在东京街头，一切成谜的吃人怪兽“喰种”正悄悄的在人类世界扩张势力。
平凡的大学生金木研因为遭到喰种猎食而性命垂危，医生为他进行了器官移植手术，不料器官提供者其实就是猎食他的喰种。在病床上醒来的金木很快就感觉到身体不对劲，原本记忆中美味的食物全都走味到难以下咽。
一开始，即使好几天不吃东西他也不会饿，但不久，激烈的空腹感开始折磨他。当他意识到，能引起他食欲的对象只剩下街上擦身而过的男男女女，他绝望的日子也就此开始──
2029年，日本因突然爆发的”Apocalypse Virus（天启病毒）“的蔓延而陷入了混乱之中。处于无政府状态的日本，受到了由超国家之间所组织成的名为“GHQ”的组织的武力介入并接受其统治，东京的六本木更成为被封锁的地区。之后又以名为“lost christmas（失落的圣诞）”的事件为契机，日本失去了独立国家的实质权力，并被赋予了表面上的自治权，由此人们开始享受短暂的和平。
时光流逝，10年后的2039年。少年樱满集怀抱着抑郁的心境，并对世间冷眼相待。樱满集是在天王州第一高校就读的高中二年生，与同学们保持着一定距离的同时，度过着闲散而又平静的日子。
然而集安稳的日常在某一天突然宣告结束。那天放学后，在自己中意的老地方和一名少女不期而遇。少女名为楪祈。她正是集所憧憬，并在网上有着巨大影响力的歌手。而她也有不为人知的一面。祈正是由17岁青少年恙神涯所率领的“葬仪社”——一个在被封锁的城市中歌颂着从”GHQ“手中得到”日本的解放“而赌上性命不断孤独地战斗着的抵抗组织——的成员之一。
集在祈与涯引导之下，与葬仪社而发生了关联。尔后因为关系紧迫获被女主使用了虚空基因组，他的右手上出现了“王之刻印”。通过刻印，集可以自在地从人的身体里抽取出名为“void（虚空）”的物质，并以借此为武器得到战斗的力量。然而这也仅仅是，他所背负的“罪之王冠”的物语的开幕罢了……
月读锁锁美是一名名符其实的家里蹲少女，身为樱之花咲夜学园的1年级生，她对任何事也提不起劲，即使是穿衣服或吃饭也是不想动身。而负责她的起居饮食，与她一起居住的哥哥月咏神臣却对此一点也没有抱怨，因为这位身为樱之花咲夜学园教师的哥哥是一位拥有奴隶体质兼恋妹狂，即使他被妹妹蔑视他的奴隶体质，他还是非常溺爱妹妹，甚至抱有恋爱的意味。虽然妹妹对任何事都提不起劲，但她还是每天坚持着透过电脑，用她发明的「哥哥监视器」，以她哥哥为中心来观察她哥哥以及他身边的邪神三姐妹的日常生活。锁锁美之所以要监视她的哥哥，因为神臣是拥有凭意志改变这世界的能力，因为不想哥哥胡乱使用神力，所以身为妹妹的她唯有观察著哥哥，稍为努力一下阻止她哥哥的暴走。
很久之后的未来，人类生活在被岩石隔绝的地带“殖民地”(コロニー)。殖民地外面的未开发地带称为“迷宫”(ラビリンス，Labyrinth)。冒着生命危险去开拓迷宫、标示未开发地带的人，就是“标记者”(マーカー，Marker)。
草薙护堂，他是一位弑神之人。弑神之人能够篡夺神的权能，而拥有那种力量的人类王者，被称为“Campione─弑神者─”，同时他们也被称为霸王或是魔王。拥有这些秘密的高中生草薙护堂，期盼的只是平淡无奇的日常生活而已，但是自称护堂爱人的女魔术师──艾莉卡，却让他卷入与不顺从之神的邂逅！？
在弑神者的世界里，人们编织了各式各样的神话，而神话又造就了各式各样的诸神，众神本应也如在各自的神话中维持着本应有的角色，使世界正常运行，但却不是所有神也安本分地顺从自身的神话角色，这些被称为“不顺从之神”是会带来灾祸的，因此出现了一些能够击倒“不顺从之神”的人们。被称为“Campione”弑神者的他们，除了拥有弑神力，也是被称为至高的王的魔法师。新的神话所交织出的BATTLE FANTASY开幕。
“我愿意成为你的式神，一直在你身边，永远保护你。”
很久以前，年幼的男孩对着女孩定下约定，在他还不知道“将来”的意义之前──
大战时期，日本帝国陆军为将咒术运用在军事上而重新建立阴阳寮，并派任传说中阴阳师安倍晴明的后裔，土御门家当家的天才阴阳师土御门夜光担任统领，而夜光成功缔造日本咒术界的改革，成为现代咒术之父。
但在大战末期，处于败势的帝国陆军要求夜光实行大规模咒术仪式以挽回局势，但结果仪式失败，不只做为执行者的夜光身亡，还强烈的扰乱首都东京的灵气，使东京百鬼夜行、妖魅纵横。直到了战后阴阳寮改名阴阳厅，负责处理日本各地－主要是东京－发生的灵力灾害，而阴阳师也因而活跃在现代的舞台之上。
土御门春虎是个出生土御门家的少年，虽身为阴阳师名门后代，却毫无阴阳师才能可言，过着一般人的生活。某年夏天，春虎遇见了他的童年玩伴，也是土御门家的下任当家的少女夏目。过去曾允下承诺如今却分道而行的两人，在此刻相见之后，土御门的历史开始转动了起来，将要引领他走向充满曲折的“未来”。
某天突然出现了名为“龙”的怪物，让整个世界陷入恐慌之中，唯一能对抗它们的，就只有拥有灭龙之力，且多数都是少女的“D”。而身为唯一例外的男主角物部悠，有一天突然接受调职令来到密得加尔，除了必须要在全是少女的学校生活之外，同时还必须运用“D”的能力与龙对抗。
“D”("D")
黑之弗栗多现身之后，开始持有灭龙异能的孩子的总称，全称为“Type Dragon”。
与弗栗多同样持有上位元素生成能力，并从空无一物的地方将上位元素变换成任意物质。此种能力拥有相当高的价值，过去亦曾有为了抢夺“D”演变成战争的情况。因此联合国决定把“D”规定为龙的一种，并视为世界全体的资源，由国际组织阿斯嘉进行管理。
最初阿斯嘉旗下的军事组织尼福尔以保护之名，捕捉全世界各地的“D”，并将之隔离在名为密得加尔的孤岛。但随着“D”的年龄成长，也开始主张人权。以后连有力财阀和历史悠久王家的女儿中也出现了“D”，令取得契机的密得加尔取得了自治权。
目前“D”对现在的产业已是不可或缺的存在。若是失去密得加尔的供给，会令已经将近枯竭的资源价格暴涨甚至引发世界大战的危机。同时，目前而言也被认为只有“D”具有打倒龙的可能性。
愈是接近弗栗多通过的场所，“D”的发生率就愈有偏高的倾向。因此弗栗多最初出现的日本，诞生了最多的“D”，因此在密得加尔的学生中以亚洲少女居多，而密得加尔亦是以日语为公用语言。此外，由于“D”的能力觉醒往往是在第二性征之前或之后的孩子，“D”以15—16岁居多。相对地年幼的“D”较少。
在20岁前后或是怀孕就会开始失去上位元素生成能力(实际上大约三个月能力才会完全消失)。
据弗栗多所言，“D”不想失去上位元素生成能力的唯一方法是成为真正的龙。而弗栗多给予“D”上位元素生成能力的真正原因是藉其设计的自动生物体变换机制，让“D”的身体进化为龙。不管进化为任何的龙，都会使“D”的能力永久固定，不因年龄增长或怀孕而消退。相反，身体成熟之后如无与龙同步的可能，就会失去上位元素生成能力。
龙纹(竜紋)
为“D”与生俱来的印记。龙纹的大小会随上位元素生成能力而改变。
其实是弗栗多所设计，让“D”变成同种的龙(即龙伴侣)的连结手段。龙要选中“D”需要两个条件，一是龙方面有着强烈渴望“伴侣”的冲动，二是发情状态的“D”当中有精神波长吻合之人。满足两个条件以后，龙与“D”就会透过龙纹建立精神连结。
连结建立以后的表现是被龙看上的“D”的龙纹会开始变色，在一段时间以后，肉体的固有波长亦会同步而令龙纹完全变色。一旦该龙纹变色的“D”接触看上她的龙，就会变成同种的龙。若果两只龙看上同一名“D”，龙纹的颜色为支配力较强的龙。
有意思的是，人类姿态的抗体龙种与“D”(如伊莉丝等人)因为一开始就有着“人类”这个相同性质，所以无需肉体同步的过程，在精神上也容易同步。
在二年前的克拉肯之战前都没有人知道这事，证实这事实以后却足以令人震惊。在那之后也让密得加尔的机能出现根本上的改变。因此在密得加尔准备讨伐巴西利斯克以前，甚至以临时实施健康检查之名检查“D”的龙纹有否变色。
第14卷、安哥鲁莫亚1号袭来时，弗栗多借由调整人类形代，以修改悠的生物体变换机制并且所借予的部分真正的第七权能。使得他以后接获安哥鲁莫亚的瞬间，发动机制转变为同种。
龙化
为生物转变为龙的现象，目前原因有三。
第一种是借由弗栗多提供能使用上位元素的因子，再和与其频率完全同步的龙接触后，以自身上位元素作生物体变换为同种的龙(龙伴侣)。这方式甚至可覆盖以下龙化的原因。但持有“全知回路”的话，可对自身的生物体变换作出干涉。
第二种是完全的继承龙的权能，并且使用其完全甚至以上的力量，在期间作生物体变换并且变成相对应的龙。弗栗多解释这是容器为配合内容物而改变，但洛基少佐指出改变的原因是器量太小。某个意义上，变成赫瑞德玛也算是这类龙化。
第三种仅适用于权能“全知回路”，为取代原中枢系统以后成为其新中枢。这种龙化需要的不是生物体变换，而是能够发出操纵植物网络的电波。反过来的话，就是从脑中被植入病毒以后，被其侵蚀意识并受到控制。
权能(権能，Authority)
本作对于龙的各种能力的总称，由世界所孕育的龙都是获得这能力所变异而成的。
虽然可藉上位元素变换成其他权能，但其实以不经过上位元素的方式，比较能发挥权能本来的力量。
权能继承自何处是以因果的深浅来决定。其中最强的因果是产生于“杀戮者与被杀者”之间，其次是亲子血缘。只要涉及血与杀害的因果，继承率就大增。
如因持有者自然死亡或自尽等原因的没有继承对象，权能就会碎片化并且扩散削弱。
此外，持有权能的龙亦可借由伴侣关系或借由看上时的精神连结，主动分散让渡给其他人使用，但分散以后的力量会因扩散而有所减弱。
单一个体(例如人类)能从先天获得或后天继承或让渡的权能数量不明。
上位元素(上位元素(ダークマター)，Dark matter)
“D”所生成的万能因子总称，外观如同棒球大小的黑色球体。使用时会伴随着次元微动。
能够变换成任何物质或现象(包括其他权能)，最广泛应用的转换物质为空气，可以用来攻击、防御与移动。
上位元素理论上也能进行活体变化，这行为被称为“生物体变换”，最简单的表现是治愈自己或他人的伤口。然而生物的身体实在太过复杂，不是单凭想像就能重现，一般被认为如不是龙或是脑部有着同等的处理能力的话无法作生物体变换。但其实是弗栗多对奇力以外的“D”设下限制，以免她俩能够进行生物体变换。
事实上上位元素是星球的未来及生命的根源，当其耗尽，世界也将终结。生成上位元素，就是在预支未来。如变换为无机物，对其残量几乎不会有影响;但将上位元素花费在生命时，就会消耗“未来的可能性”，特别是涉及“起死回生”时。
于第七次灾厄当中，该元素成为了黑之乌洛波罗斯的权能。现在该权能由弗栗多所继承，而“D”能生成上位元素是因为弗栗多散布能使用上位元素的因子。
上位元素理论(上位元素理論)
一个由学者们提出的假说名称。上位元素不是任何物质或现象，就物理上的定义来说，甚至不算是存在。由于普通人类无法理解只有“D”才能以感觉理解到的上位元素的存在，因而创立该理论作为假设。
该理论假设上位元素可以变换成三次元世界中的任意物质，因此它被认为有可能是高一个次元的物质。假若上位元素是四次元物质，那么为了定义它的存在，就需要四条轴线。
至于第四条轴线为何则仍然未明。目前最有力的说法为那是与精神十分相近的某种存在，因为上位元素的型态会随着生成者的意志而改变。
秘银(ミスリル，Mithril)
理论上最安定的物质，只能借由上位元素变换而成。
除伊莉丝外，即使失败也只是比重不对，因而变质成相近的金属。
基本上能够防御所有攻击，但唯独对反物质无效。另外强力的“灾厄时间”亦会将其风化消灭。
为克拉肯的触手与克拉肯兹拜于少女模样时的头髪的构成物质。
灾害指定(災害指定)
尽管“D”的能力为黑手党和恐怖分子利用是不寻常的事，少数的“D”却会自己主动展开恶行。这时，这些“D”的行为会被视为灾害指定。被视为灾害指定的“D”将不被视为人类，而是被视为歼灭目标。目前的例子为奇力·史尔特尔·穆斯贝尔海姆。
信奉龙团体(ドラゴン信仰団体)
把龙视为神并且敬仰、崇拜的团体。他们在这个遭受龙所威胁的世界中，相信自己是龙的使徒，并借此保持精神上的安定，以及获得安全感。该类型团体中的恐怖组织为“穆斯贝尔之子们”。
排斥龙团体(ドラゴン排斥団体)
把龙视为人类敌人并且主张将其排除的团体。亦是与信奉龙团体相互敌对的团体。
一处位于乡下的宁静村庄，发生家畜陆续诡异死亡的奇妙案件。 为了解决这起案件，一位穿着显眼服装的名叫“隐神”的男子， 被从东京找来此地。在调查过程中，男子与一名居住村内，被旁人叫“ 泥田坊”，有着神秘气息的少年相遇。
白血球、红血球、血小板、巨噬细胞、记忆细胞、细胞毒性T细胞、NK细胞、B细胞、肥大细胞……等等。人类细胞的数量，大约有60万亿个！它们全体，在人体内全年365天、一天24小时不眠不休地工作!和侵入体内的细菌、病毒、异物彻底战斗!那里有着细胞们不为人知的故事!Sirius新人奖出身的清水茜描绘的、细胞拟人化的奇思妙想!”
本作品是将人体内细胞拟人化的作品，为获得了第27回少年Sirius新人奖大奖、具有很大影响力的漫画《细胞的故事》(『細胞の話』)的连载化，同时也是作者清水茜的初次连载作品。主角定位为白血球和红血球，角色统一为细胞种类的名称，所以并没有单独名字，细菌之类的会被描绘成怪物。