵团进行壁外调查。随着故事的进展，傀儡国王以及王政府被推翻，但是实际权力仍在总统和三大军团手上。
故事大纲
《进击的巨人》故事围绕在主人翁艾伦·耶格尔、寄养于他家的三笠·阿克曼，和他们的童年玩伴爱尔敏·阿诺德三人的经历。在保护他们家乡的玛丽亚之墙被“超大型巨人”和“铠之巨人”摧毁后，艾伦亲眼目睹母亲卡露拉被巨人吃掉，立下誓言要杀光所有巨人，而艾伦父亲古利夏从此下落不明。艾伦、三笠及爱尔敏三人随其他难民撤退到罗赛之墙内，之后加入了训练兵团。
墙内篇
托洛斯特防卫战（1~4卷）
第57次壁外调查（5~8卷）
厄特加尔城墙战（9~10卷）
艾伦夺还战（10~12卷）
王政篇（13~18卷）
玛丽亚之墙夺还战（18~22卷）
墙外篇
马莱篇（23~26卷）
帕拉迪岛分裂篇（27~29卷）
地鸣篇（30~34卷）
在某块土地上，宝石人和名为月人的敌人作战，月人企图将宝石人带回月球。统领宝石人的金刚老师将编纂博物志的工作交给较弱的磷叶石，为了搜集资料，磷叶石被推荐去寻访带有毒素的宝石辰砂。尽管辰砂因为毒素会破坏大地而不愿战斗，他仍为了保护磷叶石而击退月人。次日，磷叶石驳斥了辰砂希望被带到月球的愿望，发誓自己可以找到适合辰砂的工作。
在一次战斗中，磷叶石被类似蛞蝓的生物吞食，辰砂找到了使他复原的方式，而磷叶石则发现自己有能听懂蛞蝓状生物温特里克斯斯的话。温特里克斯斯表示自己是安多米拉比利斯一族的王，还透露过去曾存在这片大地上的人类已分裂成三个独立的物种：象征骨的宝石、象征肉的安多米拉比利斯一族和象征魂的月人。温特里克斯斯想将磷叶石交给月人以换取自己被俘虏的弟弟，磷叶石获救后原谅了他，但也因此失去双腿。在安装上自温特里克斯斯得到的玛瑙碎片制成的新腿后，磷叶石发现自己能跑得非常快，并因此开始参与战斗，但光是巡逻任务就让他疲惫不堪。
冬季来临，除了原本就只能在冬天活动的南极石、睡不着的磷叶石和金刚老师以外，所有宝石都在冬眠。磷叶石被浮冰的声音引诱，落入水中后失去双手，他将一些金和白金做为替代品，但金和白金失控并开始吞噬磷叶石，此时月人袭来，南极石为了拯救磷叶石而被捉，磷叶石控制了新的双手并试图救回南极石，但却没能成功。磷叶石因为失去南极石而感到痛苦，个性也比以往更加内敛，随着春天到来，他已经掌握新的手臂并足以单独对抗月人，而他也因为金手臂受其他宝石瞩目。随着失去双手，磷叶石疑似失去关于辰砂记忆。
磷叶石的行为引起黑钻注意，黑钻希望他成为自己的伙伴，取代原本的钻石。在金刚睡着的次日，出现足以抵挡黑钻和磷叶石攻击的巨型月人，巨型月人进入学校并追逐钻石，感到不能再依靠黑钻的协助后，钻石凭借自己的四肢击倒巨型月人。黑钻赶来协助钻石，他们发现巨型月人被切断后会分裂成更小的个体，他们将这些型如小狗的个体搜集起来后恢复了原本的大小，金刚称这个月人为小白。磷叶石怀疑金刚与小白的关系，辰砂透露其它宝石都认为金刚与月人间有秘密，但仍决定跟随他。
为查明真相，磷叶石决定调查月人，他协助金红石修复莲花刚玉，莲花刚玉给了磷叶石关于与月人交谈的建议后再度沉睡。磷叶石向变石学习关于月人的知识，并试图在战斗中质问其中一个月人，但他的质问被辰砂打断而没有结果。磷叶石想起两人的承诺，为辰砂找到了新工作：协助自己调查月人和金刚的真面目。
第一季
在遥远的过去有着光与黑暗的战斗。然后在那场战斗中有七位叫作光之战士的人们以他们的力量封印黑暗而结束战争。那个故事最后也成为神话，他们所持的影之力也被他们的后裔秘密地继承著。
然后有位古兰王国之王奈那发现自己的影之力，为了征服世界而展开杀戮和破坏。而同样拥有影之力的左拉为了阻止他的野心于是与七名光之战士的末裔吉罗一起找寻剩下的末裔。在塔塔村中则有着两位每天过着和平日子，希望成为骑士王的修和青梅竹马克露克。他们所住的地方也遭到古兰王国的攻击。在战斗当中修的影兽“蓝龙”也逐渐苏醒过来。于是修为了打倒奈那然后让悲伤不要被扩大，修一行人决定与左拉一起行动进行冒险。
第二季
在黑暗被封印的两年后，世界免于被灭亡的危机，但是战火却依然不停，打算统治世界的洛基带领蔷薇十字军团与反抗军勒茍拉斯亲卫队持续斗争着。修与布凯也一起以勒加拉斯亲卫队的一员在战斗着，有一天知道影使者事情的谜之少年诺伊出现而且他正被一只红龙攻击著。因为诺伊的力量让修的蓝龙复活并且击退它。 之后修住的地方出现叫作米歇艾尔的红龙，并且像是在做什么测试般地开始对修展开攻击。同时洛基的根据地也出现叫作洛妲的神秘人物，她让洛基的奥丁复活之后就毁坏洛基的首都。他们把自己称为“高等生命体”并且引起各种事件，修他们在知道世界开始展开异变后，决定要展开找回过去同伴而踏上旅途。
兵器
影黑壹式
虽然是机器人、但却能够叫出影兽来攻击。利用孩子们的能量来运作。
影黑贰式
壹式的改良型。同样影兽的实力也增强。
影黑参式
影黑系列的完成型。虽然没办法叫出影兽、但却拥有与影兽匹敌的战斗力。也有会因为奈米机器而不断复活的影黑参式改。另外、从参式以后的机型也能在空中移动。
影黑四式
影黑系列最新型。到参式都是全自动型、四式则是能够让士兵穿着变成像是强化服的类型。中间能够有人进入操控来战斗。最初由蔷薇十字军团军使用、之后成为勒茍拉斯亲卫队的主力。另外还有蓝色的修専用机、能够拿来破坏六式。
影黑六式
蔷薇十字军团军主力的影黑最新型。其压倒性的能力让勒茍拉斯亲卫队陷入苦战。
加雷翁
奈那所搭乘与游戏版一样的移动空中要塞。拥有强大的武力、要塞下半部也拥有一个能消灭一国威力的大炮。后来修的愤怒的一击打倒奈那使加雷翁坠落。第二季中被新生蔷薇十字军团占领为临时据点(洛基在这里隐居暗中整军备武)来秘密开发兵器、开发斯莱布尼尔、建造弗雷史贝鲁克，后来因为启动弗雷史贝鲁克而崩溃。
飞行战舰
古兰王国军、萨巴鲁军、蔷薇十字军团军所用的战斗用飞空艇。第二季中成为蔷薇十字军团军的主力、第1话中也像是旗舰的身份登场。
诺古
古兰王国的老战舰。拥有舰长（声 - 赤城进）、副长（声 - 铁野正豊）、机关长（声 - 御园行洋）和机械兵等战力。因为黛尔芬妮恩有搭乘过、为了消灭证据而被她给破坏掉。之后被霍美洛所救，为了报恩而告诉修他们补缀的七页的下落。
洛基专用飞行战舰
第一季中洛基使用的飞行战舰。全身为红色。拥有援护射击等各种活跃的表现、后来在黑暗中被一堆暗影包围而自爆牺牲。
灭影能量炮
纯白旅团拥有，对付影兽的巨大移动炮座。虽然拥有打倒高等生命体的威力但也有机动性的问题。通称为‘铁乌龟’。也有和这个一模一样的‘对影炮’的存在。
斯莱布尼尔
新生蔷薇十字军团所开发，比影黑参式更强的机器人兵器。搭配有能驾驶一般战机的性能并且可由少数驾驶员以脑波操控大量无人机的系统。会从五只像是尾巴的东西发射出光束
(注：斯莱布尼尔出自北欧神话)
对影用火箭炮
能够手持且只有一发弹药的对付影兽用兵器。虽然威力比灭影能量炮还弱（只有8分之1）但仍有把剑虎的手腕轰掉的威力。
纯白旅团旗舰
纯白旅团专用飞空艇。有普莉拉的专用房间。
战斗机（纯白旅团）
纯白旅团的战斗机。拥有攻击力和速度。也搭配有对影用火箭炮。
弗雷史贝鲁克
新生蔷薇十字军团所有的巨大战舰。搭配有斯莱布尼尔并且装备有世界树巨炮。
世界树巨炮
新生蔷薇十字军团所持有的巨大能源炮。威力有着与加雷翁一样可怕的破坏力。
国家/组织/地名
古兰王国
以奈那为王的军事国家。因为拥有以人工作出来的影兽技术、所以拥有压倒性的军力。之后在奈那被打倒后就灭亡。又译“戈鲁昂帝国”。
吉普拉鲁王国
由吉普拉鲁王统治的国家。是个城堡都市、拥有以叫作海克萨斯其鲁金属所作的坚固城墙、在过去两百年间都未被攻破。但之后被加雷翁的大炮给毁灭。拥有由康拉德所率领的近卫骑士团，和被叫作赛普洛古斯的火枪兵部队。又译“直布罗王国”。
蔷薇十字军团
古兰王国灭亡后，洛基所创立的组织。目的则是要为世界带来秩序。
阿尔巴罗兹
蔷薇十字军团首都。其后被洛妲雷丝给破坏。
珂琳
用情报来贸易的城镇。
萨帕鲁
古兰王国的原同盟国。经常受到他们的军事援助，但因为不同意古兰王国要征服世界的思想而与其同盟破裂。
拉库利玛
由长著翅膀的人(联想到天使)所住的国家。被古兰王国的空中要塞加雷翁给毁灭。
布拉帝森林
拥有恶魔和令人害怕的乌鲁巴库、是个充满危险怪物的危险地带。
卡斯提罗戴拉提斯塔
古兰王国的基地。
阿鲁卡兹收容所
接近卡斯提罗戴拉提斯塔的收容所。康拉德曾被抓到这里。
纯白旅团
由塔鲁科夫斯基所创立的组织。目的是要排除所有的影兽、实际上以普莉拉的预言来行动。
尼鲁瓦那
白色旅团根据地。第二季开头动画所出现的城市（为白色旅团两名成员背后的背景）。
莱巴哈
宗教都市且相当有历史。地下拥有龙的神殿（天界的观测站）。但后面被法基诺及希尔德嘉的破坏让城市一夜间被毁灭。
奈斯特
根据康拉德一行人所说、是个被瀑布包围、在另一边则是充满花田的神殿、有个被认为是古代人所做的黄金小石碑。那里刻有祖梅的地点。
法尼塔温
修他们旅行时所经过的街。街上拥有以美女大姐姐所卖的惊奇蛋糕（能从蛋糕中跑出人）为话题的蛋糕店。
萨巴兰其耶
美食之街、拥有许多的料理高手和美食家。但被法基诺使用龙之鳞控制当地的向导得到影兽力量而破坏。
阿塔鲁村
蔷薇十字军团为了破坏世界之壁而占据的村子。世界树巨炮会造成周遭被破坏，所以让村民想要逃难、但最后被修所救而免被于被毁灭。
摩雅
希尔德嘉给与修他们试炼的街。街道相当美丽，除了有一座会发出红烟并把旅客当作囚犯逮捕并且强制他们工作的工厂，最后因为被修他们解放，让他们对摩雅发动战争。
祖梅
诺伊和康拉德他们所去的神殿、位于充满瓦砾和火山带的荒废地方。在神殿最深部、有着过去和高等生命体见面并且能前往天界的道路。另外在那里有个像是质量投射器的机械、搭乘这个就能前往天界的神殿。在那里也有许多的龙在那里沉睡着、只要让它们醒过来就会前来攻击。
弗尔肯瀑布
布凯和玛鲁玛诺根据普莉拉的预言所到的地方。四周有瀑布，另一边则是一座花田，那边也是能够拯救克露克的所在地。
凯札史贝鲁多/天界之城
高等生命体的据点、有防御系统(战机)、有着到天界之城的路，在那里有许多的龙，也是一个能够依据鲁道尔夫的意思而改变成龙型的移动要塞，天界之城原本模样已经崩溃。据说天界之城(龙型)是鲁道尔夫的真正模样。最后鲁道尔夫战死而天界之城(龙型)跟着一起毁灭。
用语
影兽
从人的影子出现的异形。能够加以操控它们的人被叫作影使者。过去被认为是七名光之战士才有的特殊能力。谁都可能会用出来，但在日蚀时出生的人，最能够有这种能力。但因为奈那的装置，而能够用人工的方式制造出来。
有像蓝龙那样拥有自我意识，但也有什么都没有的影兽。
黑暗
过去被“七名光之戦士”封印。在奈那被打倒后，经由左拉的手给解开三十五万年的封印并且开始吞食这个世界。接触黑暗的人会从内部被侵蚀消灭掉。
黑暗势力
从黑暗出现的影兽都被叫作暗影。虽然一击就能打倒，但攻撃力相当高，还会集体攻击。有将人吞食进去变成暗影的能力。有少数的暗影拥有比能力提升的影兽更强的能力。
创始之书
写有拯救世界的战士们的神话的世界最古老的书。也有制作数个手抄本。
补缀的七页
和“创始之书”原本一起存在的最后的七页。在这七页中拥有让影兽能力提升的方法并且全部加以暗号化。
精神增幅装置
通称增幅装置。可以让影兽能力提升，但持续使用会让身心都陷于疯狂。
高等生命体
天界的居民，他们本来样子都是龙，自称为“全宇宙生物的主宰”。会寻找‘候选人’来加以试炼。在本作中并没有描述他们的原型是外星人，但他们从以前就守护着地球并且在光与黑暗的战斗时就开始介入。日文汉字表示为“上位生命体”。
候选人
由高等生命体寻找作为影使者的下界代表。因此让他们以修、洛基、克露克等七名光之战士为目标。
龙之鳞
会进入对象的体内，给予各种力量的物品。也能够生出使用者的分身。
神喻仪式
由纯白旅团的巫女普莉拉，进行未来的预言（神喻）时的仪式。神喻也因为可由普莉拉和电脑连动预测对方未来的正确动向而成为一套情报系统。
情报师
受到请求给予各种情报的工作人员。霍美洛和苏则被说是里面最高等的情报师。
骑士王
骑士的最高位阶。他国也拥有各种骑士王。
普留那古托
纯白旅团制作的对影用大剑。只要解除限制，就能够发挥出对抗高等生命体的攻击的威力。
飞龙
高等生命体，创造的生物，具有极高的移动速度。
巨大的飞龙
有五种，具有比飞龙还要强大的战斗力。
剧情描述一位12岁少年小杰·富力士寻找父亲——金·富力士的故事。猎人（HUNTER）一词是故事设定的世界中各种领域的社会菁英。此外，此本作的角色及设定用语请参考以下条目介绍。
猎人试验篇 No.001－038（单行本1卷 - 5卷）
自小生长在鲸鱼岛的小杰小时候因误入母狐熊的势力范围，就快要被攻击时，一名路过、名叫凯特的男子救了他。原来凯特是他的父亲──金的徒弟，凯特告诉小杰许多关于他的父亲及猎人相关的事情，因此小杰对金及猎人这个职业有很大的憧憬。他在考试的过程中结识酷拉皮卡、雷欧力、奇犽等好友，并与西索结下再战之缘。最后，在互相帮助下小杰通过试验成为猎人。
揍敌客家族篇 No.039－043（单行本5卷）
小杰、酷拉皮卡和雷欧力皆通过了猎人试验，为了带回回到家族的奇犽，三人往奇犽的家出发。三人顺利地来到奇犽家门口却无法进去，原来要进入揍敌客家必须打开沉重的“试炼之门”，否则就会被看门犬视为入侵者后咬死。后来在大门看守人皆卜戎的协助下，三人终于具备开门的能力，往本邸前进。被囚禁在家的奇犽在得知小杰等人已来到家中，在与父亲长谈后便前往与其会合；虽然奇犽的母亲反对父亲这么做，但奇犽的父亲却意味深长的表示，奇犽总有一天会再回来。
在奇犽还未与三人会合的空档，揍敌客管家梧桐对三人进行“猜铜板”考验，并透过此考验给予小杰忠告。四人再次团聚后，雷欧力为了准备医学院的考试要离开，奇犽和小杰则一起行动，酷拉皮卡则在猎人试验时，从西索口中得知幻影旅团线索与西索约在九月友克鑫市碰面，在那之前准备利用猎人身份开始工作与寻找族人的眼睛“火红眼”，四人相约在九月一日友克鑫市见。
天空斗技场篇 No.044－063（单行本5卷 - 7卷）
小杰为了要再次与西索交手，便与奇犽一起去天空竞技场修练顺便赚钱。在那里，奇犽和同年的智喜对战，并对智喜未知的力量感到疑惑，两人见到智喜的师父云古、得知那是神秘的念能力，云古便协助他们开发这种力量。因为小杰在修行“凝”时，所放出来的念能力，表现令西索激赏，也因此西索答应与小杰展开战斗的约定。虽然结果是西索轻松胜利，不过小杰也终于还了西索在试验时给予协助的人情，之后小杰和奇犽跟着云古和智喜修练，某天疾斗及狸狈多以卑鄙手段逼迫两人与他们展开战斗，但最终结果由小杰和奇犽获得胜利，此战过后两人也离开天空竞技场，决定回到鲸鱼岛。
返回鲸鱼岛篇 No.064－070（单行本8卷）
小杰与奇犽回到小杰生长的故乡──鲸鱼岛。而后米特阿姨把小杰父亲金?富力士所留下的小箱子交给小杰。小杰从而得知“贪婪之岛”（G.I）的存在。
拍卖会篇 No.071－119（单行本8卷 - 13卷）
主角4人再次在友克鑫市相遇。故事世界中最大规模的拍卖会在友克鑫市举行。小杰、奇犽和雷欧力涌进各种方法筹集资金购买名称为“贪婪之岛”的游戏，这是藏有金的线索的游戏，在过程中也与酷拉皮卡的仇人幻影旅团发生冲突。最后小杰和奇犽顺利得到玩游戏的资格，四人再次各自旅程。
贪婪之岛篇 No.120－185（单行本13卷 - 18卷）
小杰与奇犽进入由金与他的朋友们所制作──猎人专用的梦幻电玩游戏《贪婪之岛》，当他们进入游戏之没过多久就见识到此游戏的危险之处──并遇到了神秘少女比司吉，她看不下去小杰和奇犽的战斗方式，要他们拜自己为师，之后两人在比司吉的指导下修行并且一路闯关，在最后打倒了贪婪之岛中的凶恶玩家炸弹魔甘舒，并取得一百张卡片、破关成功。
蚁王篇 No.186－318（单行本18卷 - 30卷）
小杰与奇犽使用贪婪之岛破关奖品打算去找金。但是在那里等著的并不是金，而是凯特。凯特他们在未确认生物的探索和调查中，发现巨型嵌合蚁的残骸，一行人前往NGL。小杰和奇犽了解嵌合蚁的强大，在凯特的牺牲下逃出NGL。在讨伐队还尚未准备完全之际，嵌合蚁王诞生了。王率领直属护卫队和一部分士兵，在背后统治东果陀共和国，打算进行‘选别’（挑选）。为了防止更多的人死亡以及为凯特报仇，小杰一行人再次向嵌合蚁挑战。
十二支会长篇 No.319－339（单行本30卷 - 32卷）
十二支登场，尼特罗会长于嵌合蚁之役死后，从猎人协会会长退位，开始选拔新的猎人协会会长。全世界的猎人为了新的猎人会长选举一事纷纷开始活动；另一方面，奇犽为了拯救伤重的小杰而再度回到揍敌客家族。
暗黑大陆篇 No.340－ （单行本32卷 - ）
有天自称尼特罗之子的比洋德·尼特罗在卡丁帝国支持下向全世界发表招募同伴前往暗黑大陆的影片，在十二支们接获V5所发出的“追捕比洋德”命令的同一时间，比洋德主动前来被逮捕并要求交换条件──十二支需陪同他一起至暗黑大陆。同时雷欧力和酷拉皮卡加入十二支并接替十二支的子、亥之位置。
金以No.2身份加入比洋德雇用前往暗黑大陆的专家团队，后来当卡丁帝国的船发出后，和其他包括12支的猎人也登上船，酷拉皮卡成为第八王妃奥伊特和第十四王子的保镖，其目的为第四王子手上收藏的族人眼睛。船的目的地为邻近暗黑大陆边界的假想“新大陆”，航行过程中，王位争夺战正式展开。