新学年开始，樱丘高中轻音部因原有部员全部毕业离校而无法达到部员4人的最低人数。轻音部新成员只有秋山澪和田井中律。温柔可爱的千金大小姐琴吹?因觉得田井中律及秋山澪的互动很有趣而入社；平泽唯在阴差阳错的情况下把“轻音”当作“轻松的音乐”，又想起小时候玩响板得到老师表扬，所以申请入部。于是，便有了贝斯手秋山澪、吉他手平泽唯、鼓手田井中律及键盘手琴吹?。后来新成员中野梓加入轻音部，成为第二名吉他手。

原作并无特别设定场景，在确定动画化后，负责制作之京都动画虽然将生活圈设定于关东地区，但将许多京都地区景色包含其中：琴吹?平日通学时搭乘电车与候车月台参考自京都市内营运的叡山电铁本线出町柳站与修学院站，主角们上下课的沿路和快餐店则参考京都市左京区北山通和白川通一带，而乐器店和商店街即参考自京都市四条河原町一带的商业区；三年级学生修学旅行当中所出现知名历史文化建筑，如金阁寺、北野天满宫、今宫神社等。主角们就读的樱丘高中，动画版称为樱丘女子高中（桜が丘女子高等学校），以滋贺县犬上郡丰乡町丰乡小学校旧校舍为蓝本；此地因动画播出，成为许多动漫迷圣地巡礼地点之一。

在阿丝特勒艾亚山上有三所女子学校。圣米雅托尔女学园（“圣ミアトル女学园”），圣斯毕卡女学院（“圣スピカ女学院”），圣鲁?莉姆女子学校（“圣ル·リム女学校”）。三所学校不仅结成了姐妹学校的紧密关系，而且三校还为外地来的求学者们设立了共同的女子宿舍——“草莓女子宿舍”。

阿丝特勒艾亚山……这是个不允许男子踏入的圣地……

这里是清纯无垢的少女们所生活的美丽世界……在这里，她们的关系渐渐地超越了少女之间的友情——被称作“百合”的羁绊。

在这个完全隔绝了男性的百合世界中，发生了一系列少女和少年们都能快乐地欣赏的故事……

少女们各自在圣米尔都女学园、圣史彼加女学院和圣雷利姆女学校就学。在这三所不同的女校里，她们邂逅了自己的学姐、同班同学和学妹，在学校与宿舍里经历了属于自己的喜怒哀乐，少女们的心也因此渐渐走近……

由于某些原因而转入了圣米亚特尔学园的4年级学生（初高中连读，其实也就是高中一年级）“渚砂”在全新的学园生活面前心跳不已。入学的第一天，她与至高无上的“闪星”（“艾特瓦尔”，法语中星星的意思。闪星拥有着管理3所学校所有班联会事务的绝对权利与威望，同时也是个最需要负责任的职位）“花园静马”相会了，在那一瞬间，她完全被她那令人倾倒的魅力所征服了。另一方面，静马也被渚砂的温柔所吸引，用双手托起了她的脸庞，然后…

概要

本作品是妹妹公主结束后的企划之一。受到了“圣母在上”风格的影响、结合了“百合”的特征。跟妹妹公主与双恋作风完全相反，摆脱过去的标准的作为目标。

登场人物所属的学园设定上属于中学到高中六年一贯，分为一～六年级生，1～3年级生为中学生、4～6年级生为高中生。

相对于其他的百合动漫（如神无月的巫女等），本部动画较其他的还要更深入女孩与女孩之间的爱恋，而非友谊；比起圣母在上，本部完全没有男性角色的出现，完全讲解女孩与女孩，没有任何的“外人”介入。

动画的作画对于许多观众来说，是属于非一般正常性向的爱恋，剧情与漫画有差异性，相较于动画是比较暧昧性质，漫画则带给读者许多惊艳，画风和剧情走向都令人满意。建议从漫画进入草莓危机的世界。当然，也是可以从动画进入的。

故事发生在前传故事《鹫尾须美是勇者》两年后，神世纪300年。主要讲述初中二年级学生结城友奈，天天在学校里过着与很多朋友一同听课、进行社团活动、玩耍的平稳生活。不管怎么看这都是非常普通的女孩的生活日程，但是只有一点与其他孩子不同的地方，那就是她所属的名为“勇者部”的社团活动。以部长犬吠埼风为中心的该社团的活动内容与被谜团包围的叫做Vertex的不可思议的存在有关系。本作正是以友奈等人的“勇者部”的活动为主线进行相关叙述的。

表面看来，结城友奈(照井春佳 配音)是一个平凡的初中二年级女生，个性开朗热情的她是校园中的活跃分子，深受老师和朋友们的喜爱。可实际上，放课后的她还有着另一重身份——勇者部的部员。

友奈的邻居兼好友，沉默寡言却意外的温柔的东乡美森(三森铃子 配音)、个性大大咧咧果断直率，却意外的擅长做家务的犬吠埼风(内山夕实 配音)、风的妹妹，像小动物一样惹人怜爱的犬吠埼树(黑泽朋世 配音)、看似桀骜不驯难以接近，实际上非常害羞傲娇的三好夏凛(长妻树里 配音)，除了友奈，活跃在勇者部的是这些性格迥异的女孩们，她们所要面对的，是名为巴提克的强大敌人。