本作品的主线原本重视校园格斗风格，讲述主角凪宗一郎及牧原鲍伯入读日本一所集合全国武术家子弟的统道学园，因而遇上的种种经历。凪宗一郎邂逅了校园内的武术顶尖高手枣真夜及枣亚夜，并加入了她们的柔剑部，与敌对的学园执行部发生一连串的抗争。谁知主角们平凡的校园角力中，原来蕴藏了一项规模远超乎想像的大阴谋。凪宗一郎开始接触到世界上各种“异能之士”，逐渐来到一个陌生的领域之中，更惊人的是他发现了原来自己亦是拥有异能之士。牵涉一场浩瀚百年之战的命运，正在等待着凪宗一郎与身边的人的脚步……

每集列表

本书标题中的“Trinity Blood”照字面直译是“三位一体之血”。在宗教角度来说，三位一体所指的是圣父、圣子和圣灵。作者吉田直引用这个名词去借代笔下的角色，分别是该隐?奈特罗德、亚伯?奈特罗德和塞特·奈特罗德三兄妹。该隐、亚伯和塞特亦是《圣经》中亚当和夏娃所生的三个孩子。

剧情

教廷巡视神父亚伯?奈特罗德表面上是个冒失鬼，实际上却是有“吸血鬼猎人”之称的教廷国务院特务分室（Ax）派遣执行官，负责到不同地方调解吸血鬼事件。在这个黑暗混乱的时代，教廷和真人类帝国互相对峙，加上蔷薇十字骑士团的恶意挑拨，亚伯是否能维护“长生种”（本作中指吸血鬼）和“短生种”（本作中指一般人类）的共存？为了赎罪而努力奋斗的男子，心底仍有难以磨灭的伤痕……

科幻设定

盖·保格之枪(Gae Bolg)

原为凯尔特神话中女神赠与英雄库丘林的魔枪。在故事中为强悍的超科技武器，基辅侯爵家传的“遗产”。可从真空管喷出激光光加以离子化的氙气，所产生的温度|高温密度|高密度周波足以斩断所有物质。可说是帝国科技中最优秀的肉搏武器。在Ｒ.Ａ.Ｍ中由亚丝所使用。

埃癸斯神盾(Aegis)

原为希腊神话中的胜利女神与智慧女神雅典娜所使用的盾牌。在故事中是帝国贵族札格雷布伯爵安德烈．库萨所使用的一种强力磁场防御系统，外观是悬浮着三颗或以上的金属球，如行星般围绕恒星旋转。其强力磁场足以将盖?保格之枪的攻击反转再扩散。缺点是自身要进行攻击时要停止使用神盾。在Ｒ.Ａ.Ｍ中由安德烈所使用，另外在R.O.M中“骑士团”的“红色男爵”亦使用神盾构成和碳Ｃ60一样的富勒烯球型磁场盾。

别西卜(Beelzebub)之剑

别西卜为马太福音中第12章第24节中描述的魔王，七原罪中司掌“饕餮”之罪，也是《失乐园》中出现的堕落天使。此为“失落科技”的武器，是一种单分子导线──以碳Ｃ60分子多重结晶粒子为材料制作的极细碳纤维，连钻石都能轻易切割，唯一弱点是不耐高温。在Ｒ.Ａ.Ｍ中由坎柏菲使用。

阿斯莫德(Asmoday或Asmodee)之盾

阿斯莫德为七原罪中司掌“淫欲”之罪的恶魔。也是一种强力磁场防御系统，可以轻易扭曲Ｍ１３的五一二超大型子弹。在Ｒ.Ａ.Ｍ中由坎柏菲使用。

平凡的高中生坂井悠二，在回家的商店街上与忽然出现的少女被卷入非日常的世界。这位少女，“炎发灼眼的讨伐者”夏娜──讨伐干扰世界秩序的红世之徒的火雾战士的一员，告知了悠二他已经是已死的存在。为了保护身为特殊火炬“密斯提斯”的悠二，夏娜与欲针对他的红世之徒展开战斗。

原以为坂井悠二，会是一个怕死的火炬“密斯提斯”，却没想到悠二很关心他人，在校园被红世之徒的猎人法利亚格尼袭击时，夏娜使用了悠二身上的存在之力，因而发现了藏在悠二身上的宝具‘零时迷子’。

往后的日子将会有许许多多的红世魔王跟使徒一一来袭，夏娜的个人观跟感情也因为悠二而受到了影响。