正传“罪与罚与赎罪的少女(罪と罚と赎いの少女)”

“那アイ(眼/爱)会改变命运”(「そのアイ(眼/愛)が運命を変える」)

失去姐姐而过著懒散生活的男主角・皋月驱和他的青梅竹马水奈瀬由佳，突然一同被卷入一个染红的世界。然而，与另外4位来自相同世界少年少女一同被卷入到这个事件中，并且以打倒黑骑士们为目的。为了生存下去，并结束“赤之夜”，他们与黑骑士们的战斗也就此开始。

CrossOver追加平行外传“虚空镜界(虚ろなる镜界)”

“这是新世界的魔术(Real)”。(「これが新しい世界の魔術(リアル)」)

Xbox 360版追加的新系列，正外传两个故事开始于同一剧情时间点，男主角天见修隐藏他是位现代科学和魔术融合的“现代魔术师”的身份，并把距离他周围的时间、地点由手机发出。同时街上也谣传著“只要一看见分身(双重存在)后、之后就会行踪不明”。修以他身为现代魔法师的直觉察觉到这令人不安的迹象，就开始调查这起秘密失踪案件。但是他们在解决“双重存在”的问题并接连击败最后的主谋时，却使那能够对抗奈落陨落的力量“人工翠玉碑”彻底消失，于是百野刊在此之后开始正式插手正传的赤夜(幻灯结界)事件(虚空镜界篇自此结束，此时正传剧情尚未完结)。

后传“- Resona Forma -”

本作囊括Before·If·After三个故事，补完本篇中未能详细描述的过去与未来。

before

在原作‘11eyes -罪と罚と赎いの少女-’中登场，阻挡在主角面前的不死魔女“リーゼロッテ·ヴェルクマイスター”。本作将要描述这位魔女在过去与‘禁书目录圣省’的6位使徒展开壮烈死战之时的故事。

if

她唯一心爱的男人，是与她在约550前并肩作战的ドラスベニア国王，维拉德(ヴェラード)。维拉德使用拥有看见未来力量的魔具‘劫之眼 (アイオンの眼)’，让时间追溯到莉婕罗堤尚未成为魔女，走向残酷命运之前的时代，为了阻止纯洁少女 "莉婕罗堤·威尔克麦斯达"(リゼット·ヴェルトール)成为魔女而奔赴战场的故事。

after

原作‘11eyes -罪と罚と赎いの少女-’1年后的世界。由于魔女·リーゼロッテ而被迫面对严苛战斗的主角们，踏上了拯救世界的旅途，在这个过程中，主角与同伴们产生无法磨灭的羁绊。草壁美铃、橘菊理等三年级生，从虹陵馆学园毕业。驱等人则升级，各自欢乐的过著和平的学园生活。在平淡的日常生活中，他们面临了新的烦恼。

继承该团体的首作《暮蝉悲鸣时》血脉，拥有完全不同世界观的作品。虽然加入了“暴风雨中的孤岛”“争夺遗产”“洋馆”“连环杀人”“预告状”“解读文”“神谜人物”“不可解的奇怪现象”等典型的Closed Circle（封闭空间）要素，是一部具有幻想要素的推理作品。本作中，07th Expansion第一次加入OP影片。

其后作品改编成电视动画（仅出题篇），于2009年7月起在神奈川电视台、千叶电视台等UHF放送局以及爱知电视台、AT-X等TXN电视台播放。

故事发生在一个名为六轩岛的小岛上。这里是大富豪右代宫本家的所在地，每年10月第一个周末，家族成员都会赴岛出席家族会议。

1986年10月4日，家督右代宫金藏病重，暂由长子藏臼主持会议，其他子女都在遗产分割问题上争吵不休。而在书房里的金藏完全不屑于理睬如秃鹫般的儿女们，闭门专注研究神秘黑魔法。孙儿女则懒理父母之间明争暗斗，相处气氛十分融和。屋内还有五名佣人，其中三位得到家督宠信，当中两位又与本家邂逅……

由于台风的缘故，六轩岛成为了与外界隔绝的孤岛。两日后台风退去，警方登岛后只看到惨绝人寰的景象。事后有人找到了一封期望解开魔女杀人真相的信，令事件成了多年来无人能解的谜题。在与世隔绝的两天里，岛上到底发生了什么事？是魔女杀人还是人类作案？

海猫鸣泣之时，无人生还。

作为悬疑推理作品，本作希望玩家在进行推理的过程中得到乐趣。但是，作者并未明示如何推理和破解谜题，以至达到胜利的方法。目前按剧情发展，要得到胜利大致上可区分成以下的4点。

解开“封闭空间”杀人之谜，锁定犯人

解明家族成员之间的关系和过去，以推理各人行动的原因

思考对抗魔女的手段，找到使所有人都不用死的方法

解开碑文之谜，找到黄金的所在处，即黄金乡

进一步来说，于本作的推理上，对手魔女会故意安排非人为所能解释的幻象扰乱推埋，玩家要分辨实际存在和妄想的产物。对于这点与前作中的“御社神”“雏见泽”“御三家”等类似。

上条当麻是学园都市的一名高中生。在这座位于东京都西部的封闭都市中，学生占到了总人口的八成，“超能力开发”被列为绝大多数学生的必修课，在Level 0到Level 5的等级排名上相互竞争。不幸地，上条当麻被评定为无能力者；但他的右手有着能将一切异能消除的不明力量，他本人称其为“幻想杀手”。似乎是连同神的祝福一同抹杀的关系，他每天都过着不幸的生活。

暑假的一天，在宿舍的阳台上，上条当麻遇见了一位挂在阳台栏杆上的修女。她自称“禁书目录Index”，脑海中装有十万三千册“魔道书”，正在从不为人所知的“魔法”世界逃亡。就这样，上条一脚踏进了魔法与科学的纷争。

本作的世界观以现实世界为蓝本，但并未说明详细历史时期，大致可以推测故事发生在虚构的近未来[d]。其历史与现实世界有共通点（如前两次世界大战、冷战等；亚雷斯塔更是现实中存在的人物），但也有显著的差异。

学园都市是科学势力的大本营，同时也是本作的主要舞台。位于日本东京西部，居住着230万人口，其中八成人口是学生，而这些学生大都是超能力开发的实验对象。学园都市具有领先世界20-30年的科技实力，掌握着多种近未来高科技兵器，并公开地培养超能力者；事实上是由统括理事会所主导的、严格封闭的国中之国。

而魔法势力则较为分散，主要由名目繁多的宗教组织和魔法结社构成，也有不属于任何组织的魔法师存在。教会势力中，十字教有三大主要教派：英国清教、罗马正教和俄罗斯正教（分别以英国圣公会、天主教和东正教为原型）；而魔法结社则包括以黄金黎明为源头的黄金系结社、依靠北欧神话理论的“捣蛋鬼”，阿兹特克系的“有翼者的归来”等。魔法势力之间常会出于各自不同的目的互相斗争，魔法师出于个人信念私自行动的现象也广泛存在。

在魔法势力与科学势力之外，尚有两不从属的一般组织与国家，如美国；作品中也出现了许多虚构的政权，除学园都市外，还有“伊莉沙里纳独立国同盟”、“巴格吉城”等。

本作中，除“现实世界”之外，尚存在更高等级的、无法以一般手段探知的其他次元的“位相”；神、魔神、天使、妖精、无法以语言名状的高等级存在[e]，也均在作品中有所提及。