上条当麻是学园都市的一名高中生。在这座位于东京都西部的封闭都市中，学生占到了总人口的八成，“超能力开发”被列为绝大多数学生的必修课，在Level 0到Level 5的等级排名上相互竞争。不幸地，上条当麻被评定为无能力者；但他的右手有着能将一切异能消除的不明力量，他本人称其为“幻想杀手”。似乎是连同神的祝福一同抹杀的关系，他每天都过着不幸的生活。

暑假的一天，在宿舍的阳台上，上条当麻遇见了一位挂在阳台栏杆上的修女。她自称“禁书目录Index”，脑海中装有十万三千册“魔道书”，正在从不为人所知的“魔法”世界逃亡。就这样，上条一脚踏进了魔法与科学的纷争。

本作的世界观以现实世界为蓝本，但并未说明详细历史时期，大致可以推测故事发生在虚构的近未来[d]。其历史与现实世界有共通点（如前两次世界大战、冷战等；亚雷斯塔更是现实中存在的人物），但也有显著的差异。

学园都市是科学势力的大本营，同时也是本作的主要舞台。位于日本东京西部，居住着230万人口，其中八成人口是学生，而这些学生大都是超能力开发的实验对象。学园都市具有领先世界20-30年的科技实力，掌握着多种近未来高科技兵器，并公开地培养超能力者；事实上是由统括理事会所主导的、严格封闭的国中之国。

而魔法势力则较为分散，主要由名目繁多的宗教组织和魔法结社构成，也有不属于任何组织的魔法师存在。教会势力中，十字教有三大主要教派：英国清教、罗马正教和俄罗斯正教（分别以英国圣公会、天主教和东正教为原型）；而魔法结社则包括以黄金黎明为源头的黄金系结社、依靠北欧神话理论的“捣蛋鬼”，阿兹特克系的“有翼者的归来”等。魔法势力之间常会出于各自不同的目的互相斗争，魔法师出于个人信念私自行动的现象也广泛存在。

在魔法势力与科学势力之外，尚有两不从属的一般组织与国家，如美国；作品中也出现了许多虚构的政权，除学园都市外，还有“伊莉沙里纳独立国同盟”、“巴格吉城”等。

本作中，除“现实世界”之外，尚存在更高等级的、无法以一般手段探知的其他次元的“位相”；神、魔神、天使、妖精、无法以语言名状的高等级存在[e]，也均在作品中有所提及。

故事发生在一座地中海的小岛上、在这里生活着的自卫组织叫做“魔力家族（アルカナ?ファミリア，Arcana Famiglia）”是以一种特殊能力作为武器、来保护岛屿的和平所存在的组织。

女主角菲丽琪塔（Felicita）从小就被严厉的母亲养育到成人、但她也有着 16 岁少女青涩的一面。在某天，一场生日派对上组织的首领，也就是女主角菲丽琪塔的父亲、突然宣布退休的消息，并发表家族里持有特殊能力的能力者都须出席这场战斗、获胜者将选为组织的继承人并与菲丽琪塔结婚、决定命运的战斗现在由此拉开序幕。

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描述围绕在“全日本最不像的”三胞胎姐妹三叶、双叶、一叶的日常故事，三人都是小学六年级生。黄色笑话式的剧情是最大特色。

每一话的单位是“第×卵性”，各话标题常恶搞其他ACGN作品名称。

位于埼玉县的上尾市，丸井家三胞胎终日上演着各种搞笑闹剧。这三个11岁的小女孩同在当地的立鸭桥小学六年3班读书，她们容貌不同，却长相可爱，然而可爱的外表下又有着令人哭笑不得甚至抓狂暴走的邪恶性情与趣味。长女三叶（高垣彩陽 配音）通身散发着强烈的御姐女王的霸气，略带婴儿肥的她又常被别人称作“母猪”、“痴女”；次女双叶（明坂聡美 配音）天真可爱，似乎有点儿天然呆，不过却是个目测胸围的高手、三女一叶（戸松遥 配音）性格阴郁，嘴巴毒辣，最喜欢读书，可是读的多是色情杂志。所谓三个女人一台戏，三个性格怪怪的小女孩凑到一起更是惹出无数的爆笑喜剧……

本片根据桜井のりお的搞笑萌系漫画改编。

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