在某块土地上，宝石人和名为月人的敌人作战，月人企图将宝石人带回月球。统领宝石人的金刚老师将编纂博物志的工作交给较弱的磷叶石，为了搜集资料，磷叶石被推荐去寻访带有毒素的宝石辰砂。尽管辰砂因为毒素会破坏大地而不愿战斗，他仍为了保护磷叶石而击退月人。次日，磷叶石驳斥了辰砂希望被带到月球的愿望，发誓自己可以找到适合辰砂的工作。
在一次战斗中，磷叶石被类似蛞蝓的生物吞食，辰砂找到了使他复原的方式，而磷叶石则发现自己有能听懂蛞蝓状生物温特里克斯斯的话。温特里克斯斯表示自己是安多米拉比利斯一族的王，还透露过去曾存在这片大地上的人类已分裂成三个独立的物种：象征骨的宝石、象征肉的安多米拉比利斯一族和象征魂的月人。温特里克斯斯想将磷叶石交给月人以换取自己被俘虏的弟弟，磷叶石获救后原谅了他，但也因此失去双腿。在安装上自温特里克斯斯得到的玛瑙碎片制成的新腿后，磷叶石发现自己能跑得非常快，并因此开始参与战斗，但光是巡逻任务就让他疲惫不堪。
冬季来临，除了原本就只能在冬天活动的南极石、睡不着的磷叶石和金刚老师以外，所有宝石都在冬眠。磷叶石被浮冰的声音引诱，落入水中后失去双手，他将一些金和白金做为替代品，但金和白金失控并开始吞噬磷叶石，此时月人袭来，南极石为了拯救磷叶石而被捉，磷叶石控制了新的双手并试图救回南极石，但却没能成功。磷叶石因为失去南极石而感到痛苦，个性也比以往更加内敛，随着春天到来，他已经掌握新的手臂并足以单独对抗月人，而他也因为金手臂受其他宝石瞩目。随着失去双手，磷叶石疑似失去关于辰砂记忆。
磷叶石的行为引起黑钻注意，黑钻希望他成为自己的伙伴，取代原本的钻石。在金刚睡着的次日，出现足以抵挡黑钻和磷叶石攻击的巨型月人，巨型月人进入学校并追逐钻石，感到不能再依靠黑钻的协助后，钻石凭借自己的四肢击倒巨型月人。黑钻赶来协助钻石，他们发现巨型月人被切断后会分裂成更小的个体，他们将这些型如小狗的个体搜集起来后恢复了原本的大小，金刚称这个月人为小白。磷叶石怀疑金刚与小白的关系，辰砂透露其它宝石都认为金刚与月人间有秘密，但仍决定跟随他。
为查明真相，磷叶石决定调查月人，他协助金红石修复莲花刚玉，莲花刚玉给了磷叶石关于与月人交谈的建议后再度沉睡。磷叶石向变石学习关于月人的知识，并试图在战斗中质问其中一个月人，但他的质问被辰砂打断而没有结果。磷叶石想起两人的承诺，为辰砂找到了新工作：协助自己调查月人和金刚的真面目。
一个充满魔法的世界亚斯蓝德(Earth Land)中，位于菲欧烈王国的一个众多厉害魔导士云集的魔导士公会妖精尾巴(Fairy Tail)。露西·哈特菲利亚一直希望能加入成为其中的一位成员。在纳兹‧多拉格尼尔的引导下，终于如露西所愿，并结识了许多厉害又出色的魔导士们，与格雷、纳兹、艾露莎和公会的伙伴们一起做任务，开启了一连串的冒险旅程。
为对抗残暴罪犯，存在着警察无法应对的治安危机的世界之中，出现了一种弥补警察不足的武装侦探，在法律限制内解决个人或组织的委托，通称“武侦”。2009年，东京武侦高中是专门培育武侦的特殊学校，学生的义务是必须携带枪械与刀剑，在这所学校侦探科二年级的男主角远山金次，被自己所拥有的某种特殊体质(一种会在某种契机之下使大脑细胞高度活性化，并且附带某种奇怪的副作用)所深深困扰著，对于这一点他始终希望对其他人保密，只祈求能过平凡的校园生活…
可惜事与愿违，二年级的远山金次在某天上学途中被卷入一起“武侦杀手”的炸弹魔攻击，在身处绝境时，一位美少女从天而降，从此金次与强袭科的超精英─S级武侦神崎·H·亚里亚相遇(外表可爱、身材娇小却非常有能力，同时也是个狂暴并富有攻击性的女孩)，就这样，被迫与最强武侦亚里亚组队的金次，开始了面对凶恶罪犯的日常生活，而他冀望的平凡生活也逐渐远去…
武侦相关
武侦(武装侦探)
为了对抗凶恶化犯罪而新设的国家资格。
武侦等级由低到高为E级、D级、C级、B级、A级、S级以及R级。
S级的评定标准是可以单人对战一个特种部队中队。而R级则可以对战整个大队，甚至可以单人灭掉一个极小国的全部军队。
S级的人数极少，R级更是全世界仅有七名的强者(取Royal字的头字R，代表其实力足以单独保护国家元首或王室)。
E级之下，还有一般不会用到的F级。
超侦
泛指使用超能力进行搜查及作战的武侦。
超侦以G为等级，G后面会有带有数字，数字越大代表能力越强。
双武者
会使用双刀、双枪或是任何双手同时使用武器技巧的武侦通称。
亚鲁卡达
在武侦之间广泛流传的一种近身格斗技的通称。
在防弹技术长足进步的时代，多数的手枪弹药已经无法打穿武侦所穿着的防弹衣，而两名穿着防弹衣的武侦之间发生近距离格斗战时，手枪不是一种贯穿杀伤性武器，而是作为一种重击武器被使用(被击中虽然打不死，但还是会很痛)，这种战斗就被称为亚鲁卡达。熟练的武侦甚至能利用手枪的冲击力加速或是改变身体轨迹。
不只是手枪，多数拥有双武者称号的武侦也会交替使用小刀或是匕首等近身武器作战。
武侦宪章：
武侦宪章第一条：相信同伴，帮助同伴。
武侦宪章第二条：与委托人订下的契约，必须确实遵守。
武侦宪章第三条：要有实力，不过在那之前，必须先走在正道上。
武侦宪章第四条：武侦应当自立自强，对方没求援就不该出手干涉。
武侦宪章第五条：行动快速。武侦必须以先发制人为第一宗旨。
武侦宪章第六条：自我思考，独立行动。
武侦宪章第七条：凡事要做最坏的打算，乐观去行动。
武侦宪章第八条：任务必须彻底完成。
武侦宪章第九条：放眼世界。展翅高飞，不分国籍人种，共同奋战。
武侦宪章第十条：不要放弃，武侦绝不放弃。
(此宪章是以作者在高中时的母校校训为蓝本，并加以修改而成。)
注意：此为作品中国际武侦联盟创立的宪章，与日本武侦法不同，勿混淆。