故事发生在虚构的、在废弃堆填区上兴建的未来城市-洲笼市。这个城市曾经发展急促，但现在人口正逐年减少。
在暑假前数天，一位神秘又无表情的女子-园崎法子告诉他的同学阿形胜平，他被选为一位“羈絆者Kiznaiver”，因为他感觉不到疼痛。他们一起体会到共享疼痛的羁绊。这种羁绊可让胜平分享他的痛以及联系与他生活、性格都不同的的同学。而他的同学，包括法子在内，都是不同的“羁绊者”。
这个羁绊系统的最终目标是透过伤痛连接众人回忆及经验，创造世界和平。当一位羁绊者受创伤时，系统会把他/她的痛苦转移到其他的羁绊者身上。胜平的同学们承担彼此的痛苦，而法子负责分配大家的任务。
原作漫画
双星相识篇(漫画第1-18话;动画第1-20话)
阴阳师候补的少年焰魔堂辘轳舍弃了过去想成为阴阳师的梦想，每天浑浑噩噩的度日。某天，辘轳与同为阴阳师的少女化野红绪一同被选为“双星之阴阳师”，赋予了两人将会结合，诞下“神子(太极)”以终结长年来和“污秽”的战斗的使命，并强制两人同居过着夫妇生活。被迫接受而对此感到不满的两人就此踏上了同心协力祓除污秽的道路之上。
双星黎明篇(漫画第19-33话)
双星两人为了前往土御门岛打倒石镜悠斗，斑鸠家的斑鸠士门和斑鸠小夜对双星进行测试，期间由于小夜咒力太强，因而被婆娑罗圣丸和冰铇发现并将其绑走，双方便展开激战，最终成功击倒圣丸和冰铇、救回小夜，但却也让红绪失去了咒力。
土御门诸岛篇/御前试合篇(漫画第34-50话)
辘轳与音海茧良终于抵达了众星云集之岛──土御门岛，上岛后面对众人对双星的质疑，拒绝加入十二家，反而自己成立了焰魔堂宗家，努力修行并寻找伙伴并参加比武大会“波达罗盈城御前试合”。大会中对上岛上实力第三的水度坂勘九郎，由于自身经历与勘九郎相似，因此协助勘九郎解除心结，最后苦战后获得胜利，并羸取了岛上众人的认同。
化野红绪篇/觉醒太阴篇(漫画第51-54话)
失去咒力红绪相当绝望之时，此时红绪的仇人神威突然出现，并提议去找婆娑罗千怒以恢复咒力。找到千怒后，千怒举行觉醒太阴的仪式，同时也告知双星诞生的历史及力量来源。期间，婆娑罗赫夜也正在寻找双星，并与神威对上。
悠斗讨伐战篇/婆娑罗对决篇(漫画第55-76话)
在御前试合落幕的同时，婆娑罗无恶与杠在祸野深处策划着阴阳师毁灭计划。在阴阳师们执行祓除污秽作战时，以加布罗为首的银镜、卧蛇、四皇子等四名婆娑罗与悠斗突然同时在各个地点现身发动攻击，并虐杀了一大群的阴阳师。同一时间，上位婆娑罗无恶带领大量污秽入侵土御门岛，引起巨大的混乱和阴阳师的伤亡。失纵已久的悠斗，也终于与焰魔堂辘轳展开决战。
动画原创
列岛霸乱篇(动画第21-31话)
全国各地发生的“龙黑点”事件令现实世界渐渐堕入地狱，为了阻止这场异变，最强阴阳师集团“十二天将”与神秘女孩小枝联手阻止敌人。阴阳师VS污秽的史诗决战重磅上演。
天地鸣动篇(动画第32-40话)
“龙黑点”事件后，被暗无封印起来的阴阳师首领有马能否化险为夷再次登场。十二天将的能力与过去各是什么。当主角等人焰魔堂辘轳和化野红绪亲眼目睹惨烈的战斗后，他们的羁绊是否会更进一步。
破星篇(动画第41-50话;动画版最终章)
激战过后耗损咒力的十二天将落入暗无的陷阱。辘轳将与宿敌悠斗展开最后的激烈交锋，面对实力强大的悠斗，被称为“双星阴阳师”的少年少女会想出什么方法成功应对，席卷现实世界与祸野的终极大战隆重揭幕，胜利的天平会倾向哪一边。
能够窥视别人的内心、看透墙壁、以念力移动物品、瞬间移动，一出生就拥有一切的超能力!他就是沉默寡言的超能力者·齐木楠雄。在一个平凡的日本家庭，父母都很普通，齐木楠雄的出生却不平凡。齐木楠雄天生下来就是个超能力者，长大后逐渐明白自己与别人不同，虽然拥有足以毁灭世界的力量，但齐木楠雄每天只是想办法让自己默默地隐藏在人群之中。不想引人注目因此极力做个平凡人，直到国中都顺利当个不起眼的学生。
然而事与愿违，他上了PK学园遇上了许多特别的同学后，楠雄的父母以及笨蛋·燃堂力、中二病·海藤瞬等人却一点也不打算让他安安静静地过活，甚至连全校第一的完美美少女·照桥心美都爱上了他!平凡的日子逐渐变成对他来说是个多灾多难的生活…究竟楠雄能不能使用他的超能力，在持续不断的灾难中继续过着不受瞩目的平稳生活?
初中2年生早濑真理，是个无论做什么事都非常努力的活泼女孩。她总是很珍惜从3年前失踪的世界级科学家父亲永司那里得到的挂坠——浑仪罗盘。某次，真理在好朋友水城和花的哥哥旬的房间，发现了曾在永司的研究室见到的书(《磁石与电的发明发现物语》)。真理被打开的书里溢出的波纹包围，并穿越了时空。
在浑仪罗盘所指示的时间跳跃前方，真理与各种各样的科学家相遇，与和花、旬一起追逐着行踪不明的永司的足迹。在那里，同样追逐着永司去向的实业家御影丞的动向带来了暗影。以现代围绕着永司失踪的故事为纵轴，以过去真理等人与科学家所展开的发明发现相关联的故事为横轴展开。
因为母亲去世而孤独一人的少年、小宫千寻是个家事万能又充满精神的小学生。虽然舅舅‧鹰取圆想要收养他，却被千寻拒绝。但在圆看到千寻全力打扫他那间充满垃圾的房间的模样后，给了他一个提议，那就是由千寻负责家中家事换取圆提供生活环境供他居住，并因此获得千寻的同意而因此成为鹰取家的一员......但他所穿的制服却竟然是女仆装。就这样成为鹰取家“女仆”的千寻究竟要如何面对将来的生活呢?
统一组织“ACCA”管理著分为13个自治区的多瓦王国近100年之久。本部监察课副课长吉恩·奥塔斯，别称“蹭烟的吉恩”，负责走遍13区进行视察。盯上他的视线和与他有关的传闻，却开始浮上水面。吉恩的和平日常，慢慢被卷入王国的阴谋!
“放弃梦想的方法，我不知道——”
追逐着憧憬的高中生，进入音乐艺能界的名门·绫薙学园的星谷悠太。
学园中存在着作为全体新生目标的“音乐学科”，其中由成绩顶尖的三年生构成的组织“华樱会”更是君临学园的顶点。 为了进入音乐学科，被“华樱会”的成员看中，并进入接受其直接指导的特别门路，通称“星路”是最好的捷径，但……。
虽然有着优秀的才能，却因为各自的问题而陷入从音乐学科的候补生中落选的危险境地的那雪、月皇、天花寺、空闲，以及完全是新人的星谷。 这样的五人受到了“华樱会”的怪人以及天才·凤的注意……!?
青春的喧闹音乐物语开幕!
故事以一群喜爱竞技猜谜的高中生为主轴，描述热爱书籍的男子越山识认识了一名名为深见真理、过去曾参与过猜谜竞赛的女子，主人公为高中一年级的越山识，在入学后立刻受到诡异学长劝募，希望他参加旗下的“猜谜研究会”。
原本只是个内向书虫的识，被一名同学深见真理拉了一把，就此踏入竞争只在0.01秒间的猜谜抢答世界。深见真理过去曾参与过猜谜竞赛的女子，受到他丰沛知识的吸引加入了猜谜研究会，而他们的故事也就此展开。
与猜谜研究会的前辈及伙伴、以及拥有压倒性强大的对手·御来屋千智的相遇，正解时的喜悦，无法按下按钮时的悔恨……
并不只是知识，也要磨炼各种技术，并与同伴一同以胜利为目标的“竞技猜谜”的世界当中，越山识以猜谜拼上青春的每一天开始了。
战刻夜想曲讲述生存在神牙中的武将们，为了女主而展开激烈战斗的 “战国恋爱幻想剧”，与之恋爱的军队包括织田军，丰臣军，上杉军，武田军，真田军和伊达军。一名名为结月的女子，一天突然穿越到了异世界-神牙，张开眼后便发现自己身处战场。 后丰臣秀吉所带领的丰臣军发现到她，秀吉决定带她回城。不清楚自己身体内所拥有和“姬神子”一样的血，招来了种种麻烦。她在个军队里穿梭著，丰臣军、武田军、真田军、上杉军、伊达军以及织田军。从结月出现后，厄魔也频繁的出现，这当中究竟有什么问题?