在架空世界的日本，为了公序良俗等理由，政府制定了侵犯人权的“媒体良化法”（媒体优质化法），并成立了“媒体良化委员会”（媒体优质化委员会）与“良化特务机关”（优质化特务机关）来进行媒体检阅工作。与这个强权机关对抗的唯一组织，即为“图书馆”。一群热爱图书馆自由的人们，武装自己与良化机关进行战争，守护图书馆的自由。笠原郁在高中的某一天看到了想买的书，却遇上了良化委员会的成员，这时却出现了一名图书队员，使对方离开。公元2019年（正化31年），笠原郁加入了战争……

每集列表

14岁的初中生楠本赖子性格阴暗，没什么朋友。有一天，班上才色兼备的美少女的柚木加菜子突然对她说道“我们是对方的转世”。因为加菜子常说些不可思议的事情，并且经常读很难的文学杂志，赖子一时不知如何是好，不过内心孤独的二人逐渐变得亲密起来。二人约定乘坐最后一班列车去看湖，可是加菜子却在中央本线武藏小金井站的站台被人推下，并被列车碾过。

那辆列车正好乘坐着在下班路上的刑警木场修太郎。修太郎将加菜子送到医院，在那里他看到了加菜子的姐姐阳子。阳子和他暗恋的女优美波绢子长得一模一样。

受伤濒死的加菜子被送到谜之研究所，并且受到集中治疗。

这时，多摩地区一带，发现了很多被分解的尸体。为这个事件取材的记者中禅寺敦子和陪同的小说家关口巽、杂志编辑鸟口守彦在森林迷路了，并发现了谜一般的建筑。那是一个正方形的巨大的“匣子”。加菜子正是在其中接受治疗。

此时，在严密的戒备下之中，应该在接受治疗的加菜子忽然失踪了...

每集列表

“现代视觉文化研究会”（現代視覚文化研究会、The Society for the Study of Modern Visual Culture），简称“现视研”（現視研），是一个以研究动漫等综合性现代视觉文化为成立宗旨，但实吃喝玩乐之行的社团。主角笹原完士在成为大学新鲜人后，跟同为一年级新生的重度御宅族高坂真琴一起加入了现视研。但在都是“御宅族”的社团活动中，高坂的青梅竹马春日部咲对其展开攻势；即使与其交往之后发现了高坂的“御宅族”真面目，仍不放弃将他拉回正道，因而成为社团的常客。漫画《现视研》，即是活生生的描写大学内动漫社团里的日常生活与人际关系的作品。

坊间对于“御宅族”在外表、行为模式、与异性间的互动情形等面向上往往具有刻板印象；然而本作对此族群的描写呈现多样化，被部分动漫爱好者认为较为接近真实状况。

衍生作品

不平衡抽签

现视研中大卖的虚构漫画及其延伸动画和同人产物，简称不签（くじアン），不过常常译作“不公正抽签”，角色造型跟个性与一般近来日本动画采用类似元素，东立代理的中文版漫画没有里封与相关附录，虽然跟本篇故事相关不大，但对动漫画界的parody带来比本篇不相上下的乐趣，真的有心接触不签的人只好由其他管道下手（如完整代理不签的中文版动画）。除了在现视研的世界中，不签也有推出三话OVA动画跟两本单行本（小说）。并且于2006年10月时独立推出TV版动画，全12集，现已播毕。