主角的人物角色
塔塔拉‧佛隆
声优：小桥达也/神谷浩史、少年时代橘凛
“红”的主角，柘植神曲乐士派遣事务所所属的神曲乐士的青年。使用的乐器是钢琴，拥有事务所配给的可变换为单人乐团的重型机车“Hamerun”。外表有着轮廓纤细的中性脸庞，个性温和软弱且有些优柔寡断，虽然是故事的主角，但却被契约精灵克缇卡儿蒂完全地踩在脚下。
小的时候因为被遗弃的关系，在孤儿院里成长，由于个性以及处事笨拙，佛隆被周围的人所疏远，因此佛隆对自己没有什么自信;而且对于别人对自己的好感，也是非常的迟钝。血缘关系不明。塔塔拉这个姓氏，也只是为了离开孤儿院后，日常生活上的方便所取的。(塔塔拉一姓是古代七乐门之一;佛隆与“白”时代的乔许相似，学院长推断他有可能为塔塔拉家后代。)有另一说，是孤儿院长为期许佛隆成为神曲乐士而冠上的。
在四、五岁时，连神曲都还不知道的时候，佛隆用歌声与克缇卡儿蒂缔结了不完全的精灵契约，这点在神曲乐士的常识里是不可能发生的事。之后因为雷德斯的关系两者被分开了。过了十二年，施加在克缇卡儿蒂的封印被解除后，两者才再次相会;可是，因为样貌与过去的记忆相差太大，有过“脑里明明就可以接受，但心里却怎么都不肯接受这样的事实”的时期;但是两者携手不断越过重重的障碍，现在已建立起牢不可破的伙伴关系。
佛隆虽然平时看起来是位笨拙且没有什么长处的青年，但身体里却隐藏着惊异的集中力与奇迹般的神曲才能;这些潜能却不太安定，常常都是半调子的情况;不过，一旦完全发挥时，不仅可以只用歌声或只用单一乐器就能演奏出神曲，甚至可以一时之间地将死者雷布诺斯呼唤到世上来。至今佛隆虽然在人们之间还默默无名，但其绝妙的神曲才能却已经在精灵间成为话题。原本佛隆拥有能够大量吸引过来不管级别精灵的能力，但是因为精灵女王克缇卡儿蒂大部分时间不让其他精灵靠近佛隆，佛隆没有办法呼唤出其他的精灵(间中在非工作时间，克提愿意让下级精灵在一旁听着);而由于常常都是跟克缇卡儿蒂在一起的关系，这份才能也变成克缇卡儿蒂的专属物了。虽然曾被人说“曲子之中可以看到克缇卡儿蒂的影子”，但这也成为佛隆的神曲的新的魅力，对精灵们来说这也是一种憧憬。
现在一边工作一边在母校当任每个月一次的特别讲师，与克缇卡儿蒂在学生间里有很高的人气;学生们甚至于把“易于亲近的佛隆”当成未来目标的具体典范。
在结局中，由于成为克缇卡儿蒂的共生体，所以享有永恒的寿命，不老不死，并接受了学院长的邀请，成为“四乐圣”的继承人之一。
小杰·富力士（ゴン＝フリークス，Gon Freecss）
声优－日本：竹内顺子／潘惠美／松本梨香；中国台湾：魏晶琦／郭馨雅；中国香港：雷碧娜／张颂欣（TVB）、郑佩嘉（Animax）
本作第一男主角。性格纯朴、善良、天真开朗，童年时光多半在树林里度过，所有的动物对他十分友善。想法过于天真与简单，因此很容易吸引朋友和敌人的注意力，同时也是奇犽最好的朋友。有着超人一般的视觉和嗅觉。事后得知父亲还活着并且是名猎人，让自己也想要成为猎人，追寻父亲并且了解父亲不顾一切也要追求的目标。缺点是脾气过于冲动、固执，经常缺乏对事情的全盘思考。有着超龄的身体能力，愤怒的时候、力量尤其强大。
念能力属于强化系，能以较快的速度恢复、强化的力量。招式名为“猜猜拳”，是一种将剪刀、石头、布用于战斗的招式。但在与尼菲彼多战斗，由于愤怒过度使用誓约与制约，强制让肉体与力量成长成到可以击败尼菲彼多的状态。付出的代价连猎人协会找来的除念师也无法处理。在被阿路加的能力治疗后丧失原本念能力但还有气，故事已交代他的念能力可再使用但必须从头练起。
三鹰朝(三鷹アサ)
于第二部首话的第98话登场，第二部的主角。一名性格冷漠、不喜与人交际的女学生，因双亲被恶魔吃掉而憎恨恶魔、链锯人。在意外压死咕咕哔后被班长与田中老师邀出来参拜咕咕哔，却在前往的路上被与正义恶魔签订契约的班长攻击，而濒临死亡。死亡前被战争恶魔夺去身体，但被战争恶魔留下一半的大脑而能保住自己的人格，并能与其对话。被战争恶魔称呼为“朝”。
空操弹马(くうそう だんま;Dan Kuso、Daniel Kuso、 Danma Kuso)
初登场11岁，第二季15岁，第三季16岁，第四季17岁，通称“小弹”。
本剧中心人物，老是不先经过大脑思考就行动，属于横冲直撞的行动派，口头禅为“太完美了(完壁き)”。擅长力量型的作战，世界排名第一的战士。喜欢琉乃，却时常跟她打情骂俏。于第1季完结篇跟琉乃成为情侣。
于第2季与小骏、丸兆以及新爆丸战士—米拉、艾斯和巴隆一起对抗HEX，并瞒过初期打算跟小弹一同前往的琉乃，与丸兆前往异次元龙世界。于琉乃被当作人质时显得十分紧张，后来与琉乃约定与HEX战斗结束后平安回来。
第3季因父亲工作关系而从鸠留镇搬到BB镇，同时认识了杰克·威勒利并教导他爆丸战斗。
第4季前期与梅格梅尔有相同的关系连接着。初期更因为不知道“锁匙与闸门”的关系而无法掌握独角巨强大的力量而使其失控。
第4季完结篇决定暂时不参与爆丸对决，悄悄跟伙伴们不告而别后，向加藤先生借了一艘小船游走世界各地。
配音：小林优(日本)、许云云(中国台湾)、袁淑珍(中国香港)、Scott McCord(英文)
常用爆丸：独角巨龙(全系列，主要)、血红毒蝎(第2季，次要)(由米拉给予)、法布尼尔(第二季，临时主要)(隐居)、雷布超人(第4季，临时次要)(后回归钢士利萨德)
三槌 久远
配音：神谷浩史
外表年龄：13、14岁 因为回复能力很强 所以实际年龄不详 不过从第五章回忆来看大约有一千岁了。看似遗世独立的普通少年，不时浮现出深深的哀伤及激烈的愤怒表情。 有暴走能力与多种能力，其真实能力不明。能够感知有能力的醒觉者，是保护著无处可归的同伴们的“Attractor”的中心人物。家属现今为三槌 永远。在最后一章中为了保护能力者，拼死与上代决斗，成功握住上代的手臂，进入上代的意识解脱了永远并与之融合，形态是暴走形态下脱去外壳后，变得如同灵魂一样的存在。与上代源治决斗完后，失去回复的能力，在片尾他自己也说自己的时间终于开始转动
家庭背景：三槌 久远是能力村的孩子，从小和弟弟在一起，却因为弟弟救助外村的人，从而让能力村的秘密泄露，招来杀戮，全村洗劫杀害，从而暴走能力，杀死了所有人，逃离村子加入了“Attractor”。
家庭背景：是能力村的孩子，从小和弟弟在一起，却因为弟弟救助外村的人，从而让能力村的秘密泄露，招来杀戮，全村洗劫杀害，从而暴走能力，杀死了所有人，逃离村子加入了“Attractor”
出现章节：
第一章 泡沫の花弁(泡沫的花瓣) DVD发售日：2011.8.26
第二章 混沌の兰舞(混沌的兰舞) DVD发售日：2011.09.22
第三章 梦幻の连座(梦幻的连座) DVD发售日：2011.10.26
第四章 红莲の焦心(红莲的焦心) DVD发售日：2011.11.25
第五章 双绝の来复(双绝的来复) DVD发售日：2011.12.22
第六章 永久の久远(永久的久远) DVD发售日：2012.01.27
诺尔·史塔吉亚(ノル・スタルジア，声：逢坂良太)
本作主角，史塔吉亚准男爵家的三男。几有异性缘。喜欢巨乳美女。
相比无能的父亲，能力更受其妹其母肯定，成为史塔吉亚家的顶梁之柱。
性格胆小怕事，但面对重要的人遇上危险事故或重大事情时，还是会挺身而出，那怕超出其能力范围也绝不后退。
原本只拥有一种技能——“大贤者”，但自拜奥莉薇为师起，渐渐增添零零种种的技能，亦以超乎他人的速度变得更强。
原本只打算担任图书馆管理员，但被上级贵族子弟抢走其职位，被其妹建议报考英雄学校而成为英雄学校的新生。
为解决英雄学校的高昂学费而加入冒险者公会‘奥丁’，同时成为当中最受瞩目、众所期待的新人冒险者。
因为先后帮助艾博特公爵解除其千金玛丽亚“十六岁的死印”的诅咒，以及替伯恩公爵从怪盗Phantom手中夺回其宝物【人鱼之泪】，分别获得大量资金和找到合适的店铺选址并用极平的租金租下，成功实行开设稀有商店计划，专门出售其在迷宫中收集到的各种稀有素材。
在动画最后一话，为了成功打败化身成奥莉薇样子的死锁咒，一口气牺牲除了“创作”、“赋予”、“编辑”奥莉薇所给的三大技能外的全部技能，一共17项，发动第二次更强力的“活贡”。最后从与奥莉薇的对话中，得知他已一步步重新赚取LP，恢复了大部分曾用来牺牲的技能。
拥有技能
“大贤者”(声：大泊贵挥)：能够传授世上所有真理(连未解明的也可以)。非常稀有，但施展出来后的代价是会头痛得要死。
“创作”：可以把脑海中的想像实际地创造出来。发动技能需要消耗LP。技能越强力，花费的LP也就越多。
“赋予”：把“创作”出的物品赋予其他人。发动技能需要消耗LP。技能越强力，花费的LP也就越多。
“编辑”：编辑自己或者他人的技能。发动技能需要消耗LP。技能越强力，花费的LP也就越多。
“LP变换”：在做一些舒服的事情时，包括满足性欲、食欲和物欲，伴随幸福度的变化，LP也随之变化。
“石弹”：将大气中的尘土压缩至拳中，化作石弹发射。石弹的大小原本为10CM，后通过“编辑”为100CM。
“鉴定眼”：可以窥视一切讯息。
“头痛耐性”：用来减轻使用“大贤者”后的副作用，消费LP300。
“异空间保存C”：能收纳巨大物品的异空间仓库技能，首次用来储存巨兔的尸体并带回公会与其他成员分享食用
“后撤步强化”：强化“后撤步”，消费LP200，相比要消费LP1000的“体术C”性价比较高。
“受身”：减轻身体坠地时受伤，消费LP30。
“揉肩”：为得到爱尔娜老师的奖励而“创作”，消费LP80。
“幸运色狼”：奥莉薇·赛邦特推荐创作的技能，能够借由各种突发事件来满足性欲以增长LP，消费LP300，但后来经过诺尔消费LP160调整触发频率及场所来降低对生活影响。
“迷宫楼层移动”：奥莉薇·赛邦特推荐创作的技能，消费LP600。
“闪光”：奥莉薇·赛邦特推荐，可以令人眩晕的技能，消费LP200。
“夜视”：在幽黑的迷宫里方便进行探索的技能，消费LP200。
“屠龙”：为了应付英雄学校的收集稀有素材“龙牙”的考试，而“创作”出能对付巨龙的技能。
“白炎”：奥莉薇·赛邦特推荐创作的技能，带有圣属性，对付僵尸什么的会有奇效，与“水球”、“紫雷”一并“创作”共消费LP1300。
“水球”：奥莉薇·赛邦特推荐创作的技能，可以用水攻击，遇难时也能够用来解渴，与“白炎”、“紫雷”一并“创作”共消费LP1300。
“紫雷”：奥莉薇·赛邦特推荐创作的技能，基本用来防身，透过“编辑”会变强力，与“白炎”、“水球”一并“创作”共消费LP1300。
“魔法融合”：奥莉薇·赛邦特推荐，可以融合迄今为止得到过的技能，然后做出属于自己的最强魔法。
“道具鉴定眼”：顾名思义，可以洞悉道具资讯的技能。
“舞蹈术”：为了在比舞较量上战胜情敌麦克而“创作”的技能，消费LP200。
“活贡”：牺牲自己的技能来增强身体能力和魔法威力的稀有技能，但强化时间很短暂，消费LP10000。
皮卡丘（日语：ピカチュウ，罗马化：Pikachu，粤语旧译：比卡超）是《精灵宝可梦》系列里908这个虚构生物宝可梦中的一种。出现在该系列的各种电子游戏、动画、电影、卡牌游戏、漫画和其它产品及标志。皮卡丘是由西田敦子所构思、并由杉森建所完成设计的。皮卡丘的首次登场是在《精灵宝可梦 红·绿》中，由于受到电视动画的影响，皮卡丘成为最为知名的宝可梦，亦是精灵宝可梦系列的象征。
小智的皮卡丘
小智的皮卡丘是动画的主角，也是主角小智最好的伙伴。性别为雄性，小智的皮卡丘的配音员为大谷育江。这只皮卡丘时常待在他的肩膀上，非常讨厌进入精灵球中。
得益于电视动画突出的表现，可能是整个作品系列中最出名的皮卡丘个体。又有可能是因为他的主人小智是一个超级真新人，因此在爱好者和普遍现实中，有以“皮神”的称号。
简历
原本是一只野生的宝可梦，出身地不明，皮丘时期被袋兽照顾，后来进化成皮卡丘之后离开袋兽身边，之后被大木博士收服之后以初始神奇宝贝送给小智。在刚开始时它是只不良宝可梦，小智舍身救它才让它听话，此外，皮卡丘因为想以现有姿态变强而也非常不愿意进化成雷丘，小智也已决定不让皮卡丘进化。
它是火箭队三人组的最主要的捉拿目标，火箭队的喵喵特别讨厌它。它至少破坏了三名动画女主角的脚踏车[来源请求]，也经常用十万伏特等绝招破坏火箭队的热气球。其行动也常常会违反游戏中的设定，例如靠着消防装置来电击大岩蛇，把尾巴插入地面来将雷丘的电属性招式无效化。
对游戏的影响
皮卡丘不会进到精灵球中，而会跟在玩家角色后面走，亦不能用雷之石进化成雷丘。
日本为庆祝电影《神奇宝贝剧场版：幻影的霸者 索罗亚克》上映，在2010年7月15日至8月10日止，以Wi-Fi配布“小智的皮卡丘”（サトシのピカチュウ）于珍珠、钻石、白金、心金、灵银五版本上。等级50，性格顽皮（やんちゃ），位于贵重球（プレシャスボール）中。配招有伏特攻击（ボルテッカー）、铁尾（アイアンテール）、十万伏特（10まんボルト）、电光一闪（电光石火）（でんこうせっか）。携带电气球（でんきだま），附有特殊奖章。
其他的皮卡丘
动画中小智的对手的阿弘有一只名为“雷恩”的皮卡丘，前发的浏 海是它的特征，配音员为兴梠里美。
〈皮卡丘的森林〉一集中出现了大量野生皮卡丘，但官方公布声优只有川田妙子（矮小的皮卡丘，CAST表记为皮卡丘A-川田纱子）和西村千奈美（CAST表记为皮卡丘B）。
第68集（日本为69集）冲浪好手敏村特有一只名为“马奎尔”的皮卡丘，可以感应海浪，蓝眼睛是它的特征，叫声除了皮卡，还有AAAAA，配音员为坂本千夏。
精灵宝可梦XY&Z（22集，XY114集）里流浪吉他手吉米（jimmy）有一只名为尖毛（tongari）的皮卡丘。跟主人一样热爱摇滚乐。可以使用雷电拳和挖洞等小智的皮卡丘不会的绝招。头上的尖毛是它的特征，跟阿弘的皮卡丘极为相似。配音员为小樱悦子。
旅途第35集小豪在看到小智和皮卡丘互相友好情景后，决定自己也要收服一只皮卡丘，当小豪捕捉附近的野生皮卡丘都失败之后，出现一只会分享树果的雌性皮卡丘，小豪在小智的提醒下趁机成功收服这只皮卡丘。之后它将大家带到了一处岩壁前，那里聚集了大量的皮卡丘正在开凿岩壁以获得雷之石进化成雷丘。小豪的皮卡丘也挖到了一颗雷之石并赠与它的训练家小豪，之后火箭队出现抓走了众多皮卡丘包括小智的皮卡丘。小豪的皮卡丘也要救出众多皮卡丘的时候被火箭队发现也被机器抓住，千钧一发之际，它示意小豪将雷之石扔给它，在被吸进装置里时进化成了雷丘。
小智（日语：サトシ），是日本动画作品《精灵宝可梦》的虚构角色，同时亦是动画全系列故事的主角。他的梦想是成为世界上最伟大的宝可梦大师。他拥有皮卡丘、喷火龙等众多源自各地的宝可梦。他的设计是用精灵宝可梦红、绿、蓝、皮卡丘、火红、叶绿版的主角来做基本。小智一名是作者田尻智取其名而诞生。
在西方国家中，小智的名字被改名为“阿修·卡切姆”（英文：Ash Ketchum）。英文姓氏（Ketchum）是源于精灵宝可梦的英文标语：Gotta catch 'em all。
别名：阿修·卡彻姆
年龄：10（第1集）
性别：男
出生：关都地区真新镇
职业：宝可梦训练家 、阿罗拉地区冠军
头衔：阿罗拉地区冠军、男爵（对战城堡）、名誉训练家（橘子联盟）、八大师（宝可梦世界锦标赛）
亲属：花子（母亲）、未登场的爸爸、未登场的爷爷
EP：关都地区
由于一开始皮卡丘完全不肯服从小智，小智唯有靠自己收服宝可梦，连续收服2只波波失败，就在小智以掷石攻击波波，命中目标时，惊觉那不是波波，而是烈雀。小智及皮卡丘遭受烈雀群袭击，慌忙逃走。其间一个女子在钓鱼期间拯救了他们，小智按她的指示，向常磐市冲去，但被烈雀群追上，此时皮卡丘已受重伤，为了救它，小智牺牲自己，抵挡烈雀群。皮卡丘眼见小智舍身相救，终于明白小智对它的爱护及好意，就在烈雀群即将击中小智的千钧一发之际，它冲到小智面前，并使出强烈的“打雷”绝招。
终于成功把烈雀群赶走，小智和皮卡丘亦成为好友。此时小智及皮卡丘遇见了一只神秘的宝可梦（大木博士不敢相信），是后来小智估计的凤王（由于当时金银版还未推出，因此其名字要在后期才能知道）。而凤王只会出现在真心照顾宝可梦的人的眼前，事件亦描绘出小智对宝可梦们非常爱护：为了保护他的宝可梦，他可以连自己的性命也不顾。在旅程中，凤王多次在小智面前出现。
之后小智和拯救他及皮卡丘的女子──小霞结伴同行，其后认识尼比道馆训练家小刚，尼比市道馆赛后小刚加入成为新的同伴。
然而一开始小智的技巧可说是极为生疏，依凭运气才收服到他第一只宝可梦，对战上也不够熟练，运气好的是在挑战最初的几个道馆时常因一些事故而直接获得徽章，而在这段期间内小智的实力也逐渐成长，最后成功以自己的力量收齐徽章，参加石英联盟。在第一次参加的石英联盟时由初赛出线至淘汰赛，于16强止步，以第1次参加联盟大会的训练家来说是不错的成绩，也比劲敌小茂更好。
EP：橘子群岛
回到真新镇后，他为了替大木博士拿GS球而前往橘子群岛，并在一时兴起下决定挑战橘子联盟。旅行刚开始，小智一行人来到内木研究所，然而这里令小刚燃起浓厚的兴趣，并毅然决定留在内木研究所帮忙，而小智与小霞也决定跟他道别。小刚离队后没多久两人结识宝可梦观察家兼大木博士的忠实粉丝－小建，由于得知两人与大木博士熟识，便决定跟着他们一起旅行，橘子群岛的旅程在此刻才正式展开。
最终小智在胜利者杯大获全胜，从橘子群岛回来后，与一直以来视为劲敌的小茂首度交锋，双方派出自己最自豪的宝可梦－皮卡丘对抗伊布，一番苦战后小智战败，对小茂誓言下次绝不会再输，也决定要挑战城都联盟。另外，原本留在内木研究所帮忙的小刚突然率先回来，详细经过不明（一旦在他面前提起“内木”两个字就会变得失魂落魄，问起原因他也死都不肯回答），而一直跟着小智在橘子群岛旅行的小建也决定留在大木研究所担任助手，不再旅行，同时小刚再度回归队伍，三人就此往城都地方出发。
EP：城都地区
在城都联盟白银大会16强中，小智再度与小茂决战，这场6对6全面对战，双方都以最强的阵容来应战。最后的殊死斗，小智的喷火龙对小茂最强的水箭龟，小智利用对战场地，喷火龙用“过热”熔化场地，水箭龟的“水炮”令场地满布蒸气。喷火龙乘机接近水箭龟，贴身混战后，水箭龟失去战斗能力，小智以6比5打败小茂晋级。
但是到了8强与来自丰缘地区的叶越交手时，叶越充满特性的宝可梦使小智陷入危机，小智和叶越激战后派出最后仅余仍能作战的宝可梦－喷火龙和火焰鸡作为两人之间的殊死斗，最后喷火龙和火焰鸡虽一同站起，但喷火龙尝试再用“喷射火焰”时倒下并失去战斗能力，小智以5比6战败，8强止步。另外，虽然叶越打败小智进入前四强，可惜他的火焰鸡已受重伤，没有派它上场，最终败给樱桃镇出身的选手杜舍，4强止步。
白银大会最后在杜舍获得优胜的结局下闭幕，小智与必须回家的小霞和小刚告别，重回真新镇的小智想着自己从未到过的丰缘地区，决定为了重新出发，于是只带着皮卡丘前往丰缘地区。
AG：丰缘地区
到达未白镇后，小智采纳叶越的建议，先步行至古辰镇寻找丰缘地方的名研究员－小田卷博士，在此同时、小遥也正好前往，小智因此在小田卷研究所认识了新人协调训练家小遥和其弟弟小胜，后来小刚再次加入，4人结伴并展开全新的冒险─丰缘之旅。另外、小遥到达凯那市参加华丽大赛，虽然不幸战败，但也因此找到了目标─参加华丽大型庆典。4人旅行的途中还遇上丰缘地方两大邪恶组织—水舰队与火岩队，有时他们也加入阻止这两大邪恶组织的计划。
在彩幽大会时却以5比6败给哲也，再度于8强出局，并在最后以哲也获得优胜的结局下闭幕，一行人踏上归途，在通往橙华市的岔路上告别了小遥姐弟，而在回到关都地方之后再度与要回到尼比市到小刚道别，独自一人向着真新镇前进。
AG：对战开拓区
从丰缘地区回程路过常磐市时遇见了对战开拓区的董事长亚希达，得知了对战开拓区的存在。回到真新镇不久便与跟着小田卷博士来到关都的小胜再会、另外还有小霞，而隔日小遥也来到了真新镇，重逢的一伙人在寒暄几句并且举办完宝可梦迎新会后，小智表明要出发挑战对战开拓区，而小遥也打算挑战关都地方的华丽大赛，三人便与赶过来的小刚再度结伴踏上旅行。另一方面，小霞也短暂跟着同行，到了月见山才向小智四人道别。
而在成功称霸对战开拓区之后，他婉拒了亚希达要他成为开拓之脑的邀请。旅程接近尾声，小遥与小胜为了回到丰缘地区，一行人来到港都梣木镇，与小遥一同参加祭典活动所举办的宝可梦华丽大赛，两人漂亮通过第一次审查，演变成两人争夺第一的局面，最后以共同获胜为结局，而只有一面的梣木奖牌在两人的默契下一分为二，各拿一半作为共同优胜的证明，在日后个别的旅程中也当作友谊与回忆的象征带在身上做为护身符。在送走小遥姐弟前与小胜约定，当小胜成为宝可梦训练家的那一天一定与他对战。在望着小遥姐弟俩所搭乘的船远行后，小智与小刚往家乡的方向前进，终于到了往真新镇与尼比市的岔路口，小智第三度与小刚道别，独自返回真新镇。
在回程途中，他遇到刚从神奥地区回来的小茂，小茂在神奥地方收服的的电击魔兽轻易把火箭队打飞，在回到真新镇后2人再度对战，小茂以电击魔兽击败小智的皮卡丘，令小智感受到神奥地方这未知领域的冲击，为展开新的旅程，小智在翌日便出发，乘船前往神奥地区。
DP：神奥地区
在小智刚到达神奥地区时就遭到火箭队袭击，因而与皮卡丘失散，在寻找的过程中再度遇上小刚，两人便一同行动。不久遇上一位带着电击怪训练家，他以宝可梦的强弱而决定捕获目标的态度使小智感到非常反感，在那位训练家提出与小智进行对战，但因小智的宝可梦数目不足作罢。
之后结识救了皮卡丘的当地的新人协调训练家小光及她的首只宝可梦波加曼，事后在小光的提议下，3人结伴同行，展开神奥之旅。不过就在旅程即将开始之际，那位训练家—真司，出现于众人面前，再度要求与小智进行3对3的对战。小智和真司的第1次战斗，在研究所的后院草地开始，战斗以赛和告终。真司因对姆克儿的能力不满而把它野放，这令小智感到十分愤怒，于是各自为证明培养宝可梦方法的对与错，在往后的日子以此为目标而努力。
当小智取得7枚神奥地方徽章时，在雷司的提议下，小智与真司在睿智湖为各自对培养宝可梦的理念而进行6对6全体战。但真司的战术，加上小智一次次的战术失误，令真司取得压倒性优势。在小火焰猴进化成猛火猴的情况下，小智仍不能挽回败局：猛火猴的“音速拳”对电击兽的“雷光掌”，最后猛火猴失去战斗能力，小智以2比6惨败收场。压倒性的战败让小智感到前所未有的挫折，对自己的努力感到疑问。后来在小光与宝可梦们的鼓励下，小智重新振作。
终于，小智获得参加神奥联盟的资格，在8强时与劲敌真司碰头，如临大敌的两人为自身的理念进行终极决战。有史以来最长的6对6全体战展开，激战连场，最后是由小智的烈焰猴对真司的电击魔兽进行最终战，电击魔兽的“打雷”令烈焰猴倒下，正以为烈焰猴败阵之际，烈焰猴突然发动特性“猛火”，向真司展现其一直以来所付出的努力：烈焰猴的“爆炎电击”对电击魔兽的“雷光掌”，最后电击魔兽失去战斗能力，小智终于以6比5战胜真司，一雪前耻。
终于认同彼此实力、由水火不相容变为互相尊重的两人，道别后继续向前迈进。这场对战终于打破以往在城都及丰缘联盟8强止步的宿命，是有史以来首次打进前4强，也与劲敌真司了断后，于准决赛与达克多决战。在达克莱伊的“黑洞”催眠下，战况极速陷入一面倒的局面，但在蜥蜴王不懈的努力下，成功击败达克莱伊，迫使达克多首次在大会上拿出第2只宝可梦，然而达克多派出的拉帝欧斯使小智再度陷入危机，最后以皮卡丘与拉帝欧斯同时失去战斗能力结束对战，由于小智失去所有的宝可梦，达克多依旧大胜，胜负为2比6，小智惨败并4强止步。
铃兰大会最后在达克多获得优胜的结局下闭幕，小智等人离开铃兰岛、先回到位于双叶镇的小光家居留，虽然小光也有意前往关都地区，但由于卷卷耳因受邀至缘之市而无法前往。在三人想好未来的路后，小智与小刚向小光告别并在码头搭船离开，到了真新镇与尼比市的岔路口后，小智第四度与小刚道别，独自返回真新镇。
BW：合众地区
大木博士要参加一场在合众地区的学术研讨会，而他邀请小智与其母花子一同前往，在这机会下小智和皮卡丘前往新的大地，展开合众之旅，地点为合众地区名研究员-红豆杉博士所在的鹿子镇。小智也结识了新人训练家修帝，但皮卡丘在捷克罗姆影响下无法使用电系绝招，导致小智在和修帝的首次对战耻辱式落败。
其后皮卡丘恢复使用电系绝招的能力，小智和它正式出发，途中意外结识来自龙之乡的野性少女艾莉丝及她的宝可梦牙牙，两人的目的地刚好相同而一同行动。在两人到达三曜市之后，小智就立刻向道馆挑战，而遇见了道馆训练家天桐三兄弟，在小智的要求下分别于三人各打一场来进行道馆赛，最后小智以两胜一负得到第一个合众地区的徽章。而在要离开三曜市时，天桐决定要出外旅行增广见闻，后来艾莉丝与天桐正式加入小智的旅行行列，一同展开旅程。
小智取得8枚合众地区的道馆徽章，因合众联盟时间未到，小智决定为在合众联盟夺冠而进行修练，然而就在想不到修行地点时巧遇神奥联盟的冠军竹兰，得知了即将在东合众举办的宝可梦世界锦标赛青少年杯，而优胜者能得到与合众联盟的冠军阿戴克对战的权利。听到这项消息的小智等人决议参赛，与竹兰一同前往东合众，在竹兰的别墅中与小光意外重逢，原来她为观光而与竹兰一同来到合众地方，同时也为参加青少年杯而到东合众。在将艾莉丝与天桐介绍给小光认识后，四人就一起为优胜而修行。
小智在青少年杯一路晋级到决赛，以炒炒猪对上修帝的君主蛇，虽占了属性优势，但在君主蛇无与伦比的速度与力量下又一次战败，同时修帝也终于能跟梦寐以求的阿戴克对战，在决战上他以最强大的君主蛇迎战阿戴克的爆爆头水牛，虽然很努力地迎战，但是却被爆爆头水牛一击击败。青少年杯结束后，小光为参加在城都地方举办的米可利杯而与小智等人再度告别，而小智也为参加合众联盟准备前往桧垣市。
在桧垣市与各个立志参加合众联盟的劲敌们齐聚一堂，还再遇在青少年杯结束后才迟到出现、个性糊涂脱线的训练家虎彻，在急忙地把忘了登记的他拉去登记参赛后，一行人期待已久的桧垣大会便在翌日开幕。小智于预赛第一轮便对上劲敌修帝，以皮卡丘迎战修帝最强大的的君主蛇，一番激战的最后皮卡丘终于击败君主蛇，小智总算复仇成功，战胜了一直以来多次击败自己的修帝。
随后小智在16强赛事亦击败另一劲敌肯尼洋，后在8强赛事对上虎彻，但没想到平时善忘、冒失的他，实力却是意外惊人，轻敌的小智刚开局便因为他作为秘密武器的三头龙猛烈进攻下陷入苦战，迅速失去两只宝可梦，虽然小智以炒炒猪打败三头龙后一度抢回主导，但是虎彻的第5只宝可梦（因为虎彻记错全体战的数量，所以这也是他的最后一只）利欧路的强大实力，再加上利欧路突然进化成路卡利欧，使局面再度逆转。在轰隆雉鸡与藤藤蛇被击败后，陷入出局边缘的小智只好用体力透支的皮卡丘孤注一掷，双方进行了一番激烈的对战，最后路卡利欧的“波导弹”突破皮卡丘的“电球”，皮卡丘不支倒地而失去战斗能力，小智以5比6大败，第三次8强止步。另外，虽然虎彻打败小智进入前四强，可惜他的路卡利欧却不敌巴吉尔的火伊布，最终4强止步。
桧垣大会最后在巴吉尔获得优胜的结局下闭幕，劲敌们一个个为了下个目标而相继离开了桧垣市。曲终人散后，一脸迷惘的小智独自走到寂静无人的比赛场馆中，回想在合众地区旅行的经历，思考到自己旅行多时究竟付出了多少、得到了什么。他在日出中下定决心，朝下个旅程前进，没有让联盟的失败把自己击溃。
隔天，小智一行人先回到红豆杉研究所，报告本次旅行状况，并商讨接下来的旅行目标，三人皆认为自己的目标尚未达成，决议要继续留在合众地区一同旅行；同时红豆杉博士的爸爸传来消息，说在雪花市附近的龙螺旋之塔区域深处发现了与传说宝可梦莱希拉姆有关的白色遗迹，三人立刻燃起浓厚的兴趣，代替忙于研究的红豆杉博士搭上前往桧扇市的船，以此作为继续留在合众地区的目的，再一次踏上旅程。期间遇见等离子团首领魁奇思的养子N，亦要面对等离子团的来袭。同时喷火龙受训完毕、强势回归。虽然等离子团的强大火力仍然把小智等人与N重重包围，不过在小智与N两人锲而不舍的努力下，成功粉碎等离子团的阴谋。
BW：杰可罗拉群岛
等离子团全体被逮捕后，小智一行人再度回到红豆杉研究所，小智决定返回真新镇，而艾莉丝与天桐也立即表示有意前往关都地区，同时红豆杉博士也向三人道出著名观光旅游胜地－杰可罗拉群岛的存在，接着三人就在红豆杉博士的建议下一同搭上行经杰可罗拉群岛、开往关都地区的豪华邮轮，正式告别离开了合众地区。途中与来自卡洛斯地区的记者三色堇结识，由于她的目的地也是关都地区，三人就让她跟着一起旅行，形成四人同行的杰可罗拉群岛之旅。
旅程结束，到达枯叶市后第一次远离家乡的艾莉丝与天桐难掩兴奋之情，艾莉丝马上就迫不及待地想前往烟墨市向小桩挑战，而天桐则想要到丰缘地区武斗岛上的武斗镇参加哈奇老人举办的钓鱼比赛，然后三色堇建议两人可在有火车站的金黄市搭车过去，看着两人已经决定接下来的目的地，小智虽然有着些微的感叹，但还是前去金黄市为他们送行。离别的时候到了，在开往满金市的月台上三人坦言对至今的旅程感到非常满意，接着艾莉丝与天桐的身影就随着列车渐渐远离了，小智回想着三人一路走来的各种回忆，随后就与三色堇往真新镇的方向踏上了归途。
回到真新镇后小智先到家中与妈妈重逢，尔后随即前往大木研究所，集结在合众地区一同旅行的宝可梦们，对它们一路的陪伴感到由衷的感谢，想到至今结识的每个人现在都正在朝自己的梦想努力，小智也决定继续向下一个目标前进。隔天，小智带着皮卡丘跟着三色堇搭乘前往卡洛斯地区的飞机，展开全新的冒险。
XY：卡洛斯地区
抵达密阿雷市后，小智告别三色堇，立刻前往密阿雷道馆挑战，但因为持有的卡洛斯道馆徽章不足4枚而被驱逐，不过也因而认识了希特隆与柚丽嘉。彼此介绍后小智随即向希特隆挑战，正当两人正打得精彩时遭到火箭队突袭，在果然翁的绝招“镜子外衣”和“返拳”把一切攻击反射下陷入苦战，后在突然出现的初始宝可梦呱呱泡蛙拔刀相助后将火箭队击退，但呱呱泡蛙被反射的电击系招式击中而受到重创，小智三人立刻带着呱呱泡蛙前往布拉塔诺博士的研究所抢救。
在确认呱呱泡蛙脱离危险后，布拉塔诺博士向小智等人介绍他正在研究的“超进化”，然而却被火箭队听到。动起贪念的火箭队计划捕捉研究所的宝可梦，但捕捉用的装置却使研究所中的烈咬陆鲨发狂，开始失控地四处破坏，小智三人与呱呱泡蛙立刻赶了过去。在棱镜塔上小智与烈咬陆鲨对峙，就在很不容易把装置拿下时，皮卡丘却失足堕下，而小智竟也再次舍身相救，从塔上一跃而下??
奇迹获救的小智在事后从布拉塔诺博士得到卡洛斯地区的新图鉴，而呱呱泡蛙也决意跟随小智。于是他就带着新伙伴在希特隆的带领下前去宝可梦中心登记参与卡洛斯联盟。登记完后希特隆与柚丽嘉表明想跟小智一同旅行的意愿，于是三人就正式结伴踏上旅程。小智到达白檀市后，终于遇上三色堇的妹妹紫罗兰，展开他在卡洛斯地区的首场正式道馆赛，但紫罗兰惊人多变的战略让小智轻易地陷入劣势，令小智的皮卡丘与小箭雀先后失去战斗能力，导致小智在白檀道馆赛惨败。
正当他为如何克服种种始料不及的战术而费煞思量之时，一位名为莎莉娜的少女拿着小智遗下在道馆的背包，出现在他的眼前。莎莉娜说出自己儿时参加过大木博士在真新镇举办的宝可梦夏令营，与小智曾见过面，但小智似乎忘记了这回事。对此莎莉娜虽然感到些微挫折，不过她马上就鼓励小智，希望他成功打赢道馆赛。
之后在三色堇与希特隆的协助下，小智完成了对抗紫罗兰战术的特训而成功战胜了紫罗兰，获得他在卡洛斯联盟的第一个徽章。在告别三色堇姊妹后，莎莉娜接受小智邀请加入小智一行人，成为小智的同伴。
获得八个徽章后，小智一行人回到旅程最初的起点－密阿雷市参加卡洛斯联盟，小智在第一场比赛打败阿志，八强打败绚香后，在四强与翔太对战，经过一番激战之后，小智版甲贺忍蛙打败翔太的超级蜥蜴王，小智以6比5的战绩战胜翔太，晋级决赛，与能力未知的强敌艾岚对战，这也是小智的巅峰决战。最后艾岚的超级喷火龙X打败小智版甲贺忍蛙，成为联盟冠军，密阿雷大会就在艾岚获得优胜的结局下闭幕。
不料就在闭幕后没多久，闪焰队首领弗拉达利已经开始行动，利用Z2的力量大肆破坏密阿雷市，还企图要利用在特别篇最强超进化第三章收集到的传说中的巨石并跟日晷合体，消灭全世界，最后在小智一行人、艾岚与玛农、布拉塔诺博士、大吾、帕琦拉、火焰鸡假面、冠军卡露乃、武藏与小次郎的火箭队和卡洛斯其他道馆训练家所组成之大阵仗队伍的联合攻击下，成功粉碎弗拉达利的阴谋。
闪焰队瓦解后，小智一行人继续在位于密阿雷市的希特隆家居留，由于希特隆所创造的道馆训练家机器人－希特洛伊特在与闪焰队的战役中牺牲，虽然后来维修完毕，不过也让希特隆决定恢复密阿雷道馆训练家的身份。另一方面，莎莉娜在看着希特隆决定好下一步之后，一直无法替自己决定下一步，这时小智突然要求进行一场对战，并牵着莎莉娜一路跑到竞技场（此为小智与希特隆首次对战的场地），接着莎莉娜在与小智展开没有胜负的对战后，找到了全新的目标－前往丰缘地区参加华丽大赛，从表演家转为协调训练家发展。过没几天一行人再度遇见了艾岚、玛农与布拉塔诺博士，令人惊讶的是艾岚已将弗拉达利给予的超进化环作为事件的参考而上交给警方，并决定靠自己的力量寻找，以便舍弃过去，从零开始。
道别了艾岚三人，一行人就此动身前往机场，莎莉娜准备搭手扶梯前往拉帝亚斯H71班机的登机口，突然回头亲吻了小智，后面小智在机场内部的竞技场与希特隆展开没有胜负的对战后，于黄昏的夕阳下搭机离去，往真新镇的方向踏上了归途。最后小智在月亮照耀的夜晚回到家中。
SM：阿罗拉地区
由于小智的宝可梦—魔墙人偶抽中了大奖，使得母子俩来到了阿罗拉地区游玩（出发前夕先从大木研究所拿到一颗宝可梦之蛋）。而小智在游玩途中的因缘际会下来到了宝可梦学校，同时结识大木博士的堂哥兼宝可梦学校校长－成也?大木（其实母子俩来到此地的目标还有一个，就是将大木博士所给的宝可梦之蛋交给他），接着在当地学生玛奥的带领下结识阿罗拉地区名研究员兼宝可梦学校班主任－库库伊博士，并在另一场因缘际会下结识其他五位同学－莉莉艾 玛奥 卡奇 水莲 马玛内。
晚上与妈妈在某座高级餐厅吃晚餐时，见到了西北方岛屿－美乐美乐岛的守护神卡璞·鸣鸣，并接受祂所赐予的Z手环和电Z。接着就这样留下来了，当然其母也早就料到会这样，因此先早一步回去真新镇，小智的上学生活即在此刻正式展开。
旅途：所有地区（含伽勒尔地区）
为庆祝樱木研究所成立，小智受到大木博士的邀请前往枯叶市，在过程中洛奇亚突然在枯叶市港口现身，骑在洛奇亚背上小智与小豪相识并结为好友，樱木博士也聘请小智与小豪担任调查员，两人的冒险故事即在此刻正式展开。
东叶月(東 葉月，声：岩田由贵)
女主角，一直和初美生活在一起。虽然和初美不是亲姐妹，但是形同亲姐妹一般。喜欢初美。因初美在她16岁生日消失后，一心想找到她，因此在各个世界旅游。具有很强的战斗力。
海野凪(海野 凪，うみの なぎ，声：内田雄马(宣传影片) / 石川界人(动画))
本作男主角，就读于私立目黑川学院高中二年级，16岁。16年前发生在医院“孩子抱错事件”中的当事人之一，生日与绘里香一样是4月6日。性格早熟不太活泼，是全校年级第2名的高材生。受家里的成长环境影响，很会打架擅长用功念书与厨艺等家务。非常害怕会爬行的小动物或虫子，也不擅长钓鱼。但待人处事亦非常认真积极，兴趣是观星。
与亲生父母见面后被安排了与绘里香的亲事，认为不该由父母擅自摆弄命运决定要自己去突破，但仍然在两方双亲的积极安排下，与绘里香很快就同居。打算向暗恋许久的濑川告白，给自己订立了目标“只要考试成绩拿到年级第1名就要告白”，却在终于考试夺冠当天，得知了濑川另有婚约对象的事情。但凪不愿就此放弃，在濑川说出希望他能改变自己命运的要求后，积极的用功念书希望能得到认同。与绘里香同居之后也渐生情愫，一次因为两人在床上的合照意外流出的关系使绘里香被迫转学到同一班上，让凪认为自己该负点责任，约好不要把两人有婚约而且还同居的事情给班上知道。随着小幸也搬进来一起同居后，对小幸的看法被绘里香提醒，由兄妹关系逐渐起了变化。
在夏日庆典上因为和绘里香分别在不同时间点对濑川介绍小幸是自己的妹妹，而让他与绘里香有婚约的事情意外曝光给了濑川知道，其后取得了濑川的谅解。知道绘里香想要传达自己生活近况的对象就是哥哥宗助后，对生父竟对儿子不闻不问的事情表达抗议，却被生父强硬地以“如果凪不愿听从他的安排，就直接去和小幸结婚”的话语给堵了回去。之后决定帮绘里香找到哥哥。与众女生相处后，对自己真正到底喜欢谁产生了疑惑，逐渐陷入了左右为难的漩涡。
古见硝子(古見 硝子(こみ しょうこ)，Komi Shoko，声：古贺葵)
本作主人公。私立伊旦高中1年1班(故事开始时)→2年1班(130话起)。超级美少女，品学兼优，运动神经出众，料理技术纯熟。患有交流障碍症而不敢与人说话，愿望是交到100个朋友，第一次与只野仁人沟通是写在黑板上，之后与任何人沟通都是写在纸上，但可以透过手机跟人说话。喜欢只野仁人。
视力1.5，身高168，体重48，座高82。生日12月25日，在生日前一天由只野提议大家集资送她一只价值8000元、160公分高的大黑猫布偶。喜欢猫，不过到了猫咖啡厅，除猫老大“巧克力(しょこら)”之外，所有的猫看到她都躲起来。有点怕高[，很怕打雷与停电，曾吓得缩在被子里，并请只野透过电话跟她聊天。
中学时期因无法与人沟通，也无法与同学分组，所以逃避了修学旅行。进入高中后，忆起此景而对修学旅行感到不安，幸得只野宽慰才鼓起勇气参加。修学旅行时被加藤三九二与佐佐木彩美逼问喜欢的人是谁时，在纸上写了一个“H”(仁人的罗马拼音是Hitohito)，两人随即在回程时制造她与只野的独处机会。
新年时穿着和服与祖母及堂妹一起到神社参拜，因实在出尘脱俗，而被其他参拜客奉若神明。又因神社的巫女缺人手，而被请求救急，意外发现井中乃来子也是打工巫女。
看见只野与片居交换便当里的饭菜、只野收到片居送出的巧克力之类的情况时会感到心情复杂。情人节当天在学校未能送出巧克力给只野，放学后交资料给他时终于鼓起勇气送出。