黑色眼睛的人物角色
村长（村長，CV：藤原启治）
荒川村长，坚决自称河童，自称620岁。不管外人的目光组织荒川居民，亦跟居民隔开居住。
事实上是穿了胶制服装的人，但行以外的人都视其为如假包换。内里是一名穿潮流衣着的好青年，偶然会以魔术形式彰显出来。新居民来的话会给他们起新的名字，并举行欢迎会，但若是新居民仍以本名自我介绍就会感到光火。喜欢饮酒，爱吃黄瓜和海胆寿司[5]，醉酒后会作出脱光全身衣服的行为[6]。担负着保护妮诺的责任，讹称要到妮诺的家乡“金星”而作宇宙特别训练，使行等众人为其在河底建造正式的别墅，过着舒适的生活。
有关恋爱事跟行一样十分迟钝，完全没发现P子对自己的感情。随剧情进展开始对行产生信任感，更委托行趁自己出差时担任荒川区的村长。和黑道组织腐叶土领导者鼹鼠是兄弟关系[7]。本人看似随兴，实则具备相当的雄厚财力和影响力，曾动用权力阻止积的开发工程，以及迫使漫画家桑原薯条改变创作路线，以维护荒川居民的生活。
年轻时期和鼹鼠策画绑架案，将当时年幼的金星人龙凤胎（妮诺及其手足）掳为人质，向两者的双亲诓称妮诺已被自己灭口，要求交出豪宅以换取另一人的性命，但由于村长不知道金星人成双诞生和无法忍受恋人死亡，以及得知自己孤身一人就会死亡的特性，导致听见村长发言的妮诺的手足当场暴毙身亡。怀抱罪恶感的村长则接受妮诺的双亲提议，将妮诺接往地球和留在荒川生活，委托修女和玛利亚保护妮诺，借此偿赎当年的过错。
漫画后期以拆卸改装彩虹大桥的代价，将龟有和妮诺的手足亡灵送回金星，但也使得荒川居民顿失住所，村长遂借此事件举办惜别会暨魔术秀露出自己的真面目。最终话交代众人后话的镜头中，村长以卸除河童装的真面目和小P回归正常人生活。
市之宫行 / 利克鲁得（（いちのみや こう） / リクルート，CV：神谷浩史、齐藤千和（幼年））
本作的男主角，大财阀市之宫集团的名门子弟。22岁。生日8月23日。生活时刻遵守家训“不欠人，不求人”，但因意外与妮诺成为救命恩人和恋人的关系。被荒川村长命名为“利克鲁得（リクルート/Recruit）”，荒川居民通称“利克（リク）”，度着我行我素的每一天。
若欠人情而没法报恩就会进入紧张状态，引发哮喘，但在荒川生活一段日子后鲜有病发（然而在荒川曾因为修女种植的杉树花粉引发花粉症）。由于长期在尔虞我诈的商场斗争环境成长，初期的行对于情感不甚理解，搬来荒川后住在桥柱的房间，在荒川桥底下的工作是老师，被妮诺形容有教导他人的天赋，同时在荒川跟不同居民生活期间，被迫推翻过往的学识和重新思考“常识”的意义。本人也渐渐快乐起来，特别是与妮诺交往的时候。不相信幽灵和外星人的存在。
年幼的时候受过英才教育，4岁起接受父亲积的教导开始学习制作料理，能制作出令荒川所有居民予以好评的家常菜、演奏多种乐器、空手道拿下黑带、烟花师的资格等多方面都十分杰出。头脑明晰，姿容端丽使其从学生时代相当受欢迎。母亲春子已故。童年回忆使其一直害怕父亲。讨厌青椒。
漫画后期开始承接荒川村长的职位兼执行职务，曾一度想为荒川居民重新命名，但由于荒川居民表态已经中意村长取的名字而作罢。故事后期得知妮诺实为金星人的身份，加著妮诺手足的亡灵介入的事件，体认妮诺对自己的意义而决定继续和妮诺相守，最终结局返回市之宫集团成立宇宙开发部门，决定带着妮诺向她的父母提亲，家族公司亦开始登陆金星地面。
五十铃华(五十鈴 華(いすず はな)，Isuzu Hana，声：尾崎真实)
出身茨城县水户市，生日是12月16日，身高：163公分，血型B型，喜欢的花：多花紫藤，喜欢的战车：CV33轻战车
队炮手，就读大洗女子学园普通科二年A班。
出身世代都是花道名家的家族，为了找寻自己所欠缺之物而选择了战车道。
个性沉稳大方，即使遇到突发状况也能临危不乱。食量惊人。嗅觉特别敏感。
在麻子尚未正式加入前是驾驶手，在美穗一票人去麻子家叫她起床时，曾开着战车到麻子家迎接她，再加上她对开炮的声音情有独钟，麻子正式担任驾驶后专注于炮击手的职位。
不擅长家务与料理方面。
后来接任学生会会长杏的职务。
爱徒 勇气(愛徒 勇気(あいと ゆうき)，配音员：福山润/松冈祯丞)
身高175 cm，生日1月1日，22岁。
本作的主人公，长相平常、喜爱女用内裤的漫画家。喜欢钻牛角尖，有妄想癖，自称“爱与勇气的漫画家”(愛と勇気の漫画家)，喜欢偷懒，经常拖稿，因此经常给编辑和助手们添麻烦。喜欢美少女游戏与美少女模型，一天要花十个小时玩美少女游戏。没有与女性交往过的经历，因此梦想是“死前被女生告白一次”(死ぬまでに一度でいいから女の子に告白されたい)。在少年漫画杂志《月刊少年GONGON》连载漫画《羞羞拿铁咖啡》(はじらってカフェラッテ)，简称《羞铁》(はじカフェ)，在杂志上人气投票排名(总共20部作品中的)15位。经常因为好色被打，不过因为是M，所以没什么收敛。对女用内裤的喜爱近乎偏执，甚至可以透过内裤来诊断对方的性格。
爱徒 勇气(愛徒 勇気(あいと ゆうき)，配音员：福山润/松冈祯丞)
身高175 cm，生日1月1日，22岁。
本作的主人公，长相平常、喜爱女用内裤的漫画家。喜欢钻牛角尖，有妄想癖，自称“爱与勇气的漫画家”(愛と勇気の漫画家)，喜欢偷懒，经常拖稿，因此经常给编辑和助手们添麻烦。喜欢美少女游戏与美少女模型，一天要花十个小时玩美少女游戏。没有与女性交往过的经历，因此梦想是“死前被女生告白一次”(死ぬまでに一度でいいから女の子に告白されたい)。在少年漫画杂志《月刊少年GONGON》连载漫画《羞羞拿铁咖啡》(はじらってカフェラッテ)，简称《羞铁》(はじカフェ)，在杂志上人气投票排名(总共20部作品中的)15位。经常因为好色被打，不过因为是M，所以没什么收敛。对女用内裤的喜爱近乎偏执，甚至可以透过内裤来诊断对方的性格。
鹭沼赤司(鷺沼 アカシ(さぎぬま アカシ)，声：松冈祯丞、井上麻里奈(幼少))
木神学园二年级生，无明领域第一期特别调查队的成员。神隐孩子之一。
在学园里很受同学跟后辈欢迎，之后作为死神(银)的驾驶员。在后期表示喜欢篠目，而篠目也喜欢赤司，但赤司却把篠目与鸫搞混，在后期因为篠目尸钢化而自愿成为三号机MA-VESS界联系统(赤红)，而没遵守约定等待赤司打败躯回归，当看到已成为三号机MA-VESS界联系统(赤红)的篠目，在无明领域里心神崩溃而爆走毁了躯的身体，最后在无明领域里被鸫救时一直误把鸫当成篠目(当时还未想起鸫的一切)，所以赤司真正喜欢的人目前还是个谜，虽然第16话里鸫说赤司真正喜欢的人是她自己，不过还是要等赤司回想起过去的情感才能真正知道喜欢的是谁。第17话已对变成赤红界联系统的出羽告白，表示不想失去出羽，并因为想保护出羽而完成了与死神的最高连结。
第21话青司为保护笠音战死，导致银报废。后其觉醒了自身强大的共信能力，凭借一己之力和银合为一体，与真木展开决战。在最后一集与篠目共信，两人终得再触彼此温暖。无明消失后，偶遇鸫时，对鸫能放下怨恨，回归到正常生活感到欣慰。结尾去看望正在接受尸钢化治疗，尚未苏醒处于“植物人”状态的篠目。病房中，二人通过共信静静相伴。在故事快要结束时，终于等到了篠目苏醒过来，并看到她微笑着对自己摆出“....喜....欢....”的口型。其内心无数想要向对方倾诉的种种霎那交织，遂再也无法忍住，流下了苦尽甘来的泪水。
出羽篠目(出羽 ササメ(いずりは ササメ)，声：小岩井小鸟)
无明领域第一期特别调查队的成员，在机师特训班说明会场没有到场。与鸫跟皆志皆为神隐一族，是鸫的亲妹妹。神隐孩子之一。
第八集中手臂出现了尸钢化的症状，喜欢赤司，为了保护在无明领域内的赤司，放弃与赤司的约定，在十三集尚未全身尸钢化前自愿成为三号机MA-VESS界联系统(赤红)，与皆志约定一同守护赤司。
第17话已被赤司告白，然而沉睡在赤红中的她却不知能否听见。此后一直被真木摆弄。于23话想要阻止真木而主动停机。第24话其终于听到了赤司的呼唤，与赤司共信，两人终得再触彼此温暖。后与大家一起阻止了真木。在第24话剧末中接受尸钢化治疗，尚未苏醒而处于“植物人”状态，在第24话的最后一幕时对赤司说“喜欢”。
锁部左门（鎖部 左門（くさりべ さもん），声：小山力也（日本）；宋克军（台湾））
锁部一族实际上的族长、魔法师。个性稳重，有着为了实现目标而不怕麻烦的认真一面，并有着为拯救世界而不惜牺牲部分人性命的无情一面。此外，在故事尾声，也开玩笑说过他那一头长发是假发。
两年前为了拖延“本始之树”的复苏时间，而设计陷害叶风，将她流放到无人岛上。并开始进行“绝园之树”的复活、以对抗“本始之树”。一切事件结束后，继续领导著失去了魔法的锁部一族，并与山本结婚。
泷川吉野（滝川 吉野（たきがわ よしの），声：内山昂辉、桑岛法子〈小学生时代〉（日本）；宋昱璁、雷碧文〈小学生时代〉（台湾））
本作主人公。很普通的高中生，真广的朋友。在所住的城市因为“黑铁病”被毁之后，被卷入真广与叶风复仇的战争。精神层面异于常人的高。适应性很强，有着吸引蛮横且自傲的女性的特质。
平时看起来一副老好人样，不是很主动，但在危急时刻、有所觉悟的时候，思考会异常的冷静、并且做出正确的判断。因为行动总造成本始之树不利的情况，而被左门与巧判断，认为吉野极有可能就是“绝园的魔法师”。
瞒着真广与爱花交往。得知爱花的死讯那天相当错愕，直到现在依旧对爱花念念不忘，时常翻出手机盯着她的照片发愣。在动画第19话向真广告知自己是爱花的男友。
故事结束后与真广都成功考上大学，并与叶风的关系稍稍有了些进步。
锁部夏村（鎖部 夏村（くさりべ なつむら），声：诹访部顺一（日本）；宋昱璁（台湾））
锁部一族的魔法师，锁部一族的武斗派，主要以枪术见长。被左门指派到出现果实的地方进行勘查。后来与伊凡洁丽·山本交过手，后来山本对其产生好感，但本人比较迟钝，没有给出回应。
羽佐间正义(はざま まさよし)
CV：增田俊树/ 陈灏伟(香港)
年龄：19岁
出生地：东京
血型：AB
身高：183CM
体重：72kg
在男性时尚杂志当模特的青年。
受到喜爱特撮英雄片的祖父影响，从小就憧憬英雄。
最后，以祖父的提案“武士弗拉明戈”的身份出现。
他想对世间的罪恶加以正义的制裁?