主人公恒为了寻找离家出走而下落不明的哥哥·巧美而奔波着。可是当他与哥哥重逢时，却发现巧美成为了美国侦探事务所的所长，完全没有跟他回家的意思。而同样不想回家的恒，也不情不愿地进入这家事务所开始打杂。

以石川县金泽市的温泉街“汤涌温泉”作为主要舞台，登场人物的姓氏都取自石川县内当地的地名（轮岛市、押水町、鹤来町、和仓温泉、四十万町），但故事、登场人物则属原创。

此外，本作也与在地单位合作协助取材，如能登铁道（松前绪花等人平日通学使用的交通工具样本）、光冈汽车及金泽美术工艺大学（鹤来民子等人就读的香林高中校舍样本）等。其中能登铁道为宣传该作品，将西岸车站月台新增一片动画中虚构的“汤乃鹭”车站站名牌，并成为“圣地巡礼”指标车站，部分班次车内自动播音改为动画人物版本，希望吸引动漫迷前往朝圣，进而带动石川县与能登半岛境内观光。

而故事所发生之“喜翠庄”，则以“白云楼旅馆”为雏形。此旅馆为石川县金泽市汤涌温泉的地标性温泉旅馆，创立于1932年，1999年因经营不善倒闭。后来虽不断有人出售与竞标，但都因各种问题流标或是无法重新营业。最后在2006年5月正式拆除。

故事简介

“我还不知道我的将来会怎样，也还不想知道。”常常幻想着“突然的夜逃、突然的告白及突然的分离”。 一直以来那个想变成不同的自己的梦，却一日就这样成真。松前绪花的平凡在那一天之内居然迎来了电视连续剧般的惊人展开。将离开这熟悉却没什么感情的城市，前往母亲指示未曾谋面的外婆家生活……

出身于东京的16岁女主角“松前绪花”，是个努力的渡过每一日的平凡女生，想要变得和“现在的自己”不一样，这些幻想于某一天突然成真了。告别了母亲“松前皋月”前往了外婆的温泉旅馆“喜翠庄”工作及居住生活。那是个充满了大正浪漫风味的温泉旅馆。在那里，绪花遇见了“鹤来民子”、“押水菜子”及“和仓结名”等女孩及各式各样的人，也认识到从未认识到的新世界（简直像花芽冲破地面而进入了另一个世界一般），在这充满着春色与梦幻的地方，开始了与过往不同的新生活。虽然有笑有泪，也有非常难受的时候，但不管发生了什么，明天依旧会到来。“所以我会更努力，尽全力地发光”。随着太阳的引导，绪花这个细小的花蕾会绽放出更大更美丽的花朵……

每集列表

故事设定在24世纪。彼时人类在火星上进行地球化改造工程，由于两极冰帽融解的水量超乎预期，全星球有90%被海洋覆盖，因而被称为“水星”(Aqua)。在此星球上有个以过去被称为“水都”的威尼斯为范本所建造的城市新威尼斯(Neo-Venezia)，因其仿古的建筑与承袭传统的生活方式而广受观光客喜爱;而其中有一种驾驶贡多拉穿梭于运河之间、带领观光客游览整座城市的职业，称为领航员(Undine)。

出身于地球(故事中称为“行星Manhome”)的水无灯里，以成为能独当一面的领航员为目标而来到新威尼斯，在“亚利亚公司”(Aria Company)见习;身为半熟手的她，每天都持续练习操控贡多拉及观光导览。《水星领航员》便是在描写灯里以及她身旁的朋友在一年四季中的日常生活点滴。

在本作品里出现的Undine(本意为水之精灵温蒂妮)指的是专为观光导览的贡多拉操控者。能从事的只有女性，是Aqua的明星职业。

领航员手上是否有戴手套为能力的指标：见习生的手为双手套(Pair)，半熟手为单手套(Single)，能独当一面的老手则无手套(Prima)。这是因为有本事的领航员不必使用过多的力量即可操控贡多拉、手也不大会起水泡，所以也就没有戴手套保护的必要了。

Pair 升级 Single 的测验是操控贡多拉到达称为“希望之丘”的地点，而此为测验内容、其位置与路程皆禁止泄漏;要升格为Prima，虽须通过贡多拉协会特定的考验，但升级并无明确标准，一般是交由各家公司或负责指导的前辈，关于测验的方法或标准完全由主考官决定。Prima 的平均升格年龄为18～20岁，成为 Prima 后便可允许为自己取个通称。

可以自由营业载客的只有无手套，单手套需有负责指导的无手套陪同。渡船(Traghetto)则允许单手套自行营业的，费用上比起Prima 较为便宜，也是由于 Prima 所操控的贡多拉较为安全之故。灯里经常使出“不收取费用，而以朋友的名义乘船”的钻漏洞招数，因为“规则上所禁止的是单手套以下的领航员所控船之营业行为，并非禁止让人一同乘船”，而周遭的人们也会默许。此招的发明者是以消磨时间为目的而想免费乘船的看火人阿晓;动画里的发明者则是小爱，只是后来阿晓也免费乘船。此外，单手套也能以助手的身份搭乘无手套所操控的贡多拉，动画中却有身为双手套的艾里须搭乘雅典娜或晃所操控之贡多拉的场面，小说里同样也有雅典娜的贡多拉让艾里须搭乘的情况。在月刊Undine第3集(18月号)里，艾里须操纵贡多拉，却在有雅典娜搭乘的情况下接受采访，想来也是用这个招数来随机应变。

领航员的制服为统一，夏天为类似水手服的衬衫(亚利亚公司的设计有很大的不同，衬衫的前襟为西服领，只有后领还保留水手服的形式)、贴身衣则为下䙓带有开口的连衣裙，再加上帽子、鞋子、和半指手套，胸口系上领结;冬季服饰方面，从长袖连衣裙的上面、肩膀的地方披着系有领结的短斗蓬(手套的设计也和夏天不同)。每家公司的服饰花样、帽子、领结、鞋子、手套、及连衣裙下䙓的开口位置不尽相同，成为各家公司的特色。另外在袖子和帽子上则带有各家公司的标识。