女主的人物角色
小舟潮(小舟 潮(こふね うしお)，声：永濑安奈)
本作女主角之一，同慎平同龄，慎平的义长妹，金发碧眼，性格善良且大大咧咧。在2018年7月21日，为了救溺水的小早川诗织而身亡。
遇到过自己的“影子”。实际上也被卷入影子病的事件，身亡的真正原因是被“影子诗织”所害。
在慎平等通过消除影子事件的起源令时间重置后，无身亡。
艾蕾卡.萨斯顿(エウレカ・サーストン，Eureka Thurston) CV：名冢佳织(日本);林美秀(台湾)
前作女主角，直接传承，追踪珊瑚岩来到人类加速灭亡的平行宇宙。Nirvash系统曾把苍辨认为她。
13年前从天上坠落冲绳，因为青发而被视为讨厌的“外来人”，从此在身边人的藐视下生活。然后于10年前的珊瑚岩爆发，令其进一步被冲绳人视之为祸端，其身份于是被搬上国际舞台作谈判筹码。后来被联合军旗下的美军带走，在冲绳地区被视为下落不明，实际上是协助联合军对抗走向冲绳珊瑚岩的Secret，最后因为来不及用Nirvash取走石英核心，而决定亲身上前，结果引发七波现象，再一次进入时空穿梭的道路。
于苍13岁的时代再次出现，却是以一副更为少女的模样面对众人，并孕有第一胎。在日本海驾驶前作的Nirvash，并带着月光号到达日本领海。把苍视为拥有其丈夫制作中的Nirvash，并作为同样被歧视的族人。经“蓝色世代”众人调查和研究以后，证实为来自未来一万年以后的人。而这是其初次从未来进行时空跳跃，13年前是往后才发生的回到过去事件，原因是其调查珊瑚岩时出现异常。后来在苍协助下，少女艾蕾卡成功进入七波，继续其时空穿梭的道路。后来证实这段时空穿梭没有想像中长和出现错误，是因为受到后来代替她进入时空缝隙某个平行宇宙的苍提供了协助。
而实际上，13年前的跳跃是为了让苍得到健康成长，不会重蹈并第一胎的覆辙，只是没完全预料到珊瑚岩到达过去的状况，所以才束成联合军的合作。而由于13年前的石英拥有时空跳跃的庞大力量，使其只能不停随石英跳跃到不停地方，其中包括不时以幻灵体姿态出现在众人面前，展示出各种真相。
最后在苍协助下，在某个平行宇宙摆脱了这个命运。
徐长今(日文：チャングム)：伊藤美纪 （台配国语：杨凯凯）
拥有在最恶劣的情况下也不会绝望的乐观个性及意志力，却常常让自己身陷危机的女主角，但她并不为此而放弃。自身拥有非常卓越的手艺和知识，所以常遭人忌妒和惹祸上身。因为闵政浩常常救长今，令长今爱上他；在动画原创人物当中她也令张寿路爱上她。因为她的个性，所以跟随她的人较多。
小日向 早美/小日向 速水(小日向 はやみ，Kohinata Hayami)
声：和泉真优(PC)/樱井浩美(PS2、动画)
《H2O》的女主角，台湾角川漫画版译为速水。琢磨的同班同学，性格刚强不屈且积极，拥有跟外貌不符合的力气，有着意外不服输的个性，后期开始绑上发带，料理手艺不错，喜欢甜的食物。
家境贫困住在简陋的地方，之后房屋被人烧毁，目前与琢磨住在同一个屋檐下，因为长期住在偏僻的小屋里面，对于现代的部分产品都不太会使用(吸尘器、洗衣机之类的)。由于以前父母曾经利用权力欺压村民，所以在学校受到欺压，不断地承担莫须有的罪名，认为自己被人憎恨是理所当然的，为了不伤害他人选择孤僻过日。
以前与萤是好朋友，不过因为的家庭因素关系变的分裂，之后在琢磨的帮助下彼此和好如初。与萤和好之后开始也在学校受到同学的接纳。对于对自己不断关心的琢磨，内心感到动摇且在意，随着琢磨的告白让她坦承面对自己的心情。在得知琢磨的母亲是被自己家里的人害死内心痛苦不安，之后下定决心离开村子。
离开的路途中被神乐家村长用猎枪追杀，因为琢磨突然的出现解救逃过一劫，但是这时候的琢磨却说出“我要保护母亲”这句话，虽然神乐家村长以杀人未遂的罪行逮捕，琢磨却把早美给当成母亲了，即使这样心里还是高兴著自己是被人需要的存在，随后到了东京过着如同母子般的生活。
在搬到东京的生活一段时间后因为一场意外要救人所以跟琢磨的母亲一样死于同样的状况下。
动画结局中由于音羽在精灵会的求情而复活，而死亡的记录被消除再次回到琢磨身边。生日12月25日。身高146cm。血型为O型。
周防美来(周防 美来(すおう みら)，声：伊藤静/白石晴香)
负责怜人的起居生活与对外联络，专属怜人的防护官，并告诉怜人他繁衍后代的使命。一个身材丰满、睫毛洁白的冷艳美女，与绘理沙长得相似。但她的真实身份却被笼罩在神秘之中。
空条徐伦(空条 徐倫(くうじょう ジョリーン)，Cujoh Jolyne)
配音：泽城美雪(日本・ASB版、EOH版);菲鲁兹·蓝(日本・电视动画)
囚犯编号：FE40536 / 罪行：谋杀、弃尸、盗窃(刑期：15年+逃狱未遂5年)
本作主角，第六部的JoJo，是空条承太郎的女儿，有着和父亲一样的口头禅。
原本是普通的不良少女，因为交通意外而遭逮捕，处15年徒刑。但这其实是普奇神父和徐伦的辩护律师策划的冤狱。被父亲寄来的护身符中的“箭的碎片”割伤，却因此觉醒了替身能力。在得知自己入狱其实是遭人设计、父亲承太郎为了救她而遭白蛇偷袭夺走“记忆DISC”和“替身DISC”变成植物人状态后便决心留在水族馆，伺机夺回父亲的记忆与替身，并和策划这些计谋的幕后黑手普奇神父展开了对战。
名字来自美国歌手桃莉·巴顿于1974年的歌曲〈Jolene〉。
五十岚双叶(五十嵐 双葉(いがらし ふたば)，声：白石晴香/楠木灯)
本作女主角，武田在公司的后辈。头发与瞳色都呈绿色，在作品中的印象色也是绿色。雪国出身，小学和中学都在当地的学校就读，高中则在梦寐以求的东京就读，并参加美术社，短期大学毕业后便进入公司，认识了前辈武田。
进入公司起初喜欢盘著头发，但现在更常绑马尾辫。穿着朴素的灰色女式西装与黑色紧身裤。性格稍微有点刚强，但外表自上小学以来就没有太大的变化，身材相当娇小也因此很羡慕樱井桃子拥有傲人的身材。作品中经常以猫的形象描绘五十岚。生日与武田一样是3月9日。虽然受到祖父的溺爱，但她个人并不喜欢被这样对待。
患有相当严重的花粉症。非常喜欢甜食，喜欢的食物是传统日本甜点汁粉。常吃外食，但也擅长烹饪。对恐怖的东西毫无抵抗力，也不敢喝黑咖啡。
五十岚色叶(五十嵐 色葉(いがらし いろは)，声：芹泽优)
作品女主角，高中三年级生，因为有传言是脚踏多条船，所以在同性中评价很差，也没有啥朋友。
与光在因为迟到被罚扫泳池时第一次认识，后来向光告白，后来光因为传言的关系以为色叶只是想戏弄他，但听到色叶的真正的心意后，光才接受了，两人因此交往，交往过程中还与光两人独自去了两天一夜的旅行并买了一对的吊饰当作纪念，当两人交往的时间即将到了要结束的时候，才与光坦承说出实话为什只能交往半年的原因，因为自己得了脑瘤，即将出国去洛杉矶动手术，就算手术成功，但是可能关于光和她自身以前所有的记忆也都会消失。
7年过去，手术成功后，顺利回到日本，但是已经没有了任何7年前在日本的记忆了，动画结局在与千夏的交谈中，本打算之后要和千夏一起回洛杉矶，但是千夏却说出其实最了解你的人并不是我，并带着色叶去见了光，但依然想不起来，当色叶问到光“可以告诉我你的名字吗”时，光本来打算蒙混光去一走了之，但是色叶看到了光身上也有与她相同的吊饰，并拦下他，色叶就拿出了7年前他们还交往时曾经买下的成对的吊饰逼问光，光才坦然说出他们曾经交往过的总总回忆，色叶也才渐渐想起了他们交往时的总总回忆，之后到了参加亚梨纱和高梨的婚礼之时。
在亚梨纱丢出捧花后，亚梨纱突然看见了她，并且亚梨纱冲上来拥抱了她，随着光后与亚梨纱、伊东、高梨等人相见后，与他们相关的记忆也渐渐被唤起，并且一一认出他们，在亚梨纱和高梨婚礼结束后的夜晚，光对着她说出“我一直觉得只要你能活着就好了，但是可以的话，要是还有记忆那就太好了，如果，就算没有了记忆，我想再次让你喜欢上我就好了”，色叶则回答“就算记忆没有了，也一定会喜欢上你的”，答应光不会去洛杉矶了，两人拥抱在一起后，光终于叫出了“色叶”两个字，到了将与光结婚的婚礼上，只出现了两人穿着新郎服和新娘服的背影，动画到这就结束了。
成濑川奈留(成瀬川 なる(なるせがわ なる)，声优;日本：堀江由衣;香港：曾佩仪;台湾：杨凯凯(CTV)/傅其慧(超视))
本故事的女主角，1981年3月25日生，18岁，雏田庄304号房房客，小时也入住过雏田庄。头上有被作者设定为“会招来不幸的男孩，并导致这男孩爱上她”的“不幸天线”，外形是类似蟑螂触须的双呆毛。近视很深，脱下眼镜后，甚至连在身旁的人也不能分清楚是谁。最初因为在露天温泉意外和景太郎有“亲密”接触，于是认定他是色狼而极度讨厌他。后来却被浦岛晴香说服，于是将景太郎带回旅馆。
在学业上帮助景太郎，使其成绩大跃进。虽然是“全国模拟考第一”，却意外落榜一次。巧合地在独自“伤心旅行”时遇上景太郎。经此之后与景太郎的感情不断加深，口头上却经常否认恋上对方，一直到北国之旅尾声被逼到日本最北端宗谷岬时，双方才真正开口坦白说自己喜欢对方。景太郎有不当行为后会实行“铁拳制裁”，将景太郎打到远方。虽然被景太郎讥为“暴力女”，但亦有细心及体贴的一面，加上善于装扮，[4]在脱下眼镜后被众人认为是美女。在考入东大后不久确认恋情，最终话与景太郎结婚并成为教师。
佐木咲(佐木 咲(さき さき)，配音：竹达彩奈〔PV〕/佐仓绫音〔动画〕)
本作的第一位女主角。从小是直也的邻居也是同班同学。身高161厘米。
好朋友会以“sakisaki”昵称。咲的名字是因为双亲有“姓和名读起来一样，感觉很可爱”的想法所发想而来的。运动能力很好，在学校是参加篮球社。
