在人类逐渐无法使用魔法的世界里，人们为了对付还拥有残存魔力的人类，成立了培训“异端审问官”的机关“对魔导学园”。主角草薙哮在这个以枪械为主要武器的环境里，仍旧使用刀剑战斗，而他所率领的第35试验小队，更是由一群劣等生所组成。某日，身为顶尖“魔女猎人”的超精英枪械高手-凤樱花加入了这只小队，让第35试验小队开始有了改变。
故事发生于一个平行宇宙地球的世界。在那里有超能力的人都被称为伐刀者，他们能将灵魂转化为武器，被称为魔剑。在破军学院，及格的魔法骑士都被获选代表学院参加由日本的七所魔法骑士学院主办的学院七星剑武祭比赛，以选出七星剑王。由于破军学院在比赛的排名滑落，学院理事长新宫寺黑乃下决心寻找问题的解法。黑铁一辉是学院的F级伐刀者，由于魔法才能低而被当作是落第骑士。但欧洲国家，法米利昂国的公主史黛菈·法米利昂却是A等顶级伐刀者之一。
史黛菈在转校破军学院的第一天，被安排与一辉同居一房。一辉不经意间发现史黛菈半身裸的时候，后者挑战前者决斗，条件是输者须终身服从胜者。史黛菈虽输决斗，但最终他们俩同意成为室友。故事讲述他们俩一起训练的冒险旅程，以便能获取代表学院参加七星剑武祭比赛的资格。
历经了千年的繁华，巍峨帝都早已从内部腐烂，拥有邪魔灵魂的统治者，正引领文明走向毁灭。为了解除村庄的困境，拥有绝赞剑术的少年塔兹米(齐藤壮马 配音)独闯帝都。此时帝都至高无上的皇帝还只是不谙世事的孩子，国家的实际操纵者大臣只手遮天，是帝都腐朽的根源。
历经一波三折，塔兹米被曾经骗过自己的雷欧奈(浅川悠 配音)强行拉入一个神秘组织Night Raid。Night Raid是一支令帝都所有权贵富贾闻风丧胆的暗杀集团，他们是革命军下辖的秘密特殊部队，其最终目标是颠覆大臣的统治。在娜杰塔(水野理纱 配音)的领导下，赤瞳(雨宫天 配音)、雷欧奈等绝世高手云集其下。塔兹米的命运由此发生转折，而接二连三更大的纷争则将其引向未知的彼方……
本片根据タカヒロ(原作)、田代哲也(原画)的漫画改编。
组织/势力
Night Raid[夜袭]
名震帝都的杀手集团。实际上是为了推翻帝国的革命军所组织的暗杀部队。主要负责暗杀罪大恶极之人，并在革命军发动推翻帝国的战争时将大臣暗杀。
根据地是在帝都北方十公里外的山中。
初期因为赤瞳、娜杰塔、希儿、布兰德的面貌已经曝光，所以探查情报与交涉工作是由雷欧奈负责，希儿死后玛茵也被列入被通缉名单。
所属成员各有自己的参战理由，也对自己是从事杀手这黑暗的工作这点有迟早自己都要承受报应的觉悟。
在动画的最后，8位 Night Raid 成员死了，分别是 希儿, 布兰德, 雷欧奈, 塔兹米, 玛茵, 拉伯克, 切尔茜 以及 须佐之男。娜杰塔接管帝国, 而赤瞳背负革命军的黑暗面隐世埋名。
三兽士
艾斯德斯的心腹手下，全部都是帝具使。对艾斯德斯是绝对服从，在前者下令活埋四十万人与大臣要求艾斯德斯去暗杀非大臣派系的良知派官员都会毫无迟疑地去做。
为了引出Night Raid而在抹杀良知派官员时冒用Night Raid之名，最后被Night Raid派出的布兰德与塔兹米的联手下被消灭。
罗刹四鬼
大臣在建立狂野猎犬前的杀手锏，为四个无帝具的行刑者所组成，长期修行且食用危险种让他们能自由操纵自己的身体，能让身体自由变形。
在大臣送去保护安宁道时被赤瞳杀死一人拉伯克杀死二人。
特殊警察Jaegers[狩人](青文版：帝具猎人)
为了歼灭活动越来越频繁的Night Raid，而由大臣委请艾斯德斯将军担任指挥的情况下，由艾斯德斯组织成的帝具使集团。
安宁道
在帝国民众之间有着广大信徒的宗教。以累积善行就会得到幸福和长寿为宗旨，在短短十年内信徒增长速度越来越多快，已成了帝国东方的一股庞大势力。
异民族
非帝国人的其他民族的统称。从北、西、南三方包围着帝国，与帝国时而常有战争发生。
有些被帝国雇佣为佣兵，在和Night Raid的斗争中有出现过。北方的异民族在发起战乱后被艾斯德斯击溃，西方异民族则与革命军缔结为同盟，现与帝国是敌对关系。
在数年前南西方的异民族也对帝国掀起过叛旗，但在很短的时间内就被艾斯德斯消灭了。
秘密警察Wild Hunt[狂野猎犬]
不同于Night Raid和特殊警察Jaegers、同在帝都内活动的第三股势力。
因为Jaegers在和Night Raid的多次争斗中殉职数名成员，而为了取代其存在、由大臣之子席拉将他在国外收拢到的人才所组建的战斗集团。
相较于Jaegers，行动上显得特别的暴虐，因此与主要负责消灭帝都内的罪恶的Night Raid发生多次冲突，也因为行动太没节制而和Jaegers的关系相当的差，几乎到了成仇的地步。
帝具
1000年前，建立了帝国的始皇帝为了永远守护国家，但认为自己也会有死去的一天，觉得武器或防具的话可以一直继承到未来并守护国家。
所以用各种传说中的超危险种为材料，加上各种稀有金属，还有从世界各地招来的最顶级的匠师们，并以其巨大的财力与权力所开发出的以现在也无法制造的48件兵器，并称之为“帝具”。
有着消耗体力和精神力换取强大威能的力量，并还有各种隐藏能力，由于对人体精神力及体力消耗量大，一个人最多只能使用一个帝具。帝具持有者彼此对战则必然会有一方殒命。但在500年前因内乱而有半数以上下落不明。对该帝具的第一印象将是决定能否使用的关键。
一斩必杀：村雨(一斬必殺村雨，One Cut Killer: Murasame)
日本刀型帝具。对斩伤的伤口会施以咒毒，并无解毒方法，令受伤者立即死亡。不过对没有心脏或已死的对象无法产生作用。
即使受到一点小擦伤也会死亡，因此在使用与保养上要特别的小心。
于动画版中的隐藏技能是赤瞳用村雨斩伤自己，将以往所杀之人的悲叹、伤感、愤怒、仇恨灌入自己，以自己来承受，力量、 速度都有大幅度的提升。
百兽王化：狮子王(青文版：狮王合一)(百獣王化ライオネル，Animal King Form: Lionelle[注释 1])
腰带型帝具。能够让使用者兽化，并大幅提升各种身体能力,嗅觉之类也会被强化,能引起索敌的效果。
隐藏能力是超治愈力，配合拉伯克的千变万化甚至能接回被斩断的肢体。
浪漫炮台：南瓜(浪漫砲台パンプキン，Roman Artillery: Pumpkin)
巨大的枪型帝具。将使用者的精神能量化为冲击波射击出去。
使用者的危机程度越高以及情绪越高涨，威力也会提升越高。可依照情况变化改变型态。
恶鬼缠身：入侵(青文版：硬壳死奥)(悪鬼纏身インクルシオ，Demon Armor: Incursio[注释 2])
铠甲型帝具。虽为铠甲型帝具，但型态为一把剑，将剑插入地面召唤出铠甲包覆全身。
以铁壁般的防御力自夸的帝具，能够增强穿着之人的能力，因为对装备者负担极大，普通人穿上的话便会死掉。
制作的材料为一种名为泰兰德的拥有不可思议生命力的凶暴龙形危险种，被视为灾厄的化身，经常为了适应各种极端的环境而不断进化。
被当作恶鬼缠身材料的个体甚至进化出了透明化的能力，因此恶鬼缠身隐藏能力为透明化。
一旦透明化时限一过就必须卸下铠甲重新装备才能再使用。发动时并不会消去一切气息。
作为材料的现在，泰兰德的肌肉仍然活着，为了打倒敌人而持续著进化。
漫画54话中，由于塔兹米的意志进化为最强型态，可以足以瞬间适应魔神显现：恶魔之粹的秘技“摩诃钵特摩”，可逼艾斯德斯出全力。
千变万化：交叉之尾(青文版：游丝摆尾)(千変万化クローステール，Infinite Uses: Cross Tail)
线型帝具。是由栖息在东海之云中的超级危险种的体毛做成。
特别是保护要害的体毛，极其坚韧，这个部位制成的线异常锋利，被称之为断界线，但这种线只有一根。
能够张开为结界或是陷阱，也拥有拘束、切断的能力，也能集中起来穿着在身上当铠甲或变成武器，如其名称一样千变万化。
万物两断：销魂(青文版：X字双刃)(万物両断エクスタス，Cutter of Creation: Ecstasy)
大型剪刀帝具。世间的一切物体都能剪断，因为坚硬度极高，也能用于防御。
隐藏能力是金属部分能放出强烈的光芒暂时令人失明。
变身自在：盖亚粉底(青文版：大地粉底)(変身自在ガイアファンデーション，Phantasmagoria: Gaea Foundation)
化妆帝具。能让使用者按意愿变成任何东西。
电光石火：须佐之男(青文版：素盏鸣尊)(電光石火スサノオ，The Speed of Lightning: Susanoo)
生物类人型帝具。生物型帝具只要核心没被破坏，即使被大卸八块也能复原。
因为是用于护卫重要人士帝具，所以脑内有战斗与家事功能，核心是胸口上的勾玉。
隐藏能力是祸魂显现，代价是会消耗使用者的生命力，3次之后使用者便会耗尽生命力。
祸魂显现之后各方面能力会得到强化，且能够使用八咫镜(反弹攻击)、天丛云剑，在3次祸魂显现次数中，就算核心被破坏也能再复原。
五视万能：观察者(青文版：旁观者清)(五視万能スペクテッド，Omnipotent Five Sights: Spectator)
眼型帝具。安装在额头使用。能够进行远视、微观、预见、让敌人看到幻觉、并能感知敌人的想法。
魔兽变化：百臂巨人(青文版：赫加顿克尔)(魔獣変化ヘカトンケイル，Magical Beast Transformation: Hekatonkheires)
生物类犬型帝具。生物型帝具只要核心没被破坏，即使被大卸八块也能马上复原。
爱好是吃人，感情很丰富。平常是不到赛琉一半高度、看起来很像可爱的玩偶，战斗时则会变成两米多高的凶暴猛兽。
赛琉失去双手换装Dr.时尚开发的义手后，有将Dr.时尚开发的武装收纳在体内的功能。
隐藏能力是能够使其狂暴化，代价是狂暴化后过热数个月不能使用。
两柄大斧：贝尔瓦克(青文版：轰终伐酷)(二挺大斧ベルヴァーク，Double-Bladed Axe: Belvaac)
斧型帝具。因为重量极重，只有拥有过人臂力之人才能挥舞，但相对的攻击力也极强，
并能从中分开成两把斧头，投掷出去之后只要还有力量就会追踪敌人。
军乐梦想：尖啸(青文版：惊声尖啸)(軍楽夢想スクリーム，Military Music Dream: Scream)
笛型帝具。能够操纵听到笛声之人的感情的帝具，不过对不懂音律的人效用就不是很大，过去常用于战场提升士气而广为人知。
隐藏能力是把自己的肉体给强化的“鬼人招来”。
水龙凭依：黑马林(青文版：黑色之海)(水龍憑依ブラックマリン，Water Dragon Possession: Black Marlin)
戒指型帝具。以水栖危险种能操作水流的器官为材料制作。
装备者能够自由操作所接触到的液体。但在没有液体的环境下就无法使用。
隐藏能力是将自己的血液当成武器来操纵的“血刀杀”。
死者行军：八房(死者行軍八房，March of the Dead: Yatsufusa)
日本刀型帝具。能够操纵用此刀杀死之人、危险种的尸体。
最多能操作8具尸体，并能够再现尸体生前所拥有的实力，尸体生前所使用的帝具也能够再使用。
神之御手：完美者(青文版：完美主义)(神ノ御手パーフェクター，Glorious Hands of God: Perfector)
盔甲手套型帝具。能让手部的精细动作达到数百倍以上的效果。
炼狱招致：路比冈德(青文版：戮匕康帝)(煉獄招致ルビカンテ，Purgatory's Invitation: Rubicante)
火焰喷射器型帝具。能放射出强力的火焰，且用水无法扑灭。
隐藏能力是发射出长距离的球形火焰“岩浆炼成”。
万里飞翔：莫斯提马(青文版：默思天魔)(万里飛翔マスティマ，Soaring for Thousands of Miles: Mastema)
翼型帝具。能够让使用者飞行，并能使用羽毛进行攻击，可进行远距离攻击。
隐藏能力是“神之羽翼”可以应付近距离攻击。
修罗化身：贵族战车(青文版：古兰战轮)(修羅化身グランシャリオ，Carnage Incarnate: Grand Chariot)
铠甲型帝具。虽为铠甲型帝具，但型态为一把剑，将剑插入地面召唤出铠甲包覆全身。
比恶鬼缠身的型号还要新，但不能透明化。
魔神显现：恶魔之粹(青文版：恶魔精华)(魔神顕現デモンズエキス，Djinn Manifestation: Demon's Extract)
血液型帝具。是栖息在北方能控制冰的超级危险种的血液，将其喝下的适合者就能得到操纵冰的能力。与需要水才能使用的黑马林不同，可以凭空制造出冰来。
普通人要是喝下就会产生无法抑制的破坏冲动，适合者则会在身上出现印记。
隐藏能力是能冻结时空的“摩诃钵特摩”，不过本来是没有这样的隐藏能力，是艾斯德斯自己开发出来的。
次元方阵：香格里拉(青文版：香巴拉)(次元方陣シャンバラ，Dimensional Formation: Shambhala)
空间传送型帝具。能够传送至纪录地点。不过一次只能传送少数人并要耗费大量能量，因此无法在短时间内连续使用。
该帝具开始由席拉持有，席拉死后被拉伯克夺取。拉伯克在越狱时，左手和次元方阵：香格里拉一起被以藏用“江雪”斩断。
奇奇怪怪：阿达由斯(青文版：阿答犹司)(奇奇怪怪アダユス，The Mysterious: Adayusu)
镰型帝具。持有者还未使用其能力前就被赤瞳斩杀，所以能力不明。
月光丽舞：风刃剑(青文版：流月闪刃)(月光麗舞シャムシール，Moonlight Sword Dance: Shamshir)
弯刀型帝具。能够发出真空刃。特点是威力会随着月龄变化而变化，满月之时威力最强。
大地鸣动：重压(青文版：重重重压)(大地鳴動ヘヴィプレッシャー，Earth Shaker: Heavy Pressure)
麦克风型帝具。能发出超音波粉碎敌人。
发动期间会让周围的生物因此感到痛苦，短时间内无法自由行动，而且因为是范围形效果，所以连己方成员也会被卷入。
快投乱麻：大投手(青文版：亡牌投手)(快投乱麻ダイリーガー，Ace Solution: Die Leaguer)
6个球组成的帝具。每个都拥有不同的属性，需要投出才会奏效，投出后球会飞回来。
焰之球(火焰属性)包裹着火焰使攻击力增强。
雷之球(雷击属性)对目标产生电击并附加停滞效果。
冰之球(冰雪属性)将目标冻结。
风之球(风暴属性)速度最快的球，会产生旋风。
腐之球(腐蚀属性)会将击中的部位给腐蚀掉。
爆之球(爆裂属性)命中后产生爆炸。
血液收集：极速吸取(血液徴収アブゾデック，Blood Collection: Absorb-Dex)
吸血鬼牙齿型的帝具。安装在口腔内使用。
用以吸取他人血液，可用于自我治疗或提升自身实力。可将对方吸成人干。
超力喷出：巴尔扎克(超力噴出バルザック)
面具型帝具。在娜杰塔还是帝国将军时由她的副官持有该帝具。
能将使用者的潜力100%地发挥出来。
雷神愤怒：亚得米勒(雷神憤怒アドラメレク，Adrammelech)
布德大将军的帝具。拥有操纵雷云的能力，能够轻易地操纵雷电来进行攻击。
隐藏能力为雷霆凝射，是创造出大量雷云并集结所有雷电并射击的招式。
伊雷斯顿：
奥内斯特大臣的帝具。头环型帝具，在一定范围内可以破坏其他帝具，但镶在上面的宝石会暂时碎掉，需要一个礼拜才会再生，这段时间内无法使用。
动画中的造型看起来像是镶有眼珠的戒指，最后决战时大臣用其把百兽王化：狮子王破坏
臣具
在始皇帝打造出帝具的400年后，当时的皇帝为了重新打造出帝具而下令制作、但最终失败的结果。就性能来说比寻常武器高，但威力不及帝具，且具有一定的副作用。在柯斯吉为了打造出忠于帝国的暗杀部队时被他取出交给赤瞳等人使用。
桐一文字(桐一文字)
日本刀型的臣具。被其刀刃斩开的伤口会无法治愈。
赤瞳在暗杀部队期间使用的武器，在和柯斯吉的决斗中损毁。
水龙之剑(水竜の剣(すいりゅうのけん))
剑型臣具。能在三分钟内强化使用者的身体能力，但时效一过就会陷入严重的疲劳状态，且使用能力的瞬间会产生强烈的剧痛。
持有者为纳哈修。
第01话 SYMPTOM 变异
膝丸灯为了救心上人百合子，参与地下格斗会，使自生能力觉醒。突然两位神秘人找到他，告诉他百合子已死的消息。膝丸灯悲愤欲绝，神秘人米歇尔和小町小吉邀请他加入U-NASA火星探测队。为了拯救和百合子得相同病的孩子，膝丸灯决定接受人体改造，前往火星，获取A.E病毒的样本，和伙伴们一同对抗外星物种。
第02话 DEPARTURE 出战
A·E病毒在地球流行起来，U-NASA决定在病毒流行前制作出疫苗，大型宇宙舰ANNEX1号背负着拯救人类的使命驶向火星。希拉喜欢舰长小町，她的爱慕之心所有人都看在眼里。经过39天的漫长旅程，ANNEX1号顺利进入火星大气层，所有舰员将要登陆火星。这时大家遭到火星蟑螂的突袭，众多队员遇难，计划眼看就要失败了…
第03话 TO MARS 前往灾星
火星蟑螂袭击ANNEX1号，破坏舰员们用来增强体质的药物。舰长小町向总部反映情况，他发现一切都是设好的陷阱，此时ANNEX1号主引擎发生故障，向火星坠落。小町和米歇尔及其他同盟国干部合力抵抗，杀死舰上的所有蟑螂。大家依次登陆火星，其他班成员都安全着陆，第六班却被蟑螂围攻，陷入险境。
第04话 WAR 全面战争
小町带领马尔克斯和庆次，准备活捉一只落单的蟑螂，没想到蟑螂使用调虎离山之计，趁小町离开袭击飞船。关键时刻，希拉用手枪制服并活捉蟑螂，却被蟑螂喷射出的超高温气体杀害。小町发现蟑螂们已经掌握了BUGES手术，并加以利用。面对强敌，队员们该如何是好，所谓的MO手术又是什么呢？
第05话 EXCEPTIONAL TWO 奇迹之子
马尔克斯得到白额高脚蛛的能力，为了给希拉报仇，他到处虐杀蟑螂。马尔克斯体力不支，关键时刻小町出手相助。米歇尔是BUGS2号舰长多纳特洛的独生女，她的子弹蚁能力遗传自父亲，爆炸蚂能力则通过后天的MO手术获得，拥有两种能力的她无疑是地球的最强战力。灯一直没忘记来火星的目的，他活捉蟑螂，希望能尽快研制出疫苗。
第06话 2 MINUTES 2分钟
阿莱克斯不敌腿部异常发达的蟑螂，蟑螂趁机驾驶飞船离开，船上的队员惊慌失措。灯得到大蓑蛾的能力，他用最强韧的丝帮助队员脱困，并与拥有异能的蟑螂决战。在另一边，米歇尔被龙虱缠住，双双掉入海中。身为陆地生物的米歇尔，极限活动时间只有两分钟，这么短的时间内，她能成功脱困么？
第07话 CRAB 猛士
米歇尔和灯联手干掉了龙虱，日美联合第二班暂时脱险，此时罗马第六班和日美联合第一班发出求救信号。北欧第三班同样被蟑螂袭击，班长阿西莫夫的女儿感染由“火星异种”起的未知病毒，危在旦夕。因此阿西莫夫十分憎恨蟑螂及其背后隐藏的黑幕，他超强的螃蟹能力带领队员们轻松突围。
第08话 DER ZITTERAAL 电击生物
幼年时无依无靠的阿道夫被军队收留成为M.O手术的实验体，阿道夫受尽折磨，变得不人不鬼，最终获得了电鳗的能力。阿道夫虽然可以去上学，但要接受严密监视和身体检查。在这种情况下，一位名叫罗莎的女人闯入他的生活，并成为他的妻子。某日阿道夫意外发现罗莎出轨，就连孩子也非他亲生，面对如此事实，阿道夫该何去何从……
第09话 TOO SAD TO DIE 雷雨中的一粒
阿道夫始终无法原谅妻子出轨，他把所有的压力倾注在战斗中，疯狂宰杀蟑螂。此时高智慧蟑螂领袖带领训练有素的蟑螂军队出现，众人被围困陷入危机。阿道夫寡不敌众，几乎丧命，众队员拼尽全力保护他。失去意识的阿道夫靠A.E.D.苏醒，他爆发出坚强意志与火星异种激烈对抗。
第10话 DESIRE 愿望
阿道夫使用落雷并未杀死蟑螂领袖，队员们都被捕获，仅剩伊娃和阿道夫两人。伊娃本是富家千金，却因经济危机被父母强行卖给U-NASA。阿道夫早已精疲力竭，他为了保护伊娃死在蟑螂的飞石攻击下。由于阿道夫的心脏停止时间过长而引发了他体内的自爆装置，最终全员都自愿死在了爆炸中。
第11话 BOXER 拳击手
庆次作为一个朴素的拳击手却有着不凡的成就，成为世界轻量级冠军的他依旧每周回家看望病重的母亲，就在他前途大好的时候视网膜却脱落了。因为眼睛的问题庆次放弃的拳击，而母亲也因病过世，在接受人体改造时他选择了视力最好的生物，因为他想从本岛看到母亲长眠的小岛，如今踏上火星上的他再次找到了出拳的理由。
第12话 SHOOTING STAR 轨道与无轨道
小吉舰长眼前的蟑螂所掌握的BUGS手术是蚕蛾，而这本应该属于他深爱着的秋田奈奈绪，这场对战让他的思绪回到了从前。欧洲第三班调查的金字塔其实是火星异种的仓库，他们意识到蟑螂们已经掌握了很危险的武器，而前来火星的某个班已经叛变。用作飞船推进器的燃料罐攻向了日美第一班，缺少药物无法变身的队员们在火海中又遭遇了大批蟑螂的攻击。
第13话 TERRA FOR MARS 彼处与此处
一班二班已经汇合，由于人为干扰，火星与地球的通讯完全中断，此时上千只蟑螂包围了漆丸灯等人。在救助舰到达前的39天里，为了灭杀蟑螂，每个人的能力都运用极致。然而地球方面，并未依照计划发射救助舰，而蟑螂一早就知道ANNEX1号的整个计划，战士与阴谋家的战斗开始……
被赶出孤儿院，濒临饿死的青年·中岛敦所遇到的奇怪男人们——。
光天化日之下忙于跳水自杀，有着自杀嗜好的男人·太宰治。
神经质地翻看着笔记本的眼镜男·国木田独步。
他们，是传闻中将那些军队和警察无法介入的事件解决的“武装侦探社”的职员。
敦在鬼使神差之下被他们要求一同前去惩治扰乱街市的“食人虎”……。
架空的都市·横滨。登场者是，拥有文豪之名的人们。与这些名字相称的异形之力，迸发出火花。
千奇百怪的文豪异能力战斗，就此开幕！
很久之后的未来，人类生活在被岩石隔绝的地带“殖民地”(コロニー)。殖民地外面的未开发地带称为“迷宫”(ラビリンス，Labyrinth)。冒着生命危险去开拓迷宫、标示未开发地带的人，就是“标记者”(マーカー，Marker)。
永远本来与妹妹刹那生活在战国时代的森林中，4岁时森林发生大火，两姊妹失散，永远在寻找刹那的途中遭时代树传送到令和时代，被日暮草太收养。转眼间十年过去，在战国时代担任赏金猎人的诸叶与除妖师刹那，为了拿下妖怪三目上臈互相较劲，却被三目上臈夺去二人分别拥有的珍珠，混战中她们也被时代树传送到现代，永远和刹那重逢，但刹那却因为幻梦蝴蝶的咒术失去对永远的记忆。为了夺回刹那的梦境和记忆，永远跟着诸叶、刹那回到动荡不安的战国时代，展开冒险。
永远、刹那、诸叶，是继承了妖怪与人类血脉的半妖少女们。
幼时被卷入森林大火而分离的双胞胎少女，永远与刹那。永远穿过时代树的穿越时空之隧道，从战国时代来到了现代。她被戈薇的家族日暮家养育长大，成长为精通武道的女中学生。另一方面，留在战国时代的妹妹刹那，在已经成为除妖师首领的琥珀手下以除妖为业。诸叶是戈薇与犬夜叉的女儿，作为赏金猎人得到了「妖怪杀手诸叶」这一别名，每天都在进行除妖的工作。
自从永远与刹那分离以来过了10年。时代树的穿越时空之隧道再度开启。永远与出现在现代的刹那重逢，但刹那不知为何忘记了永远的事情。
包括与刹那一同来到现代的诸叶在内，永远她们这些「半妖的夜叉姬」，开始在现代以及战国时代尽情大闹!
故事的主角群是一群没有过往记忆只知道自己名字的人。自黑暗的地下走出后，面对一个“如同游戏一般”的新世界“格林姆迦尔”。在不清楚自身来历、身置何处的情况下，他们不得已必须加入要塞“欧鲁达那城”的义勇兵团，成为见习义勇兵。主角哈尔希洛和一群与自己境遇相近的角色组成队伍，习得技艺，在这世界唯一的人类王国“阿拉巴吉亚王国”最前线的“边境”求存、奋战。这是一片灰茫中起始的冒险故事，而“活下去一点都不简单”。
主角群们资质平庸，缺乏根基，一切必须从零开始学习与磨练;反观怪物即便是小喽啰，也具备纯熟的武艺与人类般的心机。架构设定上，杀怪取宝卖钱的循环模式，成为主角们支应生活开销的唯一收入来源，他们并无远大志向或神圣使命，亦无不凡身世，一切拼搏冒险，都只为了混口饭吃，改善生活物质。
【终极间谍的天才斗智之战】：在结城中校的力排众议下，日本陆军成立了间谍培训学校“D机关”。在这里，所有成员都被灌输了彻底否定军人信条的三大戒律：“不准死”、“不准杀人”、“不准被抓”。这样的组织自然成为他人的眼中钉，时时腹背受敌；然而“魔王”－结城中校以他犹如魔术师般的高超手腕交出间谍大战的丰厚战果，就连隐身在陆军内部的敌人也被他逐一消灭……从东京、横滨到伦敦、上海，紧张刺激的间谍殊死战，就此展开！
D机关（D機関）
传说中的间谍──“魔王”结城中校在日本陆军设立间谍养成学校兼谍报机关。“D机关”的存在只有极少数陆军高层才知道他们。于昭和12年（1937年）设立。
除结城中校外，无人知道D机关成员的真实身份，连成员自己也都以假名和假经历彼此往来，可说是一群带着假面具过日子的人。成员来自各方，学习各国语言，接受炸药、无线电、开锁、台球、变装等技术训练，甚至包括追求女性的方法，是一群为了国家，带着假面具过日子的人。
陆军内部似乎依旧对设立谍报员培训所一事极为反弹，因而删减原本的预算。这栋建筑是接收昔日陆军使用的老旧鸽舍，加以临时改建而成。后来陆续有人加入或退出，最后留下十二名学生（动画版为八名）。
高中生田中，在日常生活中极力避免麻烦事、爱叹气、总是单手拄著脸，一副快睡着的眼神，基本上也不想努力，跟无法丢下他不管、个头高大且沉默寡言的太田所带来的悠哉缓慢、迟钝且神经大条的青春喜剧。 本作是描述一个懒散却不令人讨厌的田中，以及沉默但爱照顾人的太田两人一段缓和的学园生活故事。